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癌症相关的变异基因数据集问世
据《Cancer Research》报道:国际癌症研究所的科学家们产生了一组癌症相关的变异基因数据集,并将这些数据提供给研究使用。 这将帮助研究者们更好的理解药物应道及抗癌治疗。 Yves Pommier表示:“目前为止,这是全球最大的数据库,包含了60亿个连接药物和基因变异的数据,变异基因数据主要来自于9个器官组织的细胞系,包括胸腺,...
李亦学的科研数据共享之梦:莫让数据封闭 “锁”住创新
上海生物信息技术研究中心主任李亦学的“科研数据共享之梦”已做了13年。但在昨天举行的首届金桥产业技术创新会议上,当记者向他问及相关进展时,听到的却是一声叹息。 13年前,“大数据”尚未被任何字典收录,而今却被公认是全球生命科学研究的核...
7种大数据方案:重塑医疗行业
怀疑主义是一把双刃剑。如果没有怀疑主义的话,IT经理可能会去投资那些没有用处的软件。足够的怀疑,可以让IT部门等待足够的证据,以证明特定的平台可以带来好结果。 医疗行业的数据分析到达临界点 大数据分析现在已经到达了医疗行业的临界点。一些供应商承诺在减少开支的同时,会提供更好的医疗质量,但有证据表明这些说法是有争议性的。同样,一些...
基因数据共享:揭示疾病病因 提升公众健康水平
本月月初,来自40个国家的研究人员和提倡者成立了一个全球联盟来开启安全共享的基因组和临床数据库,目的是为了在这个时代结束时可以使人类能够利用遗传数据。 英国政府,凯萨医疗机构及美国共同努力收集和整理了大量的遗传数据。但是随着全球的联盟,有一天临床医生可以广泛使用遗传数据,全世界的研究者可以分析遗传数据这似乎是可能的。这对科学和医学来说具有巨大...
冰岛基因公司数据挖掘计划泡汤
因采集冰岛人DNA用于发现基因和疾病之间关系而著名的基因解码公司遇到了一个棘手问题。近日,《科学》杂志报道称,冰岛负责监督数据保密性的国家机构驳回了基因解码公司的请求——该公司希望可以使用计算机方法分析该国的宗系记录,以估算28万名并未同意参与该公司的研究,且将数据与医院记录相连接的冰岛人的基因型。 在创始人兼首席执行官Kári Stefán...
基因大数据:将改变人类的未来
由中美创新协会, 北京市科协和动点科技三方联合举办的“Big Data Innovation Summit”在北京国际会议中心拉开帷幕。而在本次峰会上,来自华大基因首席运营官尹烨的演讲赢得了观众的“满堂彩”。 尹烨跟大家分享了大数据基因对我们的生活带来的影响。他认为,大数据这个词现在有点“泛滥”,甚至很多人错误地理解为数据大就是大数...
基因大数据:将改变人类的未来
由中美创新协会, 北京市科协和动点科技三方联合举办的“Big Data Innovation Summit”在北京国际会议中心拉开帷幕。而在本次峰会上,来自华大基因首席运营官尹烨的演讲赢得了观众的“满堂彩”。 尹烨跟大家分享了大数据基因对我们的生活带来的影响。他认为,大数据这个词现在有点“泛滥”,甚至很多人错误地理解为数据大就是大数...
Nature:遗传学家推动全球数据的共享
国际性组织致力于促进数据交流,并将DNA序列信息和临床资料之间关联起来。 在基因组医学领域中存在一个令人头痛的矛盾现象,尽管人们普遍赞同临床医生与遗传学家应当交换更多的研究资料,但是很少有人采取行动来实现这一目标。 目前,来自13个国家的69个研究机构组成一个联盟,希望通过创建一个组织来促进基因组医学领域中信息的自由流通,从而解...
Nature网站专栏文章:未来基因组数据泄露不可避免
Steven Brenner是加州大学伯克利分校的遗传学教授。他的实验室主要涉及计算与实验基因组学的四个主要研究方向:可变剪切的基因调控与无义介导的mRNA讲解;利用贝叶斯系统生物学预测蛋白质功能;医学及环境宏基因组学;结构基因组学与蛋白质复合物。Brenner在Nature网站撰写专栏文章,认为随着基因组学的发展,在未来基因组信息的泄露是...
加拿大:建成首个人类小分子代谢物数据库
加拿大阿尔伯塔大学的研究小组日前宣布,他们建成了世界上首个人类小分子代谢物组数据库。专家认为,这将对许多传染病、遗传病或环境引发的疾病的诊断、预防和监测产生重大影响。 人类小分子代谢物组是所有人体内产生的小分子代谢物的总称,是化学意义上的“人类基因组”。科学家认为,如果说人类基因组描绘了生命的蓝图,那么就可以讲小分子代谢物组展示的是生命的成分...
