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专家访谈
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伯豪客户发表转录组测序新成果！
研究背景 FOXP3+调节性T细胞（Treg）具有免疫抑制作用，在维持自身免疫过程中具有重要作用。因此，对Treg细胞在体内的分子机制研究也具有重要意义。关于FOXP3+ Treg细胞稳定性的争论从最近的一些工作报道中也是愈演愈烈。在这些研究中，稳定Treg细胞在炎症反应以及成淋巴反应中具有T-effector-cell-like表型，并且发现FOXP3表达不稳定。稳定的Tre...
基因组研究再创佳绩，转录因子异常背锅小儿白血病
应用基因组测序技术、RNA测序技术、染色质免疫共沉淀测序技术等前沿手段，来自华盛顿大学附属美国圣裘迪儿童研究院儿童癌症基因组项目的研究人员完成了1900例儿童及成人急性B淋巴细胞白血病患者遗传信息的检测。他们发现这些白血病患者体内DUX4基因的多次重组与异构体的异常表达或删除引起的ERG功能缺失密切相关。该研究所对应的具体论文发表于最新上线的Nature Genetics杂志上，标题为“Der...
Science 两种转录因子指导免疫细胞在组织内驻留
在一项新的研究中，来自澳大利亚墨尔本大学等机构的研究人员发现负责在体内皮肤、肝脏、肾脏和肠道的入侵位点抵抗感染的基因。 这项研究是由来自澳大利亚沃尔特与伊丽莎-霍尔医学研究所(Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research)的Axel Kallies博士和Klaas van...
Nature Methods：突破性单细胞表观基因组与转录组分析新技术
由英国及比利时的研究人员开发出的一种新方法，使得在单细胞中同时研究表观基因组及转录组成为可能。发布在《自然方法》（Nature Methods）上的实验方案，可帮助科学家们精确描绘出DNA甲基化改变与基因表达之间的关系。 近年来单细胞测序技术发展迅速，被广泛用于研究细胞间的基因表达谱（转录组）差异。近期的一些单细胞实验方案也使得...
基因“转录漂移”或成衡量老龄化的新通用指标
相对于长生，不老似乎才是人们的终极追求。早在2007年，美国斯克里普斯研究所的团队就用抗抑郁药物米塞林延长了秀丽隐杆线虫的青春期，但其中的奥秘直到最近才被揭开。研究人员同时表示，别指望吃药也能让我们的青春期延长，要实现人类永葆青春的愿望还有很长的路要走，因为人类的进化程度与线虫相隔了上百万年之久。 据每日科学网报道，为了找出米塞林让秀...
黄岩谊、汤富酬组开发新的单细胞转录组测序法
北京大学生物动态光学成像中心（Biodynamic Optical Imaging Center, BIOPIC）是北京大学于2010年成立的一个跨学科合作实体研究中心。中心的目标是发展和利用最先进的生物成像与基因测序手段，在分子和细胞水平上进行生命科学与医学基础研究。中心配备了界一流的研究设备和条件，有重点地发展最新的生物成像和测序技术。 ...
刘新垣院士Cell携手华裔学者：转录因子的第二重作用
来自华盛顿州立大学和中科院的研究人员，发现了一种蛋白质在细胞分裂中从前未知的功能。众所周知，这一称作为ATF5的蛋白可以控制特异基因的表达频率。ATF5调控了控制细胞存活的一些基因。 现在研究小组发现，这一蛋白发挥了与它的转录因子角色无关的一种作用。在细胞的中心体（centrosome）中，ATF5还充当了结构蛋白。这一重要的研究发现发布在...
长期抗逆转录治疗可阻止艾滋病在异性间的传播
在2011年，HPTN052研究的研究人员也报告了一个突破：当免疫系统相对健康的时候，即HIV早期开始治疗，能够减病毒在未来18个月内传染给未感染的伴侣的风险，即减少96%的患病可能。基于从2011年收集的另外的数据，今天发表的发现证明了，在抗逆转录病毒疗法控制下的HIV能够持久的大大减少HIV的性传播。 “现在这项研究非常清楚，当HIV感染者开始进行抗逆转录病毒治疗，并保持对病毒的抑制...
张亚平院士JMCB获人类大脑转录组进化研究进展
人类在进化过程中，脑的大小和复杂程度得到了极大得增加。脑的结构使得人类有着区别于其他物种的极高的认知能力，比如语言能力、抽象思考能力等等。转录后修饰，如RNA编辑、可变剪切等能够由相同的DNA序列生成不同的RNA，进而翻译成不同的蛋白质构体，是扩大蛋白质多样性的重要机制。随着二代测序发展，转录后修饰等已成为当今研究热点。 ...
Science首次报道逆转录病毒壳体蛋白结构
最近，乌拉圭巴斯德研究所的研究人员，与乌拉圭医学院合作，第一次获得了牛白血病病毒（BLV）衣壳蛋白的高分辨率晶体结构。他们获得的晶体结构显示出此蛋白前所未有的的灵活性，这是传染性颗粒装配的关键。这些研究结果，发表在六月四日的《Science》杂志，是了解逆转录病毒生物学的一个重要进步，为抗逆转录病毒疗法的开发，开辟了新的途径。 牛白血病病毒...
