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专家访谈
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NIH：1800万美元奖励疟原虫单细胞基因组学研究
NIH奖励德克萨斯生物医学研究院的科学家Ian Cheeseman 1800万美元，以鼓励其继续进行疟原虫单细胞基因组的研究。 Ian Cheeseman及其研究团队开创了一种新的检测方法，可对单个疟原虫的基因组进行测序，该方法发表在今年五月份的Genome Research杂志上。方法结合了细胞分选、全基因组扩增基因分型以及...
近期最热的基因组测序新成果
The scientist杂志盘点了近期各大杂志上最热门的基因组测序成果，中国团队的几项测序研究受到了广泛关注。 种属：兰花（Phalaenopsis equestris） 基因组：约1.2 billion bp 我国研究团队于十一月二十四日在Nature Genetics杂志上发布了小兰屿...
GATC生物技术实现重组 提供测序与诊断公司新模型
德国测序服务公司GATC生物技术2号宣布进行结构重组,将其产品和服务划分为三个部门。 测序服务部将经营该公司Sanger测序和下一代测序技术服务业务，该业务包括GATC 生物技术公司的NGSelect和InView产品。定制服务部将提供咨询和工程设计服务。诊断部将专注于该公司在例如肿瘤以及综合性疾病诊断领域的测序技术应用。 公司在一项声明中表示：结构重组将提高G...
NeoGenomics与生物信息学公司合作，将测序技术投入临床应用
生物信息学公司N-of-One今天宣布与NeoGenomics实验室合作共同对癌症基因诊断公司所提供的诊断测试结果进行分析与注释。 根据协议，莱克星顿的N-of-One公司将对NeoGenomics通过基于新一代测序技术的固体肿瘤基因检测得出数据进行分析与注释，对所进行测试中的多种亚型固态肿瘤细胞的常规性和可操作基因组异常进行分析与评估。 NeoGenomics...
卢煜明教授PNAS发表测序新成果
来自香港中文大学的研究人员采用基因组和甲基化组测序方法，揭示出了系统性红斑狼疮(SLE)患者血浆DNA的异常。研究结果发布在11月26日的《美国国家科学院院刊》（PNAS）上。 领导这一研究的是香港中文大学的卢煜明（Y. M. Dennis Lo）教授。卢煜明教授是分子生物学的临床应用专家，尤其致力于人体内血浆DNA和RNA的研究。卢教授早在199...
DNA测序上榜《福布斯》中国8大领先创新行业
北京时间12月1日消息，《福布斯》杂志网络版发表分析文章称，中国虽然以制造工厂闻名于世，但也开发出了一些惊人的创新服务和产品。《福布斯》列出了中国领先世界其他国家的8大创新行业，微支付、廉价智能机、高铁等上榜。 以下是文章摘要： 长期以来，中国一直以世界制造工厂而闻名于世。证据也很充足：比如，2011年，中国生产了全球90%的PC、80%的空调、74%的太阳能...
Genomics新轮融资 参与十万基因组计划
根据今天发布的一份投资者声明，英国Genomics有限公司将在一项融资中首轮提出1030万欧元的私人融资。 Genomics有限公司是英国牛津大学的一家衍生公司，正在开发一个基因组序列数据分析平台。该公司创始人之一彼得·唐纳利是牛津大学教授，同时也是威康信托基金会以及吉尔麦卡文金融集团人类遗传学中心主任。以上两个金融集团的人类遗传学中心皆由牛津纳米...
IBM开发新型纳米测序仪，实现更低成本！
IBM的T.J.Watson研究中心与亚利桑那州立大学（ASU）生物设计研究所合作开发一款新型测序仪，希望让基因组分析成为一种常规实验分析。 亚利桑那州立大学物理学教授Stuart Lindsay说：“我们的目标是，让每个医生的办公室里都有功能完备但廉价、易用的DNA测序设备。”价格廉价测序仪能使基因组测序广泛应用...
测序技术CPT-seq：转座酶拯救测序短读取
现在绝大多数DNA测序仪生成的是短序列读取。虽然它们的效率很高，但有许多生物学问题是短片段解决不了的，需要更长的序列信息。日前，Illumina公司的Frank Steemers领导研究团队找到了一个简单的解决办法。他们用一种转座酶把短片段暂时结合起来，保留了序列顺序或邻近性（contiguity）。 在基因组DNA上，不同个体的单碱基差异被称作单核苷酸多态性（SNP）。相邻S...
IBM与ASU联手开发出低成本的测序仪
亚利桑那州立大学（ASU）的Biodesign研究所和IBM的Thomas J. Watson研究中心的科学家已开发出一种DNA测序的原型设备，能够让全基因组分析成为医学中的日常实践。 “我们的目标是将便宜、简单而强大的DNA和蛋白诊断设备放到每位医生的办公室中，”ASU的物理学教授Stuart Lindsay谈道。这种技术将迎来个性化医疗的时代，...
