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专家访谈
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准确捕捉肿瘤异质性！北京大学第一医院等单位合作发文：构建多区域乳腺癌PDO生物库
7月20日，北京大学第一医院/天津医科大学肿瘤医院/河北医科大学第四医院研究团队合作共同在期刊《Advanced Science》上发表了研究论文，题为“Multi-regional Organoid Biobank Reveals FAK-ACSL1-Driven Doxorubicin-Resistance and Predictive Biomarkers in Breast Canc...
重磅综述！罗阳/许大千/向廷秀团队系统阐述肿瘤异质性：发展、机制与治疗启示，一个动态演化的生态系统
近日，重庆大学医学院罗阳、浙江大学附属第一医院许大千、重庆大学附属肿瘤医院向廷秀团队团队在国际知名期刊《Signal Transduction and Targeted Therapy》（IF：81.2）发表了一篇题为“Tumor heterogeneity: development, mechanisms, and therapeutic implications”的重磅综述文章：系统梳理...
重磅研究！中国科学技术大学翁建平/郑雪瑛/岳童团队多组学揭示1型糖尿病年龄相关内型中的微生物群、代谢物和免疫学异质性
近日，中国科学技术大学翁建平/郑雪瑛/岳童团队在国际知名期刊《Signal Transduction and Targeted Therapy》（IF:81.2）发表一项重要研究成果：通过整合肠道微生物组、血清代谢组、脂质组和外周免疫单细胞转录组的多组学分析，首次系统描绘了儿童1型糖尿病（T1D）不同发病年龄内型的分子特征图谱，为精准干预提供了潜在靶点。 图形摘...
Cancer Cell | 多组学深度解码淋巴瘤异质性，蛋白质基因组学分型揭示高危新亚型与治疗新靶点
近日，一项发表于国际权威期刊《Cancer Cell》的重磅研究，首次通过整合基因组、转录组和蛋白质组数据，为弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）定义了七种分子特征迥异的“蛋白质基因型”（ PGs）。这项研究不仅跨越了传统的细胞起源和遗传亚型分类边界，更重要的是，成功鉴定出一个与极差预后相关的全新高风险亚型——PG4，为这一高度异质性肿瘤的精准诊疗开辟了新路径。 ...
肠道菌群如何影响疾病治疗？李华婷/陈洛南/倪岳琼/曾嵘/贾伟平团队揭示肠道菌群在抗性淀粉干预相关肝病疗效异质性中的核心作用
近年来，代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）的全球患病率持续攀升，但针对其的精准治疗策略仍面临挑战。抗性淀粉（RS）作为益生元的一种，在改善MASLD中显示出潜力，但其疗效存在显著个体差异。 近日，上海交通大学医学院附属第六人民医院李华婷教授、上海交通大学数学科学学院/人工智能学院陈洛南教授、上海交通大学医学院附属第六人民医院倪岳琼教授、上海科技大学曾嵘教授和上海交通大学医学...
性能显著提升！刘肇祺/王培卓团队开发新型计算框架单细胞水平解码RNA剪接异质性，精准识别肿瘤潜在耐药细胞
10月27日，国家生物信息中心刘肇祺&西安电子科技大学王培卓团队在国际知名学术期刊《Nature Communications》发表了一项突破性成果：研究人员开发了名为SCSES（Single-Cell Splicing EStimation）的新型计算框架，实现单细胞水平下RNA可变剪接的高精度解析，解决了长期困扰学界的单细胞剪接分析噪声大、准确性低等难题。该工具不仅能检测到传统方法遗漏的...
克服肿瘤内异质性！中山大学发文：有前景的靶向癌症新途径
近日，中山大学研究团队在期刊《Nature Communications》上发表了研究论文，题为“Reprogramming the tumor microenvironment with c-MYC-based gene circuit platform to enhance specific cancer immunotherapy”，本研究中，研究人员开发了一种基于 c-MYC 的传感...
胃癌异质性新发现！上海交通大学发文：提高胃癌免疫治疗效果的新靶点
4月28日，上海交通大学研究团队在期刊《Clinical And Translational Medicine》上发表了研究论文，题为“Deciphering of intra-tumoural heterogeneity and the interplay between metastasis-associated meta-program and myofibroblasts in ga...
“鸡尾酒”疗法！山大齐鲁医学院发文：治疗异质性实体肿瘤的潜在方法
3月20日，山东大学齐鲁医学院研究人员在期刊《Advanced Science》上发表了研究论文，题为“Rational Design and Organoid-Based Evaluation of a Cocktail CAR-γδ T Cell Therapy for Heterogeneous Glioblastoma”，本研究中，研究人员设计了一种多步骤策略并开发了一种优化的工程化...
【Cancer Cell】复旦大学研究团队：小细胞肺癌空间分子异质性及免疫互作生态位
2月20日，来自复旦大学的研究团队在《Cancer Cell》发表题为”Integrative Spatial Analysis Reveals Tumor Heterogeneity and Immune Colony Niche Related to Clinical-outcomes in Small Cell Lung Cancer”的论文。该研究通过整合空间多组学（CODEX、Co...