Cell子刊：二胎妈妈更易哺乳孩子
报道：坊间传闻，二胎妈妈要比第一次生宝宝的妈妈更容易分泌乳汁，这是真的吗？一组来自冷泉港实验室的研究人员证明了这一点，并指出了其中的分子机制。这一研究成果公布在5月13日的Cell Reports杂志上。 这一研究结果表明乳腺能形成怀孕长期记忆，从而影响了其激素变化，这种记忆会贯穿生物机体整个生育年龄。 人体在怀孕期间会发生许多...
赛默飞获CE-IVD认证 将开发出Oncomine实体瘤融合转录试剂盒
近日，赛默飞世尔科技 (Thermo Fisher Scientific)获得CE-IVD认证标志，这标志着其将开发出基于新一代测序技术的Oncomine实体瘤融合转录试剂盒，这种试剂盒是利用Ion Ampliseq测序技术来检测包括ALK，ROS-1， RET，和NTRK1基因在内的一系列基因重排情况，而目前OncoNetwork联盟的研究者正在同T...
Nature子刊：部分SNPs的转录调控亚型与疾病相关
国立卫生研究院和哈佛医学院的研究人员使用基因芯片来分析血液样本中的基因表达和SNP基因分型模式，这些样本是从招募参与Framingham心脏研究的个体中获得的，研究人员拿出了一组剪接数量性状位点的候选组，这其中包括了所谓反sQTLs，这个往往出现在他们调节的转录附近。 通过与美国国家人类基因组研究所的GWAS目录下的SNPs的数据进行对比，研究人员发现几百个sQTLs与人类性状或者疾病中...
转录组学方介导的多效调控蛋白 SprA 作用机制研究
Applied Microbiology and Biotechnology (AMB)为国际工业微生物领域著名杂 志。近期，浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室研究人员在该期刊上发表了 题 为 “Transcriptome-guided identification of SprA as a pleiotropic regulator in Streptom...
Nat Med：特殊转录因子FoxO1的缺失或可诱发肺动脉高血压
肺动脉高血压的特点是血管壁中的细胞分裂失控，从而使得血管增厚，近日，发表在Nature Medicine上的一篇研究论文中，来自马克斯普朗克研究所的研究人员发现，转录因子FoxO1可以调节细胞的分裂，而且在肺动脉高血压的发病过程中扮演着重要角色。 研究人员表示，或许可以通过激活FoxO1来治疗肺动脉高血压，这为开发治...
上海生科院发现转录中介体基因能够控制肥胖及糖尿病
9月16日，国际学术期刊CellResearch在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所王纲研究组的最新研究成果，该工作发现在小鼠肝脏中删除中介体MED23基因能够减缓肥胖和糖尿病的发生发展,揭示了中介体MED23在肝脏糖脂代谢调控和糖尿病发生发展过程中的作用及机制，为代谢疾病的临床治疗提供了可能的新分子靶标。 糖尿病是在全世界范围内广泛流行的...
Nucleic Acids Research：siRNA药物释放研究取得重大进展
近日，由锐博生物科研团队同南方医科大学珠江医院药学部季爱民课题组共同完成的一篇新型siRNA给药系统研究论文，被国际权威核酸研究杂志Nucleic Acids Research接受，目前该论文的网络版已经在线发表。 RNA干扰(RNA interference, RNAi)是一种哺乳动物细胞内...
RNA的美丽新世界
至少对于某些理论学家来说，生命的最初形式就是RNA。生命可能源自自我复制的RNA分子，而分子生物学家却长期将目光放在DNA上。但这一偏见确实有不错的理由。DNA不仅被广泛认为携带着生命指令的决定性拷贝，而且也更易于在实验室操作。 如今，这两个合理解释都土崩瓦解了。基于非蛋白编码部分RNA的一整层基因调控模式的发现，以及同期发展起来、操作这些分子的新工具和新技术，已...
《BMC Plant Biology》：安诺优达携手海南大学，探究椰果发育转录组
近期，安诺优达携手海南大学，在椰果转录组研究方向取得重大进展，相关研究结果发表在《BMC Plant Biology》上。该文章以系统全面的数据，展示了不同发育阶段特异性表达的基因，填补了当前椰果发育过程中基因调控方面的空白。 椰子是亚热带重要的经济作物，椰果含丰富维生素B、C、氨基酸、复合多糖物质和多种维生素，具有重要的经济价...
染色质免疫沉淀测序技术获突破
北京大学生物动态光学成像中心黄岩谊课题组与汤富酬课题组合作，发展了一种基于微流控芯片的微量细胞样品处理与核酸俘获方法，成功实现了针对1000个细胞的染色质免疫沉淀测序（ChIP-Seq），大幅减少了这类实验中对样品起始量的要求，并利用这一方法研究了组蛋白H3第4位赖氨酸的3甲基化修饰（H3K4me3）在小鼠胚胎发育过程中的修饰模式，发现与小鼠胚胎干细胞相...