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专家访谈
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【直播预告】空间转录组学技术及算法在线研讨会，7月16日下午两点，欢迎收看！
会议背景 空间转录组学是2020年Nature methods评选的年度方法，是当前单细胞组学研究领域的新方向，在肿瘤学、病理学、免疫学、发育生物学等诸多临床领域具有广泛的应用前景。 近年来，研究者开发了多种空间转录组技术，可以在保留组织空间位置的同时获得基因表达特征、表观调控等组学信息，在传统测序技术的基础上增加了空间信息维度，使得研究者可以从更...
【科技前沿】百迈客发布国内首款亚细胞级微孔空间转录组芯片！
伴随着单细胞技术的发展，分析工具的拓展使得空间分析在过去一两年逐渐发展成为一个新的科研领域。空间转录组学技术更是先后在2020、2022年被《Nature》、《Nature Method》评为 “年度技术”，其相关技术呈指数级增长。它不仅可以提供研究对象的转录组等数据信息，同时还能定位其在组织中的空间位置。这对于癌症发病机制、神经科学、发育生物学等众多领域的研究都有重要意义。 ...
【Cell子刊】研究人员成功绘制了弥漫性大B细胞淋巴瘤的单细胞转录组图谱，有助于HBV阳性B细胞淋巴瘤患者的治疗
卡罗林斯卡医学院(Karolinska Institute)的生命科学和营养研究人员，共同通讯作者Qiang Pan-Hammarström指出：“我们发现了恶性细胞与良性细胞的发展轨迹，恶性细胞和肿瘤浸润细胞之间的相互作用，我们还发现慢性病毒感染的影响可以进一步解释DLBCL的疾病异质性。对恶性细胞亚群的体细胞突变谱和药物反应进行深入研究，可以为疾病机制和治疗策略提供其他视角。” ...
【推荐】如何选择合适的逆转录酶来提高逆转录效率和灵敏度？
01逆转录酶活性 逆转录酶主要包括以下三种活性： ①逆转录活性：以RNA为模板，催化dNTP聚合，生成DNA-RNA杂合双链。 ②RNase H活性：水解杂合双链中的RNA，得到与RNA互补的DNA单链（cDNA）。 ③DNA指导的DNA聚合酶活性：以cDNA单链为模板，以dNTP为底物，再合成双链DNA。 02逆转录酶种类 目...
【Nature子刊】利用空间转录组学技术，创建结肠基因图谱——获得肠道疾病新见解！
卡罗林斯卡医学院的研究人员利用一种名为空间转录组学的技术，分析了小鼠结肠中的基因表达，并创建了一个图谱，显示组织中单个基因的表达位置。当他们将之前已知的人类转录数据叠加到图谱上时，研究人员获得了对炎症性肠病(IBD)的新见解。相关研究发表在《Nature Communications》杂志上，题为“The spatial transcriptomic landscape of the hea...
限量样品免费申请！Meridian全新可冻干+热稳定逆转录酶！
PCR反应中当检测靶标为RNA时，首先使用逆转录酶将RNA逆转录为cDNA，再通过DNA聚合酶的作用进行PCR扩增。 常见的逆转录酶是莫洛尼鼠白血病病毒逆转录酶(MMLV-RT),它不耐高温，只能在相对较低的温度(~50°C)下维持其酶活性。但是在cDNA合成的步骤当中，较高的逆转录温度对于降低RNA二级结构对逆转录的抑制作用和减少非特异引物结合是有益处的。 迈迪安...
【快讯】菲沙基因&曙光智算强强联合丨精品单细胞转录组线下培训班重磅开启！
“ 曙光智算 ” 曙光智算信息技术有限公司是中科曙光的全资子公司，公司目前运营全国十余家计算中心，已建成算力资源、存储资源、网络资源及先进计算增值服务一体的统一服务平台。曙光智算发挥曙光在计算领域近30年的技术积累及技术优势提供端到端全栈算力生产、交付与应用支持服务，助力产业升级、科研创新、政务服务和信息技术应用创新。以及丰富的全国产及通用计算资源和异构加速资源，助力产...
博奥晶典携手NanoString、Illumina共同开启空间全转录组神经科学创新大赛 — 现已正式接受报名！
神经退行性病变、神经炎症、传染性疾病和神经创伤都能对中枢神经系统（CNS）造成毁灭性影响，影响认知功能、行为、心理健康等。因此，深入了解中枢神经细胞（如神经元细胞、星形胶质细胞、胶质细胞和少突胶质细胞）的功能作用，以及阿尔兹海默症、帕金森症、额颞叶痴呆（FTD）、肌萎缩性侧索硬化症（ALS）和多发性硬化（MS）等疾病的通路，对于神经类疾病的预防、诊断和治疗至关重要。然而众所周知，难以获得病变...
【Nature】重磅！人造卵细胞成为现实——使用转录因子重建卵母细胞转录网络
对于自然生命来说，繁育后代是其一生中极其重要的使命。然而，在现代社会，随着生活压力的不断增大以及环境污染的日益加剧，世界各国的不孕不育率都呈现出飙升之势，很多夫妻都饱受不孕不育的困扰。 据统计，我国有超过5000万不育不孕患者，超过正常育龄人口的10%，这一数字超乎我们的想象。 &e...
【Nature子刊】迄今最详细人类心脏单细胞转录组图谱，揭示心脏细胞异质性，助力精准医疗
为了深入了解心血管疾病的机制和治疗策略，洞悉人类健康心脏的分子组成，一个跨国研究小组绘制了人类心脏六个区域的近五十万个细胞的单细胞转录组图谱。这是迄今为止最详细的人心脏单细胞转录组图谱，揭示了心脏各区域细胞的异质性，为将来的心脏病研究和治疗提供依据。 该研究由哈佛医学院、剑...
