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【研究】韩国研究人员绘制了SARS-CoV-2转录组结构图
研究人员表示,他们使用了两种互补的测序技术来绘制SARS-CoV-2转录组和表位转录组的高分辨率图。他们发现,Illumina和MGI平台等合成测序(SBS)方法具有较高的准确性和覆盖率,但读取长度短。他们补充说,尽管基于纳米孔的直接RNA测序(DRS)的测序准确性受到限制,但它可以进行长读测序,这对于分析长嵌套CoV转录本特别有用。而且,由于DRS可以检测RNA而不是cD...
【新成果】周强工作室首次解析新冠病毒细胞表面受体ACE2的全长三维结构
导读:昨日,西湖大学周强实验室在Science杂志上发表了一篇关于新冠病毒的最新研究成果,首次解析了新冠病毒细胞表面受体ACE2的全长三维结构,以及表面蛋白S受体结合结构域与细胞表面受体ACE2全长蛋白复合物的三维结构。 SARS-CoV-2是一种正链RNA病毒,可引起人类严重的呼吸综合症。产生的冠状病毒病(COVID-19...
元码基因启动肿瘤样本免费三代测序结构变异检测计划
肿瘤的临床诊疗方案中,靶向治疗、免疫治疗、联合治疗已经逐渐成为主流治疗方案。而通过基因测序为临床肿瘤提供更加精准的伴随诊断和个体化用药指导,已经成为必不可少的手段。 现行的主要的基因检测技术包括:PCR方法、一代测序、二代测序等,二代测序因其高通量、高性价比、技术成熟、一次性同时检测大量的肿瘤突变,而越来越被临床所接受,更多基于NGS的IVD产品也将逐步获批。元码基...
肠道∙视点 | 人体肠道微生物的第一批拓荒者&菌群结构成型的几次关键节点
首先向以下研究内容的科研工作者致敬! 人类肠道微生物第一批拓荒者来源于哪里? 一直以来,科学界都认为胎儿是无菌的!然而,一些科学家已经找到一些证据,人类胎盘可能含有细菌,这意味着胎儿并非是在一各绝对无菌的环境中生长。 受孕后不久,人类胚胎便开始形成对其生存至关重要的器官。胎盘既是生命线又是监护人:它将母亲血液中的氧气,营养素和...
科研 | 剪接体全体结构破译指日可待 ——施一公团队再发Science解析完全组装剪接体激活前结构
导读 大家都在高中生物课上学过遗传信息传递的中心法则——DNA被转录生成信使RNA,信使RNA被翻译成蛋白质(其中DNA和RNA都可以自我复制)。如果你进一步学过分子生物学或生物化学,知道真核生物DNA基因的不连续性,它们包括编码蛋白的外显子和不编码蛋白的内含子。因此,遗传信息从DNA到RNA(称pre-mRNA,前体信使RNA)后,需要经历内含子剪除和外显子拼接,这一过程被称为...
Science丨施一公组报道酿酒酵母pre-B complex状态剪接体电镜结构
5月25日凌晨,Science在线发表了施一公课题组题为“Structures of the fully assembled Saccharomyces cerevisiae spliceosome before activation”的研究论文,解析了酿酒酵母平均分辨率分别为3.3-4.6 Å以及3.9 Å的催化前复合物B complex状态(pre-B complex )和...
重大成果 | Nanopore测序精准鉴定基因组结构变异,让全外显子组检测阴性案例得到确诊,为PGD提供重要参考
导 读 中南大学生殖与干细胞工程研究所、中信湘雅生殖与遗传专科医院的张前军研究员与希望组首席科学家王凯教授等带领的团队采用Nanopore测序技术,在一例全外显子组检测阴性的患儿中精准鉴定出基因组结构变异,不仅对患儿进行了确诊,同时还明确了结构变异的来源,从而为胚胎植入前遗传学诊断提供了重要参考,帮助夫妇成功生育...
长读长测序再显优势!基因组复杂结构变异检测实现新突破!
基因组结构变异是很多癌症、遗传病等疾病的重要诱因。目前基于二代测序技术检测基因组结构变异存在很大的局限性,而三代测序存在错误率较高等多种问题,尤其针对复杂结构变异大多软件识别能力较差。针对这一问题,近日,在Nature Methods发表的一项最新研究中,研究人员开发了基因组比对工具NGMLR和结构变异识别工具Sniffles,为变异检测提供了前所未有的灵敏度和精确度,即使在重...
Cell|重大进展,清华-北大联合中心王宏伟首次揭示人类Dicer及其与Pre-miRNA底物复合物的冷冻电镜结构
iNature:2018年4月26日,清华北大联合生命科学研究中心王宏伟课题组等人在Cell 上在线发表了题为“Cryo-EM Structure of Human Dicer and Its Complexes with a Pre-miRNA Substrate”的研究论文,在这项工作中,研究人员解决了与其辅因子蛋白TRBP复合的hDicer的冷冻电镜(cryo-EM)结构,并揭示了hD...
颜宁2017年首篇《Cell》文章:脂类转运蛋白ABCA1三维结构
颜宁研究组一直以来都在针对胆固醇代谢调控通路进行系统的结构生物学与生物化学研究,在近年开始取得进展。去年其研究组在Cell上发文,报道了人源胆固醇胞内转运蛋白NPC1的冷冻电镜结构,在此基础上,他们又首次解析了人源ABCA1全长蛋白的近原子分辨率冷冻电镜结构,为理解ABCA1作用机制及相关疾病致病机理奠定了重要基础。 人源ABCA1蛋白的结构模型及其介导磷脂外向转运和初生H...