奇点大牛再爆料：5年后基因测序成本仅1毛
11月24日，奇点大学生物技术和信息学项目负责人Raymond McCauley在太庙正殿举行的百度BIG课堂上，向大家讲述生物技术的现实和可预期的未来应用。McCauley的主要研究方向是低成本生物技术应用，在他的研究里，生物技术并不只属于科研人员，每个普通人都可以使用它，而随着生物技术成本的降低，未来的普通人用生物技术来提升生活质量，可能就像今...
Fluidigm推出高通量单细胞mRNA测序流程
Fluidigm公司近日在美国神经科学学会的会议上宣布推出一个新流程，能实现高通量的单细胞mRNA测序。这个流程综合了集成流体通路（IFC）设计的显著进步，可大规模提高通量和易用性，同时降低单细胞制备的成本。据介绍，商业化的产品有望在2015年上半年推出。 Fluidigm的CEO Gajus Worthington...
《转》访傅启华：下一代测序技术在罕见病分子诊断中的应用
深秋，一个阳光明媚的下午，我们如约来到上海儿童医学中心。一进医院大厅就感受到了别样的氛围，很多家长带着孩子在医院看病，虽然人多嘈杂但整体还比较有秩序。 在儿科转化医学研究所见到了傅老师，傅老师为人热情、谦逊，整个专访在轻松的氛围中进行。 转化医学网：作为一所儿科转化医学研究所，相比其他的转化医学中心有什么特点或优势？ 傅启华：我们面对...
盘点：新一代测序，今年又有啥变化
花开花落，又是一年，是时候盘点一下新一代测序领域的新变化了。自今年2月份以来，测序仪并没有太大的变化，但也不是说一切都是老样子。新的样品制备仪器正揭开面纱，而测序读长更是逆了天。 罗氏454 454生命科学曾在2013年宣布，计划在2015年停止测序硬件的销售。据罗氏诊断的测序销售经理Susan Ulanowicz介绍，该公司将支持其硬件直到20...
Sanger团队成功测序人脑绦虫
惠康基金会Sanger研究所为中心的研究机构对欧猥迭宫绦虫进行了测序和蛋白组学的草图绘制，研究样本来自病人大脑中匍匐着的绦虫。 根据研究团队今天在Genome Biology 网络版的报告，研究人员通过针对性条码基因测序技术找到了引起患者症状的脑绦虫，该患者年龄为50岁并长期患有头痛和神经疾病。研究人员对绦虫样本进行了基因组测序，得到了一个总数据量高达1260万的欧猥迭宫绦虫基因组装配草...
埃博拉基因测序难为“无米之炊”
随着埃博拉病毒横扫西非，科学家缺乏重要基因数据来解答引发众多担忧的猜测：这种病毒会变得更具传染性和更致命吗？它会发生变化，让其逃避诊断测试或疫苗吗？非洲和欧洲实验室的冰箱里存放着取自埃博拉患者的数千份血液样本，但它们并未被使用，且少数几个获得新基因数据的研究小组并未公开信息。 研究人员渴望近距离观察病毒可能是如何进化的。英国爱丁堡大学研究传染病的进...
CG新技术在罕见病诊断上的应用
罕见病，顾名思义，是指那些仅发生在极少数人身上的罕见疾病。大部分的罕见病都是慢性的遗传疾病，由突变或遗传的基因缺陷而引起。就目前而言，许多罕见病都缺乏有效的治疗手段和资源，且往往非常严重，因此，罕见病的诊断和预防就显得十分重要。 2014年11月7日，第二届国际罕见病研究联盟会议在深圳福田大中华喜来登酒店召开。来自欧洲、美洲、非洲和亚洲的超过600...
雪貂基因组测序加深人类疾病研究
近日，一个国际研究团队进行了雪貂基因组测序,他们认为这将巩固雪貂作为研究人类呼吸道疾病如流感和囊性纤维化的生物模型。 研究人员检查了雪貂感染大范围流感病毒后基因随着时间推移的不同表达，通过研究囊性纤维化雪貂模型反映了人类疾病的发展。 基因分析中心的合著人Federica Di Palma在一份声明中表示“通过创建一个...
高通量测序的十年：从科研进入临床
高通量测序的推出背景： 2004年全球多个国家共计预算30亿美金的人类基因组测序完成以后，发现单单完成一个人的基因组序列还远远不足以理解人类自身及疾病的机理。由于有了已经完成的人类基因组当做参考基因组，采用廉价、快速的方法对多个样本、群体、病种基因组的比对测序就能提供大量有价值的科研和临床信息。这就要求测序价格足够低、速度足够快，然而对测序结果是否易于拼接、组装基...
【人类基因组计划】解密上帝的语言 天使or魔鬼？
DNA测序时代开始 虽然早在1953年，沃森和克里克就发现了不朽的DNA（脱氧核糖核酸）双螺旋结构，但是长久以来，人们始终都找不到很好的办法测定DNA中四种碱基——A（腺嘌呤）、T（胸腺嘧啶）、G（鸟嘌呤）、C（胞嘧啶）——的排列顺序。 上帝的语言是如此的小，还没有人看得到，天才，鬼才就是为大问题而生的。咿~呀~ ...