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专家访谈
找到约107条结果 (用时0.1656秒)
重磅发布！北京大学周永胜、汤富酬、乔杰合作对人胚胎骨髓间充质干细胞进行单细胞转录组和功能分析
3月31日，北京大学周永胜、汤富酬及乔杰在《Signal Transduction and Targeted Therapy》在线发表题为“Characterization of mesenchymal stem cells in human fetal bone marrow by single-cell transcriptomic and functional analysis”的研究...
权威认证:上海欧易通过全国科研与临床实验室转录组测序检测室间质量评价
近日，国家卫生健康委临床检验中心（NCCL）公布了首次《全国科研与临床实验室转录组测序检测室间质量评价预研活动》的评价统计结果，上海欧易实验室顺利通过此次测评！此次测评结果肯定了上海欧易在转录组建库技术、生物信息分析和数据解读方面的能力。 图1 上海欧易通过转录组室间质评 转录组测序（transcriptome sequencing...
【Cell】麻省理工张锋研究：全面绘制人类所有转录因子图谱，让细胞命运调控变得可预测
近日，美国麻省理工学院张锋研究组在Cell发表了文章，创建了一个包括人类所有转录因子不同剪接形式在内的条形码库，以单细胞分辨率绘制了每个转录因子在人体胚胎干细胞中过表达的表达谱。该图谱涵盖了所有三个胚层和滋养层细胞类型生成的转录因子，并且通过开发预测与验证平台可以检测不同转录因子组合的影响。 https://www.cell.com/cell/fulltext/S0...
【Nature子刊】汤富酬/王洁团队通过单细胞转录组谱揭示了小细胞肺癌的肿瘤异质性
10月5日，北京大学生命科学学院汤富酬教授团队与中国医学科学院王洁教授团队在Signal Transduction and Targeted Therapy上联合发表了题为“Single-cell transcriptomic profiling reveals the tumor heterogeneity of small-cell lung cancer”的研究论文。该研究对原发性肿瘤（PT...
【Nature子刊】复旦/交大团队系统表征癌症转录组，促进抗癌药物发现！
2022年11月10日，上海交通大学李胜利、Liu Teng团队与复旦大学何祥火团队在Nature Communications上发表了题为“Systematic characterization of cancer transcriptome at transcript resolution”的研究论文。该研究大大扩展了癌症RNA库，并将促进抗癌药物的发现。 https://doi.org...
一年发布21篇！北大汤富酬教授团队2022年单细胞转录组测序研究综述
2022年（截止到2022年12月1日）北京大学汤富酬团队在单细胞转录组测序领域取得了一系列重大突破，共发布研究成果21项，本文对以下九项研究进行系统综述。 01 2022年1月25日，暨南大学兰雨，刘兵及北京大学汤富酬共同通讯在《Cell Research》在线发表了研究论文，研究人员在小鼠和人类胚胎中发生关键血管生成和血管生成事件的时间窗口...
【PNAS】“复旦四分型”再完善！邵志敏教授团队绘制最毒乳腺癌“肿瘤特异性转录本”图谱
RNA是细胞传递基因信息的重要“信使”，一旦细胞发生癌变，便很有可能产生异于常态的RNA，即“肿瘤特异性转录本”。近日，复旦大学附属肿瘤医院邵志敏教授、江一舟教授团队携手黄胜林教授团队，发现在三阴性乳腺癌的细胞中存在大量“肿瘤特异性转录本”，并据此成功绘制出目前世界首个三阴性乳腺癌“肿瘤特异性转录本”图谱。该项研究成果11月8日在线发表于国际权威期刊《Proceedings of the N...
【Nature子刊】浙江大学范骁辉教授团队报道首个可将传统转录组测序数据重构至单细胞空间分辨率的方法
2022年10月30日，浙江大学药学院范骁辉教授团队联合计算机科学与技术学院陈华钧教授团队和军事医学科学院高月教授团队在《Nature Communications》上发表了研究论文。研究提出了一种空间解卷积算法—Bulk2Space，首次实现将Bulk转录组重构至单细胞空间分辨率。 https://www.nature.com/articles/s41467-02...
【Science】西湖大学朱听课题组历经六年终实现“镜像”T7转录，或可用于诊断治疗等领域！
2022年10月27日，清华大学/西湖大学朱听团队在《Science》在线发表了研究论文，该研究用化学方法合成了一个100千尔顿的镜像T7 RNA聚合酶，使酶组装的长镜像基因的全长镜像5S、16S和23S核糖体RNA能够高效、忠实地转录。 https://www.science.org/doi/10.1126/science.abm0646 过往研究回顾...
【今日直播】基于纳米孔测序平台的单细胞全长转录组——应用和实践
对单个细胞进行基因组和转录组异质性分析为许多研究领域（包括癌症研究、细胞发育和功能以及免疫学）提供了新见解。但使用传统的短读长测序技术时，单细胞测定存在局限性；例如，在转录组研究中，无法在异构体方面确定转录本丰度。长读长纳米孔测序解决了这些挑战，可以在单条读长中对全长转录本和大基因组区域进行端到端的测序，并覆盖重复区域和结构变异。 12月1日，我们邀请...