结构升级or业务凋敝:2017生物行业裁员风波将走向何方
就在这几天JPM健康年会召开之际,美媒相继爆出三条消息,在全球顶尖癌症研究所MD安德森癌症中心宣布裁员超过900人之后,诊断领域新秀Counsyl与个性化医疗公司Cancer Genetics在6日与7日相继公开了裁员消息。其中,Counsyl宣布将裁减该公司约5%的员工。 经历去年下半年连续数月亏损超过1亿美元之后,肿瘤科室全美排名第一的MD安德森癌症中心终...
施一公等在《科学》发文报道酵母剪接体三维结构
2016年12月16日,清华大学生命学院、结构生物学高精尖创新中心施一公教授研究组于《科学》(Science)杂志就剪接体的结构与机理研究再发长文(Research Article),题为《酵母剪接体处于第二步催化激活状态下的结构》(Structure of a Yeast Step II Catalytically Activated Spliceosome),报道了酿酒酵母(Saccharom...
JMC:科学家成功改造抗癌药物结构 增强血脑屏障穿透能力
来自美国约翰斯霍普金斯大学的科学家们对一种实验性药物的结构进行了改造,增强了这种药物穿过血脑屏障的能力,该研究以猴子为实验模型。相关研究结果发表在国际学术期刊Journal of Medicinal Chemistry上。 这种叫做DON(6-重氮-5氧代-L- 正亮氨酸)的实验性抗癌药物是从70多年前在秘鲁土壤发现的一种细菌中培养获得,这种药物能...
NatureGenetics:DNA高级结构研究发现癌症靶向治疗新大陆
基于其先前关于DNA二级结构G-四链体测序技术的研究,美国哥伦比亚大学的研究人员应用染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)鉴别了包括癌症相关基因在内大约10000个高转录基因调控区、激活子区以及5'非编码区的G-四链体结构(G4)。 “DNA中所含有的G-四链体结构与癌症有着多种不同的联系,但是这其中的大部分联系目前还仅仅处于假设,”...
Nature重磅: 揭秘小鼠失活X染色体结构特征
2016年7月18号,安诺优达与法国居里研究所等机构合作,利用Hi-C技术解析了小鼠失活X染色体结构特征,相关的研究成果发表在国际顶级期刊Nature上。 X染色体失活(XCI)引起X染色体结构重塑,转变成沉默的异染色质;在雌性哺乳动物发育中,X染色体失活由两条X染色体中一条的非编码RNA Xist发生上调引起。 本文在小鼠神经前体细胞(NPCs)和胚胎干细胞中...
世界首次!颜宁、高福等科学家解析出NPC1蛋白结构
近日,清华大学颜宁课题组与中国疾控中心、中科院微生物组高福院士课题组合作的一项最新成果,在世界上首次解析出NPC1蛋白的清晰结构,并初步揭示了它的工作过程,从而为干预、治疗罕见遗传疾病“尼曼—皮克病”和埃博拉病毒打开了新大门。 颜宁教授过去9年一直针对胆固醇代谢调控通路进行系统的结构生物学与生物化学研究,高福院士一直从事包括...
看看医疗健康产业有哪些结构性机会?
2009年新医改实施后,医药市场出现了几年高速成长。随着医保广覆盖过程的结束,行业增速有所回落,但从中长期看来,医疗健康产业依然是投资机会最确定的板块之一。从国际经验看,人口老龄化、城镇化、疾病谱变化、居民保健意识增强等因素决定了医疗健康产业会保持较高的增长速度。根据中国国家统计局和世界银行统计数据,2014年我国卫生支出占GDP的比重为5.55%,而美国为...
Science重要突破:寨卡病毒结构得以确定
最近几个月,寨卡病毒(Zika virus)在拉美国家呈现爆炸式蔓延。这种病毒感染后的症状很像感冒,也就是发烧和肌肉关节疼痛。随着寨卡疫情愈演愈烈,医生们发现一种严重神经疾病(格林—巴利综合征)突然增多,“小头婴”的出生率也显著提高。不过人们对这种病毒及其引发的问题还知之甚少。 浙江省疾控中心2月27日发布消息称,浙江省已经成功...
光遗传技术为细胞结构研究带来机遇
转基因斑马鱼胚胎上的闪亮蓝光让科学家选择性地激活光敏感转录因子。图片来源:图片来源:Anna Reade 从现在开始10年后,这种技术将会成为发育生物学和细胞生物学界人人使用的工具。 打开一个小冰箱模样的培养器,看着里面闪烁的蓝光,这种场景经常让他想起上世纪70年代的美国纽约迪斯科舞厅。“一些有...
美院士首次揭示DNA超螺旋的三维结构
最近,美国贝勒医学院的研究人员,使用一种多学科的方法,以前所未有的细节,揭示了超螺旋DNA的三维结构影像图,从而发现它的形状比著名的双螺旋更加动态。相关研究结果发表在最近的《Nature Communications》。 分子病毒学和微生物学系的Lynn Zechiedrich教授和美国科学院院士、生物化学和分子生物学系的W...
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