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专家访谈
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博奥晶典携手NanoString、Illumina共同开启空间全转录组神经科学创新大赛 — 现已正式接受报名！
神经退行性病变、神经炎症、传染性疾病和神经创伤都能对中枢神经系统（CNS）造成毁灭性影响，影响认知功能、行为、心理健康等。因此，深入了解中枢神经细胞（如神经元细胞、星形胶质细胞、胶质细胞和少突胶质细胞）的功能作用，以及阿尔兹海默症、帕金森症、额颞叶痴呆（FTD）、肌萎缩性侧索硬化症（ALS）和多发性硬化（MS）等疾病的通路，对于神经类疾病的预防、诊断和治疗至关重要。然而众所周知，难以获得病变...
【Nature】重磅！人造卵细胞成为现实——使用转录因子重建卵母细胞转录网络
对于自然生命来说，繁育后代是其一生中极其重要的使命。然而，在现代社会，随着生活压力的不断增大以及环境污染的日益加剧，世界各国的不孕不育率都呈现出飙升之势，很多夫妻都饱受不孕不育的困扰。 据统计，我国有超过5000万不育不孕患者，超过正常育龄人口的10%，这一数字超乎我们的想象。 &e...
【Nature子刊】迄今最详细人类心脏单细胞转录组图谱，揭示心脏细胞异质性，助力精准医疗
为了深入了解心血管疾病的机制和治疗策略，洞悉人类健康心脏的分子组成，一个跨国研究小组绘制了人类心脏六个区域的近五十万个细胞的单细胞转录组图谱。这是迄今为止最详细的人心脏单细胞转录组图谱，揭示了心脏各区域细胞的异质性，为将来的心脏病研究和治疗提供依据。 该研究由哈佛医学院、剑...
会议邀请-国际大咖与您云相聚于空间转录组学国际峰会
今年5月中举行的“科研无疆，发现无限-国际癌症大会“受到了广大老师同学的热烈欢迎，全球范围内共有多达5000名参会者共聚该盛会。随着空间生物学，特别是空间转录组学在肿瘤，发育生物学以及新冠病毒中的进一步应用，关于该领域的开发也在最近迎来更多突破。为了更好地与广大研究人员分享这些最新最燃的研究结果，15位来自哈佛大学，麻省理工学院，康奈尔大学，台湾国立阳明大学的国际大咖...
【Nature子刊】中科院利用单细胞转录组学研究，揭示了前列腺癌的细胞类型
2009年，汤富酬等人首次报道了单细胞RNA测序技术。最近的一项研究中，中科院的研究人员利用基于液滴的单细胞RNA测序技术，发现了一种新的前列腺祖细胞类型，在某些情况下可能会促使前列腺癌的发生。 该研究由中国科学院的科学家领导，并于8月17日发表在《自然遗传学》杂志上，题为“Single-cell transcriptomics i...
【研究】韩国研究人员绘制了SARS-CoV-2转录组结构图
研究人员表示，他们使用了两种互补的测序技术来绘制SARS-CoV-2转录组和表位转录组的高分辨率图。他们发现，Illumina和MGI平台等合成测序（SBS）方法具有较高的准确性和覆盖率，但读取长度短。他们补充说，尽管基于纳米孔的直接RNA测序（DRS）的测序准确性受到限制，但它可以进行长读测序，这对于分析长嵌套CoV转录本特别有用。而且，由于DRS可以检测RNA而不是cD...
【研究】利用对外源性RNA的转录反应预测RNA病毒的广谱抗病毒药
所有RNA病毒都通过与正常运输细胞RNA转录本不同的过程将其基因组传递到目标宿主细胞中。来自正常的细胞RNA转录的运输。病毒RNA的传递最多。进入大多数细胞的病毒DNA的运输因此触发了先天的抗病毒防御机制，将病毒RNA识别为异物。反过来，病毒已经进化出了破坏这些防御的机制，让它们在其中茁壮成长。此外，药物激活防御能够作为广谱抗病毒药物对外源性RNA来说，研究人员证实了与细胞...
《Science》子刊：抗逆转录病毒治疗的最佳时机定了！有望为这些孩子谋得一线生机
获得性免疫缺陷综合征（艾滋病，AIDS)是由人免疫缺陷病毒(HIV)引起的严重传染性疾病，已经成为了世界上严重的公共卫生问题之一，尤其是在中低收入的国家。近年新生儿AIDS感染数日渐增多，却往往因临床表现不典型而被忽视，抗逆转录病毒治疗(ART)的使用契机也因条件限制众说纷纭未有定论。 近日，美国多所大学的研究人员共同发现对出生即携带HIV病毒的...
《Science》：罕见遗传病诊断——转录组分析技术再下一城
近年来，随着测序技术的飞速发展，多组学分析技术在疾病的诊断中应用越来越广泛。然而，在罕见遗传病的检测中依然有诸多限制。近日，来自哥伦比亚大学的研究人员开发了一种等位基因表达失衡分析技术，能够通过分析两个等位基因的表达失衡来诊断罕见疾病。通过联合其它技术，其将在罕见遗传病的诊断和机理研究中发挥重要作用。 目前，可通过对人类外显子组和基因组参考数据库...
