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【CELL DISCOV】西湖大学郭天南等团队结合高通量蛋白质组学和人工智能评估甲状腺结节良恶

2022-09-09

9月6日,西湖大学郭天南和李子青团队联合新加坡国立癌症中心研究人员在Cell Discovery 发表了一篇题“Artificial intelligence defines protein-based classification of thyroid nodules”的研究论文。该团队开发了一种人工智能定义的蛋白质生物标志物组别用于诊断甲状腺结节分类。 研究背景 01 先...

【Science子刊】科学家确定了三种蛋白质:可在心脏病发作后维持心脏功能

2022-09-02

该研究发表于《Science Translational Medicine》上,它的阳性临床前数据概述了这三种蛋白质的机制,这些蛋白质已被证明可以在小鼠心脏病发作后恢复其心脏功能。 https://www.science.org/doi/10.1126/scitranslmed.abo0699 “搜索引擎”Funsel  01  ...

【Cell子刊】蛋白质RAF1的结构揭示:开发抗肺癌新药的关键步骤

2022-09-02

9月1日发表在《Molecular Cell》上的一项新研究的结果为设计RAF1降解剂打开了一扇机会之窗,这些降解剂无论是单独使用还是与KRAS抑制剂联合使用,都可以在KRAS癌基因诱导的肺腺癌患者中产生重要的治疗效果。 https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1097276522007973?v...

【Nature子刊】环状RNA新进展——提高蛋白质产量

2022-08-16

发表在《Nature Biotechnology 》杂志上的一份新报告中,Robert Chen和美国加利福尼亚州斯坦福大学的一组跨学科研究人员开发了一种系统的方法,可以快速组装和测试基于合成环状RNA影响蛋白质生产的特征。该团队通过优化精细元素,最大限度地提高了环状RNA的翻译,以实现设计原则——将环状RNA的产量提高了几百倍。与信使RNA(mRNA)水平相比,该结果促进了感兴趣的RNA的...

【Nature子刊】胶原蛋白——乳腺癌转移的关键因子

2022-08-14

想象癌细胞是种子,肿瘤微环境是土壤。通过研究土壤、细胞外基质、我们可以开始了解是什么让一些肿瘤比其他肿瘤更具侵略性,并通过扩展,开始开发治疗癌症的新方法。研究表明,胶原蛋白XII在乳腺癌进展和转移中起着重要作用。该研究发表在《Nature Communications》杂志上。 https://www.nature.com/articles/s41467-022-3...

2nd Westlake Proteomics Webinar | 蛋白质组学和甲状腺疾病

2022-08-04

西湖欧米携手西湖大学、西湖实验室、Guomics,iMarker Lab, HPP2.0-PDPM,举办 “Westlake Proteomics Series” 研讨会,系列研讨会由SCIEX中国协办。 继抗生素引发的第一代医学治疗技术革命和影像学、分子医学主导的第二代医学诊断技术革命,如今以蛋白质组学驱动的精准医学为中心的精确诊断与精准治疗统一正在引发第三代...

【Nature】重大飞跃:人工智能预测几乎整个“蛋白质宇宙”!

2022-07-29

AlphaFold工具已经确定了大约2亿种蛋白质的结构,这些蛋白质来自地球上几乎所有已知的生物体。该研究发布于《Nature》。 https://www.nature.com/articles/d41586-022-02083-2 蛋白质的3D形状 01 从现在开始,确定几乎所有科学已知的蛋白质的3D形状将像使用搜索...

【Cancer Cell】癌细胞通过产生独特形式的胶原蛋白来逃脱免疫反应!

2022-07-22

这项研究建立在先前发表的研究结果的基础上,阐述了对成纤维细胞和癌细胞产生的胶原蛋白独特作用的新理解。该研究发布于《Cancer Cell》。 https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1535610822002756?via%3Dihub 研究背景  01  在正...

【Science 子刊】新发现!癌症转移的奥秘——蛋白质折叠背后的机械力量

2022-07-20

发表于《Science Advances》上的一篇论文,向我们表明当肿瘤抑制DCL1缺失时,talin在激活细胞扩散方面起着作用。当DCL1与talin结合时,它又似乎阻止了talin激活细胞扩散的行为。该研究由威斯康星大学密尔沃基分校(University of Wisconsin-Milwaukee)的一组研究人员开展。在研究过程中,科学家们研究使用了一种独特的工具——磁性镊子。 ...

【Cell子刊】千万别打扰了蛋白质的“懒散”凝聚——新角度探索疾病机制

2022-07-14

近几十年来,由于基因组学的发展,人们知道了许多疾病是由基因突变所引发的。然而,研究者们依然没有完全弄清楚突变是如何导致了疾病的发生——突变究竟改变了细胞内部的什么物质,进而引发了疾病症状?找出这个问题的答案,即疾病机制(disease mechanism),不仅有助于我们加深对疾病的了解,也对疾病的治疗及预防至关重要。比如,若已知某一个突变产生了某种有缺陷的蛋白质,并由该蛋白引发了某种疾病;...

