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MIT和麻省总医院建立新的微生物基因组学研究中心
麻省理工MIT和麻省总医院11月份宣布投资2500万美元创办新的微生物基因组学生物信息和治疗研究中心,旨在为双方的科研人员提供研究平台以探索人类疾病与体内微生物之间的联系。这项研究炎症性肠病的旗帜性项目包含数个小的创新项目,其目的很明确,即开发新的治疗方法并将其带入临床检测应用。 这个项目的创办受到了对微生物基因组学治疗方案拥...
Cell:迄今最大人类基因组编码蛋白相互作用图谱问世
据最新一期《细胞》杂志报道,由加拿大和美国科学家组成的一个国际研究小组,绘制出了迄今最大规模的人类基因组编码蛋白间直接相互作用的图谱,并预测出数十个与癌症相关的新基因。该项研究成果对于理解癌症和其他疾病的形成机制,并最终开发出治疗和预防方案至关重要。 加拿大高等研究院、美国达纳法博癌症研究中心和哈佛医学院共同完成的...
11月王牌聚焦:各种重大图谱成果扑面而来
时近年末,各种重大成果好似扎堆一样接踵而来,人类蛋白质互作组图谱、人类基因组重组图谱、ENCODE重大成果接连公布,让人眼花缭乱,科学界“过年”的氛围扑面而来。 首先是科学家们公布了迄今为止最大规模的人类基因组编码蛋白直接互作图谱,并预测出了与癌症相关的几十个新基因。这一新“人类互作组(interactome)”图谱描述了蛋白质之间的1.4万...
Genomics新轮融资 参与十万基因组计划
根据今天发布的一份投资者声明,英国Genomics有限公司将在一项融资中首轮提出1030万欧元的私人融资。 Genomics有限公司是英国牛津大学的一家衍生公司,正在开发一个基因组序列数据分析平台。该公司创始人之一彼得·唐纳利是牛津大学教授,同时也是威康信托基金会以及吉尔麦卡文金融集团人类遗传学中心主任。以上两个金融集团的人类遗传学中心皆由牛津纳米...
新型DNA分析器引领个性化医疗时代
美国亚利桑那州立大学生物设计研究所和IBM的T.J.沃森研究中心的研究人员在一项声明中表示他们已经开发出一个能够分析整个基因组的原型DNA分析器,该分析器可实时捕捉医疗过程中产生的生物学信息。 亚利桑那州立大学物理学教授和生物设计单分子生物物理学中心主任Stuart Lindsay博士表示:“我们的目标是把廉价、简单和强大的DNA和蛋白质诊断设备进每一个医生的办公室。” ...
Sanger团队成功测序人脑绦虫
惠康基金会Sanger研究所为中心的研究机构对欧猥迭宫绦虫进行了测序和蛋白组学的草图绘制,研究样本来自病人大脑中匍匐着的绦虫。 根据研究团队今天在Genome Biology 网络版的报告,研究人员通过针对性条码基因测序技术找到了引起患者症状的脑绦虫,该患者年龄为50岁并长期患有头痛和神经疾病。研究人员对绦虫样本进行了基因组测序,得到了一个总数据量高达1260万的欧猥迭宫绦虫基因组装配草...
研究者在哺乳动物基因组中发现细菌基因
由约翰霍普金斯大学Steven Salzberg教授领导的研究团队本周在科学期刊PeerJ上发表文章表示环境中例如细菌序列的核酸污染物可能在哺乳动物基因组中进行装配,即使这些序列已经被公共数据库所收纳。 通过使用微生物学分析软件,Salzberg和他的同事们发现了美国奶牛基因组中包含了173个已经被证实的细菌核酸污染物微小相的邻片段,这些来自包括不动杆菌、假单胞菌以及寡养食单...
埃博拉基因测序难为“无米之炊”
随着埃博拉病毒横扫西非,科学家缺乏重要基因数据来解答引发众多担忧的猜测:这种病毒会变得更具传染性和更致命吗?它会发生变化,让其逃避诊断测试或疫苗吗?非洲和欧洲实验室的冰箱里存放着取自埃博拉患者的数千份血液样本,但它们并未被使用,且少数几个获得新基因数据的研究小组并未公开信息。 研究人员渴望近距离观察病毒可能是如何进化的。英国爱丁堡大学研究传染病的进...
NATURE:白金基因组计划为疾病治疗带来曙光
“这就像欧洲测绘,有人说,‘噢,还有挪威。我真的不想要做那个地方。’”在英国剑桥附近的欧洲生物信息学研究所的计算生物学家Ewan Birney这样说道,其参与了人类基因组计划。“现在,终于有人在那里测量这个被忽略的地方了。” 这个方案依赖于一种奇特的细胞生长中得到的DNA,我们正在努力揭示之前官方人类基因组序列没有发现的DNA序列,而这些序列往与例如孤独...
GIS利用BT云计算技术促进全球基因组研究发展
新加坡基因组研究所(GIS)利用BT集团云计算等基础设施支持其现有的基因组分析功能发展。 根据协议条款,GIS将访问英国生命科学专用电信云计算基础设施,并将使用该系统运行计算密集型工作负载。GIS执行董事Ng Huck Hui在一项声明中表示“这将有助于GIS加快发展和商业化算法开发和数据库分析的临床应用,可用于探索疾病病因。” &emsp...