《转》访苏州大学秦樾教授：细胞核内转录因子无需太多的信号转导，就可以发挥强大作用
《转》访是转化医学网的品牌专访栏目，是业内专家、大佬、知名企业智慧交流碰撞的平台，也是促进行业健康发展的重要力量，《转》访致力于打造转化医学领域最知名的专家访谈栏目。肿瘤免疫以及肿瘤干细胞信号传导是肿瘤领域至关重要的研究对象。我们邀请了苏州大学秦樾教授来谈谈他对这一领域的一些看法及心得。聆听大咖观点！ 肿瘤免疫是转化医学领域的重点关注对象之一，您...
同志们注意！抗逆转录病毒治疗可预防艾滋病传播
艾滋病以潜伏时间长、感染后难以察觉、传染范围广及死亡率极高成为世界上最具破坏力的流行病之一，其肆意传播使人类生存和发展受到了严峻挑战。随着艾滋病病毒感染人数的增加，抗艾滋病药物的研究已成为世界重大课题之一。众所周知，性传播是艾滋病的重要传播途径，而其中男同性恋者特殊的性行为方式，使得他们感染艾滋病病毒的几率相比异性恋者更高。 ...
甲基化与lncRNA: 表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么？circRNA，lncRNA，外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外，现在很多小伙伴们开始了新的玩法，通过多平台联用，将不同层面的东西结合起来，比如，表观遗传与非编码RNA的结合，就是一个很好的例证。 研究背景 肺癌是一种常见的恶性肿瘤，特别在中国，由于环境的污染，肺癌的发生率也在持续升高。非小细胞肺癌（NSCLC）是肺癌中最常见的...
2016年Nature Methods年度技术：表观转录组分析
2016年12月29日，北京大学生命科学学院伊成器研究组应邀在《Nature Methods》杂志发表题为“Epitranscriptome sequencing technologies: decoding RNA modifications” 的综述论文（doi:10.1038/nmeth.4110）。 表观转录组学（epitranscriptomics，又称“RNA表观遗...
伯豪客户发表转录组测序新成果！
研究背景 FOXP3+调节性T细胞（Treg）具有免疫抑制作用，在维持自身免疫过程中具有重要作用。因此，对Treg细胞在体内的分子机制研究也具有重要意义。关于FOXP3+ Treg细胞稳定性的争论从最近的一些工作报道中也是愈演愈烈。在这些研究中，稳定Treg细胞在炎症反应以及成淋巴反应中具有T-effector-cell-like表型，并且发现FOXP3表达不稳定。稳定的Tre...
基因组研究再创佳绩，转录因子异常背锅小儿白血病
应用基因组测序技术、RNA测序技术、染色质免疫共沉淀测序技术等前沿手段，来自华盛顿大学附属美国圣裘迪儿童研究院儿童癌症基因组项目的研究人员完成了1900例儿童及成人急性B淋巴细胞白血病患者遗传信息的检测。他们发现这些白血病患者体内DUX4基因的多次重组与异构体的异常表达或删除引起的ERG功能缺失密切相关。该研究所对应的具体论文发表于最新上线的Nature Genetics杂志上，标题为“Der...
Science 两种转录因子指导免疫细胞在组织内驻留
在一项新的研究中，来自澳大利亚墨尔本大学等机构的研究人员发现负责在体内皮肤、肝脏、肾脏和肠道的入侵位点抵抗感染的基因。 这项研究是由来自澳大利亚沃尔特与伊丽莎-霍尔医学研究所(Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research)的Axel Kallies博士和Klaas van...
Nature Methods：突破性单细胞表观基因组与转录组分析新技术
由英国及比利时的研究人员开发出的一种新方法，使得在单细胞中同时研究表观基因组及转录组成为可能。发布在《自然方法》（Nature Methods）上的实验方案，可帮助科学家们精确描绘出DNA甲基化改变与基因表达之间的关系。 近年来单细胞测序技术发展迅速，被广泛用于研究细胞间的基因表达谱（转录组）差异。近期的一些单细胞实验方案也使得...
基因“转录漂移”或成衡量老龄化的新通用指标
相对于长生，不老似乎才是人们的终极追求。早在2007年，美国斯克里普斯研究所的团队就用抗抑郁药物米塞林延长了秀丽隐杆线虫的青春期，但其中的奥秘直到最近才被揭开。研究人员同时表示，别指望吃药也能让我们的青春期延长，要实现人类永葆青春的愿望还有很长的路要走，因为人类的进化程度与线虫相隔了上百万年之久。 据每日科学网报道，为了找出米塞林让秀...
黄岩谊、汤富酬组开发新的单细胞转录组测序法
北京大学生物动态光学成像中心（Biodynamic Optical Imaging Center, BIOPIC）是北京大学于2010年成立的一个跨学科合作实体研究中心。中心的目标是发展和利用最先进的生物成像与基因测序手段，在分子和细胞水平上进行生命科学与医学基础研究。中心配备了界一流的研究设备和条件，有重点地发展最新的生物成像和测序技术。 ...
刘新垣院士Cell携手华裔学者：转录因子的第二重作用
来自华盛顿州立大学和中科院的研究人员，发现了一种蛋白质在细胞分裂中从前未知的功能。众所周知，这一称作为ATF5的蛋白可以控制特异基因的表达频率。ATF5调控了控制细胞存活的一些基因。 现在研究小组发现，这一蛋白发挥了与它的转录因子角色无关的一种作用。在细胞的中心体（centrosome）中，ATF5还充当了结构蛋白。这一重要的研究发现发布在...