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大数据-生命科学企业发展催化剂

首页 » 《转》译 2016-06-03 转化医学网 赞(4)
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导读
大数据具有周转快、总量大、种类多以及准确性高这四个主要特征。对于大数据的应用来说,除了必要的巨大数据体量之外,数据本身的不断发展变化、多维性以及实时性同样是不可或缺的。


  大数据具有周转快、总量大、种类多以及准确性高这四个主要特征。对于大数据的应用来说,除了必要的巨大数据体量之外,数据本身的不断发展变化、多维性以及实时性同样是不可或缺的。
  在生命科学方面,虽然全基因组测序的数据产出总量巨大,但这仍旧不能完全满足大数据对数据量的要求。为了满足大数据对数据总量的要求,全基因组测序必须与其他各种组学、临床数据、行为参数和环境参数结合应用。
  如果想要真正地理解大数据对于我们生活的意义,我们必须要这样问自己:大数据究竟如何提高我们的生活质量?
  数据值和价值定位
  在以色列全球著名的梯瓦制药,对大数据的应用不仅仅只表现在通过数据增强公司的社会认可,大数据更帮助梯瓦制药在全球竞争中抓住了主动优势。
  大数据的价值定位在于数据对系统性问题的纠正,基于事实的大数据可以对系统性问题作出有效的检验,满足系统中存在尚未被满足的需求。
  “在我们对亨廷顿舞蹈症等其他神经性运动障碍的研究中我们接触到了大量的病人,他们的家人以及监护人,”梯瓦制药副总经理、个性化/预测药物以及大数据分析研究室主任Iris Grossman博士说。“我们对这些病人对药物的需求进行了鉴别以及分类,使用传感器等技术描绘了他们的遗传因子及生物标记特征,同时我们对他们体内疾病相关的信号载体与受体进行了计数,进而完成对疾病治疗过程的监控。”
  “这是一种整体性的健康管控方式,”Grossman说,“病人出现症状之初的严格监管对于后期的药物治疗至关重要。而各种数据的整合分析在这一过程中对于问题的解决十分重要。”
  大数据意味着一种新的信息流动,一种更高的数据使用与分享水平。大数据的应用将促进制药企业开始运营诸如研发网络的组织机构,加强跨产业合作。
  大数据同时为每个人打开了一扇管理他们自己和家人身体健康的大门。随着数据的收集,参与大数据项目的人们必将为大数据的发展提供越来越多的根本动力。
  数据驱动科研
  价值医学观念的转变使得高成本效益疗法研发变得迫在眉睫,而研究人员可能通过大数据来缓解这种压力。如果研究人员能应用大数据研究的导出结构解决问题,那么大数据就能作为科研人员与多种研究方式的中介来提高科研效率。
  “数据更容易储存与管理,”著名设计咨询公司Berg首席分析官Slava Akmaev博士说,“数据的底线就是你具体用它来做什么。”
  Berg公司选用人类细胞和组织的体外样本作为疾病模型,进一步应用其基因组、脂类组、代谢组、蛋白组与翻译后修饰的相关信息对这些模型进行有关数据采集并通过人工智能平台Interrogative Biology完成了这些数据的分析。Berg希望具有数据整合分析功能的人工智能平台Interrogative Biology可以在癌症研究中得到应用。
  对于其人工智能平台与其他数据分析技术,Berg显得非常自信。该公司认为他们的大数据技术可以与人类疾病的生物学指标结合应用,进而提高疾病研究与治疗方法开发效率。
  数据搜索与分析
  药企需要加快新药研发数据的分析以降低新药研发成本,需要根据临床试验数据来觉得中止或继续新药研发。这一过程便涉及到了海量的数据,而大数据的搜索与分析平台正能满足药企的这种需求。
  大数据搜索和分析平台开发公司Sinequa的数据平台Sinequa ES结合了结构数据统计分析与20种主要语种的语言/语义分析,具有强大的自然语言处理(NLP)功能。该平台可为研究人员与药物研发工作者提供海量数据的深入分析。Sinequa ES平台使用结合了人工智能与机器学习的开源处理引擎Apache Spark,可以为使用者在同一个视图中提高结合了统计分析与语言/语义分析的数据分析。
  此外,大数据的搜索和分析可以为科研人员提供一种所有内部以及外部来源结构化和非结构化数据的统一分析。通过促进研发来加速创新、提高科研效率并缩短技术产品的商业化进程。目前,Sinequa的大数据搜索与分析平台已经得到了著名制药和生物技术公司阿斯利康、Biogen、百时美施贵宝等的认可,被应用于临界深度内容分析与搜索应用程序(SBAs)敏捷开发环境建设。
  投资数据管理
  近几年来,随着数据总量的爆炸增长与数据种类的不断增多,数据管理策略投入变得愈加重要。制药公司是出了名的数据密集型企业,制药公司的主要数据包括临床实验结果、结构化和非结构化电子病历、实验室检验结果以及理赔资料。基因组数据互联网/物联网数据为制药公司大数据增加了另一个维度。随着数据结构变化频率的增加,对于数据的及时解析变得更加重要。
  对于Saama的首席战略官Sagar Anisingaraju来说,解决数据挑战的关键一步是一个将不同数据进行归纳、集成至单个存储库的合理策略。Saama需要一个数据池,用来聚合、管理、清洁和应用阶段性数据。对于预测、实时和说明性的分析来说数据的集中管理不可或缺。
  Saama的生命科学产品:临床开发分析(Clinical Development Analytics,CDA) 、现实循证分析(Real World Evidence Analytics,RWEA)为相关客户带来了一种专业领域数据知识、创新技术资产和业务相关度量分析的综合服务,为客户提供了预先构建的可视化工具和应用程序,扩大技术应用范围的同时提高了研究人员的工作效率。
  CDA和RWEA让使用者可以对实验与企业运作过程做出有效管理、分析以及实验过程的信息化,利用大量的数据的同时完成对复杂数据的准确分类,提高企业在复杂监管环境中的运营管理效率。(转化医学网360zhyx.com)

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