DNA数据:商家精准营销新手段
你的基因信息中是否透露出你可能患有“乳糖不耐症”?商家根据这样的信息来向你提供“舒化奶”的优惠券。你的基因信息透露出你中年可能会秃头?商家广告可能会显示洗护用品的促销信息。日前,一家美国的创业公司Miinome计划打造全球第一个“人类基因会员市场”,换句话说就是向市场营销人员销售用户的DNA数据。 我们这个时代信息爆炸了,DNA数据自然也不例...
李嘉诚:关注健康大数据 在牛津大学捐建健康资讯及研发...
英国首相卡梅伦和香港长实主席李嘉诚亲临牛津大学,为坐落牛津校园的全球首个「大数据」科研基地主持开幕典礼。李嘉诚基金会捐资2,000万英镑成立「李嘉诚健康资讯及研发中心」,连同英国高等教育资助议会投入的1,000万英镑展开大数据研究,要把英国的医疗保健发展推进至世界最前端。 图:英国首相卡梅伦和李嘉诚先生为牛津大学「李嘉诚健康资讯及研发中心」主持开...
互联网新业务:用云计算进行基因组测序数据分析
越来越多的生物信息公司开始走向网络,他们为医院提供了大量的基因组分析平台和软件工具。 对于美国纽约犹太人罕见遗传病研究中心(Center for Rare Jewish Genetic Disorders in New York)遗传咨询服务部门的经理Chaim Jalas来说,DNA测序实在是一件太简单不过的工作了。现在平均一个人的基因组测...
美国人脑连接组研究计划:发布第一批数据
近日,美国人脑连接组计划(Human Connectome Project,HCP)研究人员对外公布了第一批研究数据。据HCP网站介绍,此次公布的数据包括来自68位健康成人志愿者的脑部扫描图像以及个体性格、认知能力、情感特征和感知功能等行为信息,数据量达到了两万亿字节(2TB)。所有感兴趣的研究人员可以免费向HCP研究小组申请获得这些数据。 ...
深圳:大数据产学研联盟成立 华大基因为发起单位之一
昨日,深圳大数据产学研联盟揭牌成立。由深圳市科技创新委与南山区政府共同主办的第三届南山科技经济论坛暨中国大数据产业峰会也同期举行。 据介绍,联盟吸纳深圳大数据行业的骨干企业、核心企业,与国内相关领域的优势高校、科研机构等共同建立公共技术和服务平台。联盟有深圳清华大学研究院、深圳先进院、...
大数据分析基因序列 翻开医疗行业新篇章
据 TC 报道,曾从 Google 和 Dropbox 获得风险投资的 Bina Technology 近日又再次收获 650 万美元融资。这笔资金将平分为两部分,一部分用于研发部门扩张,一部分用于经营部门的扩张。 Bina Technology 组建于 2011 年,但上个月才真正开业。创业团队的平均学识无人能出其右,均是来自斯坦福大...
大数据福音 :建立数据库 癌症治疗水准大大提高
大数据福音 :建立数据库 癌症治疗水准大大提高 --美国肿瘤学会收集十万治疗数据建数据库 3月27日消息,据国外媒体报道,美国临床肿瘤学会(American Society of Clinical Oncology,简称ASCO)正在启动一个雄心勃勃的项目,将收集数以十万计癌症患者的治疗数据,并用它来指导美国卫生保健系统其他患者的治疗。 ...
H3与华大基因联合开发、共享基因组数据 助力癌症药物研发
2013年3月21日,一家致力于肿瘤治疗研发的生物制药公司——H3生物医药(H3 Biomedicine)与全球最大的基因组学研究机构——华大基因,联合宣布双方在临床前癌症模型测序及相关基因组数据共享方面达成一致协议。本研究旨在识别及验证可用于药物治疗的潜在靶点——复发性基因突变,这将对整个肿瘤药物研发产业起到至关重要的作用。本着各自在开放式研究方...
Illumina:85%的台式测序数据来自MiSeq
AGBT 2013,目前规模最大的测序技术会议,于2013年2月20日-23日在美国佛罗里达州马可岛举行。与以往三届不同,今年的AGBT似乎有些平淡。2010年,PacBio和Ion Torrent发布了他们的测序技术;2011年,台式测序仪MiSeq和PGM独领风骚;去年,Oxford Nanopore揭开了MinION和GridION的面纱。 ...
Science:供研究用的匿名遗传数据可泄露个人信息
那些发布在网上用于科研的个人遗传信息(来自1000多人的数十亿DNA信息)看起来是绝对匿名的,但是对一个遗传学研究者来说,他只要在网络上进行一些聪明的搜索,就能确定他随机选出来的5个人的身份。不仅如此,研究人员还可以挖掘出这些人的整个家族,即使这些人的亲属并没有参与到这项研究中来。 该研究人员没有透露他发现对象的姓名,这看上去保护了测序对象的隐私权...
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