会议邀请-国际大咖与您云相聚于空间转录组学国际峰会
今年5月中举行的“科研无疆，发现无限-国际癌症大会“受到了广大老师同学的热烈欢迎，全球范围内共有多达5000名参会者共聚该盛会。随着空间生物学，特别是空间转录组学在肿瘤，发育生物学以及新冠病毒中的进一步应用，关于该领域的开发也在最近迎来更多突破。为了更好地与广大研究人员分享这些最新最燃的研究结果，15位来自哈佛大学，麻省理工学院，康奈尔大学，台湾国立阳明大学的国际大咖...
【Nature子刊】中科院利用单细胞转录组学研究，揭示了前列腺癌的细胞类型
2009年，汤富酬等人首次报道了单细胞RNA测序技术。最近的一项研究中，中科院的研究人员利用基于液滴的单细胞RNA测序技术，发现了一种新的前列腺祖细胞类型，在某些情况下可能会促使前列腺癌的发生。 该研究由中国科学院的科学家领导，并于8月17日发表在《自然遗传学》杂志上，题为“Single-cell transcriptomics i...
【研究】韩国研究人员绘制了SARS-CoV-2转录组结构图
研究人员表示，他们使用了两种互补的测序技术来绘制SARS-CoV-2转录组和表位转录组的高分辨率图。他们发现，Illumina和MGI平台等合成测序（SBS）方法具有较高的准确性和覆盖率，但读取长度短。他们补充说，尽管基于纳米孔的直接RNA测序（DRS）的测序准确性受到限制，但它可以进行长读测序，这对于分析长嵌套CoV转录本特别有用。而且，由于DRS可以检测RNA而不是cD...
【研究】利用对外源性RNA的转录反应预测RNA病毒的广谱抗病毒药
所有RNA病毒都通过与正常运输细胞RNA转录本不同的过程将其基因组传递到目标宿主细胞中。来自正常的细胞RNA转录的运输。病毒RNA的传递最多。进入大多数细胞的病毒DNA的运输因此触发了先天的抗病毒防御机制，将病毒RNA识别为异物。反过来，病毒已经进化出了破坏这些防御的机制，让它们在其中茁壮成长。此外，药物激活防御能够作为广谱抗病毒药物对外源性RNA来说，研究人员证实了与细胞...
《Science》子刊：抗逆转录病毒治疗的最佳时机定了！有望为这些孩子谋得一线生机
获得性免疫缺陷综合征（艾滋病，AIDS)是由人免疫缺陷病毒(HIV)引起的严重传染性疾病，已经成为了世界上严重的公共卫生问题之一，尤其是在中低收入的国家。近年新生儿AIDS感染数日渐增多，却往往因临床表现不典型而被忽视，抗逆转录病毒治疗(ART)的使用契机也因条件限制众说纷纭未有定论。 近日，美国多所大学的研究人员共同发现对出生即携带HIV病毒的...
《Science》：罕见遗传病诊断——转录组分析技术再下一城
近年来，随着测序技术的飞速发展，多组学分析技术在疾病的诊断中应用越来越广泛。然而，在罕见遗传病的检测中依然有诸多限制。近日，来自哥伦比亚大学的研究人员开发了一种等位基因表达失衡分析技术，能够通过分析两个等位基因的表达失衡来诊断罕见疾病。通过联合其它技术，其将在罕见遗传病的诊断和机理研究中发挥重要作用。 目前，可通过对人类外显子组和基因组参考数据库...
《转》访苏州大学秦樾教授：细胞核内转录因子无需太多的信号转导，就可以发挥强大作用
《转》访是转化医学网的品牌专访栏目，是业内专家、大佬、知名企业智慧交流碰撞的平台，也是促进行业健康发展的重要力量，《转》访致力于打造转化医学领域最知名的专家访谈栏目。肿瘤免疫以及肿瘤干细胞信号传导是肿瘤领域至关重要的研究对象。我们邀请了苏州大学秦樾教授来谈谈他对这一领域的一些看法及心得。聆听大咖观点！ 肿瘤免疫是转化医学领域的重点关注对象之一，您...
同志们注意！抗逆转录病毒治疗可预防艾滋病传播
艾滋病以潜伏时间长、感染后难以察觉、传染范围广及死亡率极高成为世界上最具破坏力的流行病之一，其肆意传播使人类生存和发展受到了严峻挑战。随着艾滋病病毒感染人数的增加，抗艾滋病药物的研究已成为世界重大课题之一。众所周知，性传播是艾滋病的重要传播途径，而其中男同性恋者特殊的性行为方式，使得他们感染艾滋病病毒的几率相比异性恋者更高。 ...
甲基化与lncRNA: 表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么？circRNA，lncRNA，外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外，现在很多小伙伴们开始了新的玩法，通过多平台联用，将不同层面的东西结合起来，比如，表观遗传与非编码RNA的结合，就是一个很好的例证。 研究背景 肺癌是一种常见的恶性肿瘤，特别在中国，由于环境的污染，肺癌的发生率也在持续升高。非小细胞肺癌（NSCLC）是肺癌中最常见的...
2016年Nature Methods年度技术：表观转录组分析
2016年12月29日，北京大学生命科学学院伊成器研究组应邀在《Nature Methods》杂志发表题为“Epitranscriptome sequencing technologies: decoding RNA modifications” 的综述论文（doi:10.1038/nmeth.4110）。 表观转录组学（epitranscriptomics，又称“RNA表观遗...