【PNAS】清华陈默课题组：白血病关键转录复合物的组成机制及治疗新靶点
尽管多个证据表明LYL1在急性髓系白血病中的生物学重要性，但LYL1如何与AE协同调控基因表达并不清楚。清华大学医学院陈默研究员课题组发现LYL1在AETFC的组装和转录激活功能实现中具有重要作用。该团队研究成果发表于《Proceedings of the National Academy of Sciences》。 https://www.pnas.org/doi...
连发四篇，IF值累计超200！复旦徐彦辉团队在人源转录起始机制研究方面取得重大突破
自2020年起，复旦大学附属肿瘤医院徐彦辉团队连续发表四篇研究论文，围绕人源转录起始机制研究取得了系列重要突破，部分成果入选2021年度中国生命科学十大进展。 人源BAF-核小体 2020年1月31日，徐彦辉课题组题在《Science》杂志在线发表了题为“Structure of Nucleosome-bound human BAF Complex”的研究论文。报...
限量样品免费申请！Meridian全新可冻干热稳定逆转录酶！
PCR反应中当检测靶标为RNA时，首先使用逆转录酶将RNA逆转录为cDNA，再通过DNA聚合酶的作用进行PCR扩增。常见的逆转录酶是莫洛尼鼠白血病病毒逆转录酶(MMLV-RT),它不耐高温，只能在相对较低的温度(~50°C)下维持其酶活性。但是在cDNA合成的步骤当中，较高的逆转录温度对于降低RNA二级结构对逆转录的抑制作用和减少非特异引物结合是有益处的。 ...
【NUCLEIC ACIDS RES】编辑效率91%！苔藓RNA编辑因子识别900个人类转录组脱靶点
苔藓RNA编辑因子 在活细胞中，存在着许许多多的信息流（traffic），如同置身与一个大型施工现场。在陆地植物中，DNA形式的蓝图不仅储存于细胞核中，还存在于线粒体（细胞的发电厂）和叶绿体（光合作用单元）之中。这些蓝图指导着蛋白质的构建，进而支持生命体的代谢过程。然而，蓝图信息是如何在线粒体和叶绿体中传递的呢？——通过创建蓝图的转录本（RNA）来实现。转录本（RNA）随...
【Nature子刊】转录共激活因子TAZ：改善细胞衰老引起的功能下降
研究人员在连接PU.1和Hippo途径共激活剂TAZ的oHSCs中发现了一条途径。了解其在HSCs衰老中的失调可能有助于开发干预治疗策略，从而改善老年人群的免疫功能。该研究发布于《Nature Communications》。 https://www.nature.com/articles/s41467-022-32970-1 造血干细胞功能逐渐丧失 ...
【Nature子刊】清华携手中山：单细胞转录组和翻译组双组学揭示了人类卵母细胞成熟的潜在机制
8月31日，由清华大学和中山大学科学家联手合作进行的研究论文“Single-cell transcriptome and translatome dual-omics reveals potential mechanisms of human oocyte maturation”发表在国际期刊《Nature Communications》上，通过单细胞多组学研究和干细胞体外分化试验为研究人类...
【Nature】突破时间维度！对“活”的单细胞进行转录组学动态测序
解决破坏性采样局限性 与其在后续时间内的分子及表型行为相联系——即在离散的时间点内监测某一个细胞数千个基因的活性。由于此特点，研究者也称此技术为“时间性转录组学分析”。 近年来，已开发了几种细胞分析方法来试图解决破坏性采样局限性。这些方法大致可分为两类：一类是纯计算方法：通过将相似的细胞状态连接到连续的轨迹中，或通过模拟mRNA剪接动力学，在快照（...
【柳叶刀子刊】复旦大学团队通过转录组分析探索阿尔兹海默病生物标记物！
主观或客观的潜微认知能力下降被认为是阿尔茨海默病（AD）的临床前表现，阿尔茨海默病是 预防或延缓疾病进展的潜在关键窗口。而先前的研究大多数侧重于识别阿尔茨海默病（AD）或轻度认知障碍的表达变化，但是缺乏关于临床前 AD 的转录组学分析和生物标志物的系统性研究。复旦大学团队的研究结果为病毒感染假说提供了支持，并为临床前AD提供了候选进展生物标志物。该研究发布于《eBioMedicine》。...
【即将开播】空间转录组学技术及算法在线研讨会，7月16日下午两点，大咖云集，欢迎收看！
会议背景 空间转录组学是2020年Nature methods评选的年度方法，是当前单细胞组学研究领域的新方向，在肿瘤学、病理学、免疫学、发育生物学等诸多临床领域具有广泛的应用前景。 近年来，研究者开发了多种空间转录组技术，可以在保留组织空间位置的同时获得基因表达特征、表观调控等组学信息，在传统测序技术的基础上增加了空间信息维度，使得研究者可以从更精细的...