CG新技术在罕见病诊断上的应用
罕见病,顾名思义,是指那些仅发生在极少数人身上的罕见疾病。大部分的罕见病都是慢性的遗传疾病,由突变或遗传的基因缺陷而引起。就目前而言,许多罕见病都缺乏有效的治疗手段和资源,且往往非常严重,因此,罕见病的诊断和预防就显得十分重要。 2014年11月7日,第二届国际罕见病研究联盟会议在深圳福田大中华喜来登酒店召开。来自欧洲、美洲、非洲和亚洲的超过600...
雪貂基因组测序加深人类疾病研究
近日,一个国际研究团队进行了雪貂基因组测序,他们认为这将巩固雪貂作为研究人类呼吸道疾病如流感和囊性纤维化的生物模型。 研究人员检查了雪貂感染大范围流感病毒后基因随着时间推移的不同表达,通过研究囊性纤维化雪貂模型反映了人类疾病的发展。 基因分析中心的合著人Federica Di Palma在一份声明中表示“通过创建一个...
DxTerity : 推进基因组检测的临床应用
最近,分子诊断公司开始关注一种新的基因检测技术。该技术可以避开传统检测分析所需要的RNA分离和样品准备步骤。并且,检测快速,低成本,适用于大样本的高通量分析。 DxTerity诊断公司开发了一种独一无二的的化学扩增方法:DxDirect,作为其分子诊断技术的基础。DxTerity诊断公司研发旨在疾病的监测和诊断。目前,该公司已经开发了用于炎症基因...
【人类基因组计划】解密上帝的语言 天使or魔鬼?
DNA测序时代开始 虽然早在1953年,沃森和克里克就发现了不朽的DNA(脱氧核糖核酸)双螺旋结构,但是长久以来,人们始终都找不到很好的办法测定DNA中四种碱基——A(腺嘌呤)、T(胸腺嘧啶)、G(鸟嘌呤)、C(胞嘧啶)——的排列顺序。 上帝的语言是如此的小,还没有人看得到,天才,鬼才就是为大问题而生的。咿~呀~ ...
Nature:新测序技术有助发现基因组微小变异
领导这一研究小组的是华盛顿大学基因组学系教授、霍华德-休斯医学研究所研究员、弗雷德-哈钦森癌症研究中心人类生物学部兼职教授Evan Eichler博士,其主要从事于基因组学与生物信息学研究,是国际上进行人和其他灵长类动物比较功能基因组学与生物信息学研究的顶尖科学家。在Cell, Nature, Science等国际顶尖学术期刊上发表了具有重要影响力的论文260多篇。 Eichler说:“...
药明康德基因中心携手NextCODE Health在中国开展大规模人群全基因组分析业务
药明康德基因中心宣布与总部位于美国波士顿的NextCODE Health公司合作,利用全球唯一存储超过三十万人全基因组信息的集中式数据库,服务中国科学家。双方将基于药明康德基因中心CLIA认证的测序平台与NextCODE Health生物信息学分析平台,提供快捷、精准的一站式测序与分析服务。双方将致力于在中国开展大规模人群全基因研究及临床诊断,建立中...
线粒体基因组测序有助筛选青光眼治疗靶点
青光眼是导致不可逆性失明的主因,该病在世界范围内的影响超过了6000万人,估计到2020年会增加到7960万人。人们认为遗传起源和许多实验表明的新的测序方法可以帮助了解该疾病发展状况。 研究组使用新的基因测序技术获得了线粒体基因组数据。开角型青光眼是最常见的青光眼,该种病型表明线粒体已发生突变,...
谷歌推人类基因组云端服务项目
Google Genomics是谷歌在去年3月推出的一项云端服务,但随后由于没有进行大规模的推广而并未引起人们的注意,该项目皆在帮助大学实验室和医院将患者或科研对象的生物基因储存到云端上,服务的目标是“探讨遗传变异交互”,意味着科研专家能够访问数百万的生物基因组数据,并能轻松简单的进行对比和分析。除了谷歌之外,人类基因组数据的存储目前还已经引起了亚马逊、IBM和微软等科技巨头的注意。 谷...
华大基因参与的荷兰人基因组计划圆满完成
遗传资源、生物信息和基因数据,是维系一个民族生存与发展的命脉,世界各国都投入了大量资源建立国家基因库。荷兰国家基因库是欧洲基因库的一部分,为了丰富荷兰国家基因库的分子和表型数据,荷兰人基因组联盟联合华大基因开展了荷兰人基因组计划。荷兰人基因组计划通过对来自荷兰12个省份具有代表性的250个家庭进行全基因组测序(平均测序深度13×),一共鉴定出20.4M的单碱基变异、1....
Nat Commun:揭示引发食管癌的基因组突变
近日,来自澳大利亚昆士兰大学的研究人员通过研究发现,意外的染色体突变或许会诱发食道癌的发生,相关研究发表于国际杂志Nature Communications上。研究者Nic Waddell表示,本文中我们对来自三所布里斯班医院的22名患食管腺癌(OAC)的进行了全基因组测序研究分析,结果显示,在32%的病人机体中都存在损伤DNA的突变事件,这就会引发基...
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