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专家访谈
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重大突破！科学家Cell发文开发出空间多组学新技术，首次实现组织内3D基因组与基因表达的同步测绘
近日，国际顶级学术期刊《Cell》发表了一项革命性的研究成果：由宾夕法尼亚大学、华盛顿大学等机构联合研发的“空间Hi-C-RNA”技术，首次实现了在同一组织切片上，近乎单细胞分辨率地同步绘制全基因组染色质构象和转录组图谱。这一突破为理解发育、疾病中的基因组结构与功能关系提供了全新框架。 图形摘要 从“拆解”到“原位”：破解基因组调控的空间密码 ...
【倒计时1天】告别浅层机制分析，Stereo-seq 解锁 3D 时空组学破局思路，6月29日开播，不见不散！
做时空组学的你，是否一直深陷科研困境？ 在空间转录组科研飞速发展的当下，绝大多数研究者仍局限于二维切片数据分析。组织立体结构缺失、细胞互作解析片面、机制挖掘浮于表面，耗费大量时间做实验、分析数据，最终课题毫无创新、文章深度不足，高分成果遥遥无期。 随着组学技术迭代升级，3D时空多组学已然成为发育机制研究、高分课题创新的核心突破口。相较于二维平面研究，三维...
【科研直播预约】告别机制浅层分析！全方位解锁 3D 时空组学科研破局思路，6月29日不见不散！
做时空组学的你，是否一直深陷科研困境？ 在空间转录组科研飞速发展的当下，绝大多数研究者仍局限于二维切片数据分析。组织立体结构缺失、细胞互作解析片面、机制挖掘浮于表面，耗费大量时间做实验、分析数据，最终课题毫无创新、文章深度不足，高分成果遥遥无期。 随着组学技术迭代升级，3D时空多组学已然成为发育机制研究、高分课题创新的核心突破口。相较于二维平面研究，三维...
可高效捕获循环肿瘤细胞并保持细胞活力！武汉大学等单位合作发文：开发出一款新型3D纤维素支架
3月17日，武汉大学/湖北中医药大学/武汉大学中南医院研究团队在期刊《Advanced Science》上发表了研究论文，题为“Capture and Culture of Circulating Tumor Cells Using a Biodegradable 3D Scaffold for Patient-Derived Xenograft Construction”，在这项研究中，研...
香港中文大学黎曦明团队打造INSIHGT，开启多模态3D生物学新时代！
2024年12月24日，香港中文大学医学院黎曦明教授团队在期刊《Nature Communications》上发表了题为“INSIHGT: an accessible multi-scale, multi-modal 3D spatial biology platform”的研究论文。通过INSIHGT，团队绘制出了小鼠肾小球中未描述的荚膜到顶叶上皮细胞微丝和人类小脑中神经丝密集包涵体的图谱...
【Science子刊】湘雅医院陈翔团队创新：声学虚拟3D支架，助力肿瘤免疫细胞直接共培养系统
2024年11月22日，中南大学湘雅医院皮肤科陈翔教授团队在期刊《Science Advances》上发表了题为“Acoustic virtual 3D scaffold for direct-interacting tumor organoid–immune cell coculture systems”的研究论文。团队利用AV-Scaf建立了无支架的黑色素瘤和乳腺癌器官组织，并将黑色素瘤...
【Nature】美国华盛顿大学丁莉团队：揭示肿瘤在2D与3D空间中的进化策略和微环境互动
2024年10月30日，美国华盛顿大学医学院丁莉团队在期刊《Nature》上发表了题为“Tumour evolution and microenvironment interactions in 2D and 3D space”的研究论文。团队通过共同注册来自16个样本的48个连续ST切片来重建3D肿瘤结构，这提供了对肿瘤空间组织和异质性的见解。此外，使用无监督深度学习算法并整合ST和COD...
【类器官与生物3D打印论坛日程】中国类器官转化医学大会11月15-16日在上海举办，诚邀您的参与！
论坛背景 类器官技术通过利用成体干细胞或多能干细胞进行体外三维培养，模拟人体组织的结构和功能，为生物医药领域带来了革命性的变革。这项技术不仅提供了非伦理限制的研究平台，还为药物筛选和疾病建模提供了高效、精准的工具，成为传统2D培养和动物模型的重要补充。为进一步促进类器官技术的研究与应用，中国类器官转化医学大会将于2024年11月15-16日在上海举办。此次会议将邀请类器官研...
【Science子刊】美国约翰霍普金斯大学郑雷团队揭秘：信号素3D如何重塑巨噬细胞，加速胰腺癌侵袭
2024年10月16日，约翰霍普金斯大学医学院郑雷团队在期刊《Science Advances》上发表了题为“Semaphorin 3D promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression and metastasis through macrophage reprogramming”的研究论文。这项研究表明，改变的SEMA3D表达导致...
苏佳灿/崔进/刘媛媛/陈晓团队：3D打印皮肤类器官1.0促进全层皮肤缺损愈合｜BAM
近期，上海交通大学医学院附属新华医院、上海大学、海军军医大学第一附属医院苏佳灿教授、刘媛媛教授、陈晓教授、崔进教授等团队在科爱期刊Bioactive Materials上联合发表研究论文：3D打印人源性皮肤类器官促进全层皮肤缺损愈合的研究。本研究成功构建皮肤类器官1.0用于全层皮肤缺损创面的治疗，证实皮肤类器官可以加速创面愈合速率，促进创面再上皮化及血管化，提高创面愈合质量，实现创面原位修复...
