《转》访上海交通大学医学院附属仁济医院康晓楠教授:智链生命--中国生物样本库的范式跃迁与生态重构
| 导读 | 未来,样本库将是“数字平台+模型平台”的结合体,极大加速药物研发和疾病机理研究。 |
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在很长一段时间里,生物样本库被误解为医院角落里的一排排冰箱,是临床科研的“后勤仓库”。然而,随着精准医疗和人工智能的爆发,样本库正迅速演变为驱动医学创新的“核心引擎”。
近日,转化医学网走进上海交通大学医学院附属仁济医院,专访生物样本库康晓楠主任,她是一位在生物样本库领域深耕十余年的专家。她从2013年医院样本库尚属空白时起步,见证了国内行业从无序到合规、从标准化到智能化的完整演进。她不仅主导建立了院级高标准样本库,更深度参与了国家生物样本国际标准的制定与转化。
在本次访谈中,她将分享如何打破科室壁垒构建专病资源平台,如何看待AI时代样本库的形态重塑,以及在中国特有的医疗体制下,如何破解医院与企业、数据与共享之间的深度合作。
问
康主任您好!仁济医院生物样本库作为国内较早建立的样本库之一,能否请您谈谈"仁济模式"的核心特色?
答
感谢转化医学网。仁济医院样本库始建于2008年,2013年正式建库,2020年扩建至东院科研楼1500平米,总库容达600-800万份。我们的核心特色是"以患者为中心、临床问题为驱动、科研项目为导向"——不是为存而存,而是围绕临床实际需求来规划和建设。
2013年的时候,样本库这个概念还非常新 。在此之前,很多临床医生觉得样本库就是科室里放个冰箱,存点东西就行,没必要搞那么复杂,而且投入代价很大,国家也没有相关法规。
我在国外做过肿瘤转化研究,深切感受到欧洲样本库在规范性和溯源性上的优势。回国后,我们决定从零开始,跟着行业的发展节奏,一点点把体系、标准和转化机制建起来。
这十几年,行业大致经历了多个阶段:最初是合规合法,2019年遗传资源立法是一个里程碑;接着是标准化,我们采用了ISO国际标准,并建立了专病数据和样本的标准体系;然后是共享,虽然目前仍有壁垒;现在进入了智能化阶段,特别是2022年AI元年以来,大数据和人工智能技术正在深刻改变样本库的管理和应用模式。
问
很多医院在建设样本库时面临“投入大、见效慢”的困境。您所在的医院是如何支持这一长期建设的?团队架构有何特点?
答
确实,样本库建设是“一把手工程”,如果没有院领导的长远眼光和支持,很难坚持下来。我们医院历任领导都很有前瞻性,愿意为平台做长远打算。比如在新大楼建设中,医院专门拿出了两层楼面给我们,采光和环境都非常好,这在很多医院是难以想象的。
在团队方面,样本库是一个高度交叉的学科。我们目前有九个人,还在持续增加,今年新招了纯生信和统计学背景的人员 。因为单纯靠传统医学背景不够,必须补齐交叉学科的资源,才能应对大数据和智能化的需求。
问
您提到以“专病”为抓手建立标准,这与传统的样本收集方式有何不同?为什么要强调临床数据的融合?
答
传统观念里,建库就是收样本。但我们一开始就明确,必须以疾病专科要解决的问题为导向。自2014年起,我们联合临床科室以专病为抓手制定首个《风湿科自身免疫性疾病样本与数据采集标准》,并参与国际标准ISO 20387的等同采用工作,形成样本与数据双标准体系。
我们要给临床医生传递一个理念:建库不是为了提供一个冰箱,而是为了从头规划学科的发展。只有诊疗规范、数据高质量,科研才可能有产出。医、教、研是一体化的,只有“医”做好了,后面的教学和科研才有基础。
问
当前AI技术飞速发展,您理想中的未来样本库是什么样子的?
答
我画过一个从传统到未来的演进图。传统样本库是一管管的血尿便;中间阶段融合了组学数据;而理想的未来样本库是一个数字化平台。
在这个平台上,使用者可以通过便捷的界面检索所需的样本和数据,直接进行分析,甚至将自己的实验数据上传验证。它就像身边的一个工具,融入研究的每一个环节。
同时,实体样本始终不可或缺,因为新技术会不断产生新数据。此外,我们会大力发展活性模型,如类器官、器官芯片等。未来,样本库将是“数字平台+模型平台”的结合体,极大加速药物研发和疾病机理研究。
随着人工智能兴起(以ChatGPT为代表),临床数据开始嵌入DeepSeek等AI工具,推动样本库向智能化演进。当前行业趋势为"合规→标准→共享→智能化",新书《智能化生物样本库》即将出版,书中将系统阐述智能建设、管理与应用。
问
样本库“数据共享”和“院企合作”仍是行业痛点。当前国家层面样本资源整合面临哪些挑战?
答
目前样本库数据的确存在“共享难”的挑战,国家层面的统筹尚未成熟。对于药企合作,痛点也很明显。一是伦理与合规,涉及人类遗传资源出境或外资背景时,医院非常谨慎;二是财务路径,医院很难通过合规渠道收取合作费用;三是信任与安全,医院担心数据泄露或被第三方滥用。
过去,唯一的合法路径是签订横向合作协议,但成功率不高。不过,这一局面正在改变:2026年8月上海已设立市级生物样本库用户委员会,作为官方协调机制统筹共享需求;同年5月国家发布的人遗细则征求意见稿,将“外方单位”认定标准从“实际控制”收紧为仅看持股50%以上,采集许可门槛从3000例上调至10000例,国际合作备案有望实现“同日确认”,合规路径正在拓宽。我们正在探索新的共享机制,试图在不涉及深度合作的情况下,通过其他补偿方式实现样本和数据的有限共享。但从根本上说,这需要国家像推进重大工程一样,指派医院、科技公司和药企集成作战,优中选优,形成国家级战略项目。
【结语】
生物样本库的建设是一场漫长的“燕子筑巢”式的修行,考这验的不仅是技术能力,更是管理者的远见与定力。仁济医院"自下而上"的实践路径与"四大模块"的前瞻布局,为行业提供了宝贵经验。十二年的坚守证明,只有当我们将样本视为承载生命信息的数字资产,而非冰冷的生物材料时,转化医学的真正价值才会显现。
面对未来,我们期待看到的不仅是一个个孤立的顶级库,而是一个由集体推动、多方协同、数据互通的开放生态。正如康教授所言,“因为相信,所以看到”。在通往精准医疗的道路上,每一份被妥善保存的样本,都是通向未来治愈可能的一块基石。
康晓楠 教授
上海交通大学医学院附属仁济医院临床生物资源中心主任
现任全国生物样本标准化技术委员会委员、中国抗癌协会肿瘤整合样本分会副主任委员、中国医药生物技术协会组织生物样本库分会常委、中国研究型医院学会临床数据与样本资源库专业委员会常委,中国合格评定国家认可委员会(CNAS)技术评审员等学术任职。
长期深耕生物样本资源整合、样本全链条质控体系建设及肿瘤生物标志物转化研究。主持参与国家级、省部级课题16项,制修定生物样本相关国标、团标15项。
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