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miRNA测序在非编码RNA研究中的应用案例
研究背景 雷特氏综合征(Rett syndrome)是一种严重影响儿童精神运动发育的神经发育性疾病。甲基化-CpG结合蛋白2(MeCP2)基因功能的缺失会导致该病的发生[1,2]。反之,MeCP2基因拷贝数的增多则会导致自闭症(Autism spectrum disorders)的产生[3]。因此,可以说MeCP2蛋白的剂量效应对中枢神经系统(Central ner...
"癌症免疫疗法"是否能取得突破?医药巨头罕见联手
三家医药巨头加入了一项名为CAncer Moonshot 2020的创新项目,联合研发多项药物结合的“免疫疗法”,该项目将可以使用来自三家医药巨头超过60多种抗癌药物,致力于在2020年时完成对2万病人的临床试验。这一项目或为癌症治疗带来重大突破。 Cancer Moonshot 2020项目的联盟中包括了美国安进公司(AmGE...
lncRNA测序在非编码RNA研究中的应用案例
在过去几年中,高通量转录组测序(High-throughput transcriptome sequencing)最大的发现之一莫过于在哺乳动物基因组中发现了一些功能各不相同的RNA[1]。除去那些由于转录起始位点(Transcriptional start sites)的改变以及终止子(Ternination)和可变剪切(Splicing)的变化之外,另一些新的反向...
Circular RNAs功能机制研究
circRNA是一类具有调控基因表达潜能的非编码环状闭合RNA。随着NGS的发展及生物信息分析的进步,现在已经发现在动物细胞中,存在着成千上万的circRNAs。而对其功能的研究发现也表明,circRNA可以作为microRNA的海绵吸附体而影响下游靶基因的表达,是一种典型的ceRNA作用机制。另外, 由于circRNA与其相同来源的线性mRNA的序列...
ceRNA研究策略解析
ceRNA是一类通过竞争性结合microRNA来影响microRNA-RNA的转录后调控。作为一种全新的基因转录后调控机制,拓宽了我们对基因调控的进一步理解。当我们想进入这个最新的研究领域时,我们该怎么入手呢?来自宁波大学医学院的研究人员通过他们对胃癌中一个lncRNA-FER1L4的研究,为我们展示了ceRNA调控机制的研究策略。 &e...
JP摩根健康大会上,Illumina等5家基因检测公司秀什么?
JP摩根健康大会在美国旧金山召开 北美时间2016年1月11~15日,备受全球医药企业及投融资机构关注的第34届JP摩根健康大会(JP Morgan Health Conference)在旧金山举办,这是一场产业与资本融合的盛会,并将引领2016年乃至今后一段时期全球医药健康领域的发展与投资风向。如往年一般,各家公司都派出重量级阵营,公布上年...
miRNA芯片在各类样本中的应用
1.新鲜组织样本 新鲜组织一般包括以人类疾病诊断及治疗为目的,经患者或健康人同意后,从患者的机体中切取的未经特殊化学试剂处理的病变组织或相邻健康组织,或者健康人的相同部位的对照组织。这些人类疾病相关的新鲜组织样本的整理、保存、研究对于提高疾病的诊断质量、促进临床工作、探讨及研究疾病的发病机制具有重要的意义。此外,新鲜组织样本还...
mTORC2介导细胞存活/肿瘤细胞耐药的新机制
2015年10月12日,国际知名学术期刊The Journal of Cell Biology(《细胞生物学杂志》)正式发表了南方医科大学基础医学院细胞生物教研室白晓春课题组的最新研究成果“mTORC2 promotes cell survival through c-Myc-dependent up-regulation of E2F1”。 南方医科...
环状RNA(Circular RNA):noncoding RNAs的新明星分子
circRNA是一类以共价封闭环为特征,广泛存在于真核生物中的新型RNA分子。CircRNA来源于基因的外显子或者内含子区域,在哺乳动物细胞中大量存在。现有研究表明大部分的circRNA在不同物种间是保守的。同时,由于其环状结构能抵抗RNase R的降解而比较稳定。circRNA由于其表达的特异性和调控的复杂性,以及在疾病发生中的重要作用越来越受到大家的重视。就像mi...