【Science子刊】液体活检技术的飞跃：约翰霍普金斯大学的DNA甲基化异质性数字分析
2024年11月22日，美国约翰霍普金斯大学生物工程系Wang Tza-Huei教授团队在期刊《Science Advances》上发表了题为“Multiplex digital profiling of DNA methylation heterogeneity for sensitive and cost-effective cancer detection in low-volume ...
【Adv. Sci.】最新！复旦大学等合作发现癌症微环境中的细胞异质性
3月14日，复旦大学王建华、叶定伟、朱耀和上海交通大学张敏共同通讯在期刊《ADVANCED SCIENCE》上在线发表题为“Integration Analysis of Single-Cell Multi-Omics Reveals Prostate Cancer Heterogeneity”的研究论文，本研究在单细胞分辨率下，在阶段特异性前列腺癌微环境中描绘了细胞异质性，揭示了它们与疾病...
【Genome Med】浙大学者研究发现携带抑癌基因突变的小eccDNA推动小鼠肝癌模型肿瘤内异质性演化
近日，浙江大学医学院附属邵逸夫医院/浙江大学转化医学研究院谢安勇课题组和浙江大学医学院附属邵逸夫医院林辉课题组联合浙江大学转化医学研究院刘鹏渊课题组在《Genome Medicine》发表论文“Small extrachromosomal circular DNA harboring targeted tumor suppressor gene mutations supports intr...
异质性批量肿瘤样本中的克隆和单倍型特异性拷贝数变异推断
通过全基因组纳米孔测序，表征异质性肿瘤中的单倍型特异性大规模拷贝数变异(CNV)和新型低/高甲基化。 癌症进程中基因组变异的累积 图1 癌细胞克隆进展和体细胞突变累积的图示 癌症疾病很复杂，可视为一种体细胞进化过程，伴随克隆细胞增殖和克隆清除（驱动因素是有益于生存/逃逸的基因组突变发生累积），同时选择性压力不断变化（图1a）。在癌症进...
最新！北京大学汤富酬等团队合作通过单细胞测序技术揭示了胃癌瘤内异质性的分子特征
4月11日，北京大学汤富酬及Xin Zhou在《National Science Review》发表了题为“Integrative single-cell multiomics analyses dissect molecular signatures of intratumoral heterogeneities and differentiation states of human ga...
最新！浙江大学李兰娟等团队合作发现调控异质性巨噬细胞以促进肝细胞癌免疫治疗的方法
近日，浙江大学李兰娟及Lu Juan共同在《Advanced Science》发表题为“Effects of 3-HAA on HCC by Regulating the Heterogeneous Macrophages—A scRNA-Seq Analysis”的研究论文，研究揭示了HCC中免疫细胞亚群对3-HAA的应答情况，表明3-HAA可能是HCC的一个潜在治疗靶点。 ...
【Nature子刊】汤富酬/王洁团队通过单细胞转录组谱揭示了小细胞肺癌的肿瘤异质性
10月5日，北京大学生命科学学院汤富酬教授团队与中国医学科学院王洁教授团队在Signal Transduction and Targeted Therapy上联合发表了题为“Single-cell transcriptomic profiling reveals the tumor heterogeneity of small-cell lung cancer”的研究论文。该研究对原发性肿瘤（PT...
【Nature】单细胞分子图谱，揭秘微生物群对癌症空间和细胞异质性的作用！
导读：肿瘤相关菌群是人类癌症类型肿瘤微环境的固有组成部分。迄今为止，肿瘤内宿主-微生物群的研究主要依赖于bulk组织分析，模糊了肿瘤内微生物群的空间分布和局部效应。最近，有研究团队使用原位空间谱分析技术和单细胞RNA测序，揭示了宿主-微生物在空间、细胞和分子上的相互作用。 2022年11月16日，弗雷德·哈钦森癌症中心的Susan Bullman等人在Nature发表了题为“Effect o...
【Nature子刊】华西医院罗晗等使用泛癌单细胞分析揭示了肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞的异质性和可塑性
2022年11月4日，四川大学华西医院罗晗、许恒团队与韩国光州科学技术学院Jihwan Park团队在Nature Communications上联合发表了题为“Pan-cancer single-cell analysis reveals the heterogeneity and plasticity of cancer-associated fibroblasts in the tumor ...
Nature背靠背：多维度理解大肠癌肿瘤异质性，提供治疗新视角
肿瘤内异质性是恶性肿瘤的基本特征之一，影响肿瘤的诊断和治疗。由肿瘤内异质性推动的克隆进化（clonal evolution）推动了肿瘤的发生发展和治疗耐药性。然而，对于结直肠恶性肿瘤的遗传进化及肿瘤内异质性，目前仍知之甚少。值得注意的是，紧靠DNA突变并不能完全解释肿瘤的恶性转化；表观遗传变化也会导致癌细胞之间的表型变异——遗传、表观遗传的变异及转录可塑性均影响着肿瘤内异质性。探索这些生物学...