IsoPlexis单细胞功能蛋白组技术——开启单细胞免疫功能新视界

2022-07-05

细胞的异质性广泛存在于生物体内。过去由于技术限制,传统研究手段一般只能针对组织或细胞群体进行分析,得到的是大量细胞的均质化的结果,而无法精确反映不同细胞个体对于结果的具体贡献值,从而可能忽略在生理或病理活动中起关键作用的因素。 单细胞测序技术实现了在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组进行高通量测序,能够揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,是研...

【即将开播】新一代蛋白组技术助力肿瘤精准诊疗网络研讨会,7月6日下午三点,欢迎收看!

2022-07-04

精准医疗研究主要利用先进的基因组学、蛋白质组学等前沿生物信息学分析方法与科学技术,对一些较为重要的大型样本中特定人群分别进行生物标志物的筛选、论证与综合应用,通过检测特定的标志物不同时期的实际情况,最终实现个性化的精准诊疗。循环生物标志物是一种重要的非侵入性指标,为疾病早筛、预后诊断和疗效检测等提供数据支撑,是精准医疗发展的关键方向。蛋白组不仅是生命功能的承担者,还是药物的重...

【Nature】操纵关键蛋白——逆转胰腺癌扩散!

2022-06-30

发表在《Nature》上的研究“GREM1 is required to maintain cellular heterogeneity in pancreatic cancer”表明,一种名为GREM1的蛋白是调节胰腺癌中发现的细胞类型的关键——操纵其水平既可以助长也可以逆转这些细胞转变为更具侵袭性的亚型的能力。研究人员相信这一根本性的发现最终可以为新的胰腺癌治疗方法铺平道路。 ...

网络研讨会 | 新一代蛋白组技术助力肿瘤精准诊疗

2022-06-30

会议背景 精准医疗研究主要利用先进的基因组学、蛋白质组学等前沿生物信息学分析方法与科学技术,对一些较为重要的大型样本中特定人群分别进行生物标志物的筛选、论证与综合应用,通过检测特定的标志物不同时期的实际情况,最终实现个性化的精准诊疗。循环生物标志物是一种重要的非侵入性指标,为疾病早筛、预后诊断和疗效检测等提供数据支撑,是精准医疗发展的关键方向。蛋白组不仅是生命...

【Cell子刊】新冠病毒25种“内部”蛋白质,或将成为疫苗新靶点

2022-06-27

目前,不管是研究人体对SARS-CoV-2病毒的免疫力,还是探索新冠疫苗开发,刺突蛋白及其他病毒表面蛋白的抗体反应一直是研究者所关注的重点。但是,对于免疫力和疾病预后来说,能识别病毒内部蛋白质的抗体,也同等重要。近日,来自匹兹堡大学、佐治亚理工学院和埃默里大学的研究者完成的一项新研究支持了这个说法。 此项研究题为“Antibodies targeting conserved n...

【Science】改善蛋白质功能既能开发新药,又有无限的应用前景!

2022-06-26

瑞典卡罗林斯卡医学院和SciLifeLab的研究人员在《Science》上发表的一项研究“Small-molecule activation of OGG1 increases oxidative DNA damage repair by gaining a new function”中描述了他们如何提高蛋白质修复DNA氧化损伤的能力,并创造出一种新的蛋白质功能。他们的创新技术可能会导致针对...

【Science子刊】不伤害健康干细胞!阻断特殊蛋白质以靶向白血病干细胞!

2022-06-24

英国每年有超过3000人被诊断为急性髓系白血病(AML),包括100名儿童。确诊后,带有不良遗传标记的人只有15.3%的机会存活超过五年。尽管研究导致人们对该疾病的理解水平提高,但包括AML在内的急性白血病的主流疗法多年来基本保持不变。它们通常涉及化疗和干细胞移植等治疗,可能会产生严重的副作用。 他们发表在《Science Translational Medicine》上的研究“...

【Cell子刊】免疫细胞帮助促进肿瘤生长?肿瘤产生的蛋白改变了免疫细胞的攻击!

2022-06-22

研究人员重点研究了肿瘤微环境——肿瘤招募的血管和其他细胞的生态系统,为它们提供营养物质,帮助它们生存。“肿瘤也招募免疫细胞,”Cedars-Sinai的研究科学家、放射肿瘤学和生物医学科学助理教授、该研究的资深作者Jlenia Guarnerio博士说。“这些免疫细胞应该能够识别并攻击肿瘤细胞,但我们发现肿瘤细胞分泌一种改变其生物学特性的蛋白,所以它们实际上不是杀死肿瘤细胞,而是做相反的事情...