2016,基因巨头驾临
华大基因两次登上新闻联播,释放重要信号。2015 年3 月14 日(国家基因库)与2016 年1 月8 日(华大基因研究院),华大基因两次登上新闻联播,正如央视所释放的信号,我们认为国家政策将进一步大力鼓励和支持基因测序行业在我国的发展,申万宏源医药两次独家专访,解密华大基因。 万亿级市场,基因科技技术日新月异。基因检测产业链包...
ceRNA---新的基因表达调控模式
microRNA基因调控机制是大家熟悉的基因转录后调控模式。随着现代研究的不断深入,研究人员发现基因的转录后调控并不是简单的microRNA-mRNA的沉默机制,而是一个复杂的调控网络,而内源竞争性RNA(ceRNA),拓宽了我们对基因调控的进一步理解。 ceRNA是一类通过竞争性结合microRNA来影响microRNA-R...
lncRNA可在癌症诊断与预后中作为生物标志物
癌症已经成为21世纪世界性的威胁人类健康与安全的头号杀手。2012年就有超过1200万人被确认为新的癌症患者,超过800万人因癌症而死亡[1]。为了增加对癌症发病机理的研究,癌症和肿瘤基因图谱计划(The Cancer Genome Atlas, TCGA)通过高通量测序方案对遗传学,表观遗传学以及转录变化进行了大规模研究[2,3]。然而,尽管很多证据...
港媒:中国人爱“白”因1.5万年前基因突变
香港《南华早报》1月12日文章,原题:白富美:科学家表示,中国人对白皮肤的迷恋,与1.5万年前的基因突变有关 中国科学家主导的一项国际研究表明,中国人青睐的较浅或较白肤色源自一种“有缺陷”的基因。 中国男性大都迷恋肤色白皙的女性,很多中国女性则偏爱白种人。这早已被贬斥为一种社会、经济或文化问题,但新的研究证据表明,皮...
“富矿”的开发——浅谈miRNA的研究
什么是microRNA? microRNA(microRNA)是一种小的内源性非编码RNA分子,大约由21-25个核苷酸组成。通过与靶基因的3’UTR配对,促进mRNA的降解或抑制mRNA的翻译,从而抑制靶基因的表达。 现在,miRBase(1)共收录223个物种的28645个microRNA前体...
循环肿瘤细胞CTC的相关数据,你知道多少?
随着对肿瘤研究的深入,科学家发现在癌症的诊疗中组织活检有一定的局限性,还会给患者带来创伤。液体活检的出现打破了这一僵局,并入选了MITTechnologyReview杂志“2015年度十大突破技术”。近年来对液体活检领域之CTC(循环肿瘤细胞)的研究在持续升温中。 CTC检测技术的溯源 早在1869年,Ashworth发...
云健康全球发布四款全基因组检测健康产品
2016新年伊始,作为中国精准医疗高通量测序的领先者之一,云健康基因科技有限公司,在JP摩根健康大会召开之际,于1月11日面向全球隆重推出四款其自主开发的基于全基因组测序的健康产品,为关注健康的人群提供基因大数据指导下的精准保健解决方案。 据悉,市场上虽然不乏各类基因检测产品,但基本上都是基于人的部分基因和部分位点,而基于人全...
博奥生物爱身谱®基因检测新品开启糖尿病防控精准时代
糖尿病精准防控暨爱身谱®糖尿病基因检测产品发布会现场 1月11日,由博奥生物集团有限公司暨生物芯片北京国家工程研究中心(以下简称:博奥生物)、上海市第六人民医院、上海市糖尿病研究所联合主办,博奥颐和健康科学技术(北京)有限公司(以下简称:博奥颐和)承办的糖尿病精准防控暨爱身谱®糖尿病基因检测产品发布会,于生物芯片北京...
卫生部临床检验中心《2015年新生儿遗传代谢病筛查工作统计情况调查》通知
各新生儿筛查中心及实验室: 开展新生儿疾病筛查是预防儿童病残、提高人口素质的有效措施,也是实施《中华人民共和国母婴保健法》的重要工作。卫生部已颁布《新生儿疾病筛查管理办法》(中华人民共和国卫生部令第64号),《新生儿疾病筛查管理办法》第十四条已明确规定了“新生儿遗传代谢病筛查实验室应当接受卫生部临床检验中心的质量监测和检查”。为了更好地开展新生儿遗传代...
BBC:不会得癌症的动物
癌症在动物王国里非常常见。对于许多动物来说,其死亡率和人类的差不多。 和我们生活在一起的狗和猫也会得各种不同的癌症。除此以外,二手烟更是增加了癌症的风险。 但野生动物也会得癌症。例如,许多袋獾会患有严重的脸部肿瘤,通过接触来传染给另外一个袋獾。 另外严重污染的海洋也引起类似问题...
Nature Methods:突破性单细胞表观基因组与转录组分析新技术
由英国及比利时的研究人员开发出的一种新方法,使得在单细胞中同时研究表观基因组及转录组成为可能。发布在《自然方法》(Nature Methods)上的实验方案,可帮助科学家们精确描绘出DNA甲基化改变与基因表达之间的关系。 近年来单细胞测序技术发展迅速,被广泛用于研究细胞间的基因表达谱(转录组)差异。近期的一些单细胞实验方案也使得...