【Nature】填补空白！加州大学科学家揭秘癌细胞中线粒体的功能之谜，生成肺部肿瘤中线粒体网络的3D超分辨率图
3月15日，发表在《Nature》杂志上的一项新研究中，加州大学洛杉矶分校琼森综合癌症中心的研究人员使用正电子发射断层扫描（PET）与电子显微镜相结合，生成基因工程小鼠肺部肿瘤中线粒体网络的三维超分辨率图。他们使用一种称为深度学习的人工智能技术，根据线粒体活性和其他因素对肿瘤进行分类，量化整个肿瘤中数百个细胞和数千个线粒体的线粒体结构。 https://www.na...
SUNY-Buffalo 曲峻教授：3D打印微支架助力的空间蛋白质组学 | WeOmics G20
“Westlake Proteomics Series” (WeOmics)系列研讨会 由西湖大学Guomics实验室，西湖实验室iMarker实验室，CN-HUPO，The Proteomic Navigator of the Human Body (π-HuB) Project共同举办，并由西湖欧米承办，SCIEX协办。 本期研讨会主题：SUNY-Buffalo 曲峻教授：...
规范化MSI检测上市一年大盘点：国内近70家三甲医院率先开展 桐树基因2B3D检测试剂盒成主流
在第28届全国肿瘤防治宣传周期间，如何精准防治肿瘤再度成为热议话题。以MSI-H肿瘤为例，统计数据显示我国每年该类肿瘤新发患者超32.4万例，疾病负荷正在日益增大，这也吸引医学界加深对该类肿瘤疾病的关注以及相关诊疗技术的研发与探索。 目前，作为肿瘤精准诊疗最重要的泛癌肿靶点之一，MSI已被证实可有效预测免疫检测点抑制剂的治疗效果，辅助诊断遗传性肿瘤等临床价值，意义深远。也因此，与MSI相关的检测...
讲座回放|实时活细胞成像分析在3D细胞模型中的应用
如今越来越多的科学家将目光从2D细胞模型转移到3D细胞模型。3D细胞模型不仅保留了前者的通量，而且从药物渗透，到细胞表型等方方面面都表现出了更贴近体内生理学的性质。 目前3D细胞培养的方式主要分两种： 不依赖支架的培养方案，如超低细胞吸附孔板、悬滴法、磁力悬浮法、微重力培养法等 基于支架的培养方案，如胞外基质凝胶、化学合成凝胶、...
【直播倒计时1天】实时活细胞成像分析在3D细胞模型中的应用
类器官是一种能够高度模拟真实器官结构、空间形态以及细胞群遗传多样性的体外3D细胞培养物，这些“微型器官”通常来自胚胎干细胞（ESCs）、诱导多能干细胞（iPSCs）、新生儿干细胞、成人干细胞（ASCs）以及患者体内提取的肿瘤组织。从1907年首次证明分离的海绵细胞组织可在体外自我组织分化成完整的生物体，到第一次成功实现成人干细胞建立3D类器官，类器官培养技...
【直播预告】实时活细胞成像分析在3D细胞模型中的应用
类器官前世今生 类器官培养与分析的痛点 包括美国菌种保藏中心（ATCC）在内的多个组织和研究机构发布许多针对多种类器官培养的protocol，定义了其培养条件、接种密度、基质建议和其他关键参数。但是对类器官的定量分析面临重重挑战，比如： l 每个孔中类器官形成的重复性无法保证，缺少成熟的实验方案...
【研究】开发器官芯片系统，重现体外3D肿瘤，推进个性化癌症治疗！
来自弗赖堡大学微系统工程系，德国微系统技术研究所(IMTEK)的Andreas Weltin博士、Jochen Kieninger博士和Johannes Dornhof的一个研究团队开发出了一种系统，除其他外，使得在三维环境中研究人体外肿瘤细胞的发育成为可能。Weltin说：“我们已经实现了一个器官芯片系统，可以通过微传感器随时测量和控制细胞的培养条件和代谢率。直到现在，这在3D细胞培养中是...
【Nature子刊】重磅！3D类器官修复受损肠道，临床应用前景广阔
3D类器官，是过去十年中生物医学领域的革命性发展之一。3D类器官是（实验室生产的）器官的缩小简化版，由细胞团构成。它们是三维的，能够显示逼真的微观解剖结构。类器官应用广泛，可以作为研究疾病的体外工具，也可用于再生医学和精准医疗。 早在2009年，Hans Clevers和Toshiro Sato用来源于小鼠肠道的成体干细胞培育出首...
【Nature子刊】令人惊叹！小鼠颅骨的3D图像帮助科学家制造新骨骼！
约翰·霍普金斯医学院的科学家们使用发光化学物质和其他技术，创建了血管和自我更新的“干细胞”的3D图，这些干细胞在小鼠的头骨中排列并穿透。这张地图提供了血管和干细胞的精确位置，科学家们最终可以用它们来修复伤口，并在颅骨中生成新的骨头和组织。 约翰·霍普金斯大学医学院生物医学工程教授、颅面和矫形组织工程实验室主任Warren Grayson博士说：“我们需要了解颅骨内部...
【Nature子刊】上海交通大学在内的一支国际科学家团队培养的3D胰腺癌肿瘤模型，可有效改善胰腺癌的治疗方法
一支国际科学家团队在实验室里创建了一个三维（3D）胰腺癌肿瘤模型，该模型结合了生物工程基质和来源于患者的细胞，可用于开发和检测靶向治疗。 于9月24日发表在《Nature Communications》的一项新研究中，来自诺丁汉大学、伦敦玛丽女王大学、莫纳什大学和上海交通大学的研究人员创造了一个多细胞的三维微环境，利用患者来源的细胞重现胰腺癌中肿瘤细胞...