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专家访谈
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UW团队完成了三阴乳腺癌的大规模蛋白质组学分析
通过20种人衍生的乳腺癌细胞系和4个患者的肿瘤样本，该研究鉴定了各种乳腺癌亚型的蛋白质，并且确定了潜在的治疗靶标，这些结果近日发表在了《Cell Reports》上。 这项工作还强调了TNBC的高异质性和由此导致该疾病治疗的困难性。 乳腺癌通常根据患者的受体状态进行分类-雌激素受体、表皮生长因子受体、孕激素受体的存在与否。这些受体中的一个或者多个在超过80%的乳腺癌患者中表达，因此...
内脏上皮细胞癌变 与一种蛋白质有关
据新华社东京3月21日电 （记者蓝建中）日本大阪大学教授菊池章率领的研究小组日前宣布，他们发现大肠和肺表面的细胞发生癌变与一种特有的蛋白质相关。动物实验证实，如果不让这种蛋白质发挥作用，肿瘤就会变小。这一发现将有助于开发新的治癌药物。 人体内一种称为FGF（成纤维生长因子）的蛋白质能促进细胞增殖，而一种名为Wnt3...
Nature：科学家利用X射线探测机体早期DNA的“影印”过程
近日，刊登在国际著名杂志Nature上的一篇研究论文中，来自约翰霍普金斯大学的研究人员通过研究开发了一种名为ORC的复杂蛋白的3D模型，其可以帮助DNA进行复制；就好象对罪犯进行拍照一样，这种ORC模型可以帮助描绘出关键兴趣蛋白的活动图谱。 研究者James Berger教授指出，尽管ORC蛋白模型对于生命研究非常关...
新型蛋白或和女性妊娠期糖尿病发病直接相关
过去40年以来进行机体糖类代谢的研究人员普遍会接受一种观点，就是认为机体中存在四种酶类可以开启机体从食物中获取能量的过程，这种产生能量的四种催化剂名为己糖激酶，其可以帮助研究人员进行研究来揭示机体是如何代谢碳水化合物的，以及如何通过药物干扰这些酶类来帮助控制机体的代谢性障碍，比如糖尿病等。 但显然这四种酶类并不能承担所有的工作，近日，来自杜克大学等处的研究...
Science：首次实现对人类蛋白质图谱信息的大型分析
发表在国际著名杂志Science上的一篇研究论文中，来自瑞典皇家理工学院的研究者首次对人类蛋白质图谱（Human Protein Atlas）进行了大量的分析，其中包括和癌症相关的蛋白质信息，存在于血液中的蛋白质数量等，这就为后期拓展开发靶向药物的市场提供了一定的帮助。 人类蛋白质图谱是在2014年6月由Knut and Alice Wallenberg基...
或可抑制肝癌细胞生长的蛋白分子
近日，曼彻斯特的科学家们研究发现了一种能调节肿瘤发展的蛋白质并发现它能抑制肝癌生长。 为了开发新的抗癌治疗方法，研究人员需要鉴定负责控制肿瘤生长的目标分子。这两种分子是氨基末端激酶（JNK）和p38，它们均能调节细胞增殖和细胞死亡。 在这个新项目中，英国曼彻斯特大学曼彻斯特学院...
Cell：迄今最大人类基因组编码蛋白相互作用图谱问世
据最新一期《细胞》杂志报道，由加拿大和美国科学家组成的一个国际研究小组，绘制出了迄今最大规模的人类基因组编码蛋白间直接相互作用的图谱，并预测出数十个与癌症相关的新基因。该项研究成果对于理解癌症和其他疾病的形成机制，并最终开发出治疗和预防方案至关重要。 加拿大高等研究院、美国达纳法博癌症研究中心和哈佛医学院共同完成的...
人体最特别组织：睾丸含有999种独特蛋白质
人类脱氧核糖核酸(DNA)中含有能合成约20000种蛋白质的信息，而蛋白质正是维持我们身体运转的最小生物机械单元。在细胞中，活跃蛋白质的组合决定了细胞的功能，例如，肾脏中过滤血液的细胞与大脑中神经元的工作方式就完全不同。 “管家蛋白” 现在，科学家已经确定出在不同组织发挥不同功能的蛋白质种类，他们...
历经十年，人类蛋白质组图谱公布
由瑞典皇家理工学院的Mathias Uhlén领导的一项长达十年之久的研究项目——人类蛋白质图集（Human Protein Atlas，HPA）项目，在本周发布了1300万张全身人类蛋白质“图像”。通过制备出荧光标记抗体，将其应用于保存组织的薄切片，观察组织的颜色以及附着在组织上的抗体，研究人员绘制出了17,000个已知蛋白质的图像。 Uhlén表示，构建人类“蛋白质组”的系统详细图集...
Nat Commun：中国科学家用新方法实现蛋白质设计
中国科学技术大学生命科学学院教授刘海燕、副教授陈泉，成功实现给定目标结构的蛋白全序列从头设计。相关成果日前发表于《自然—通讯》杂志。 蛋白质是生命功能的主要执行者，是由不同类型的氨基酸按特定顺序串联成的长链状生物大分子。很多蛋白质分子需要在空间折叠成特定的三维结构，才能发挥功能。每种蛋白质中的氨基酸序列，决定了该蛋白能否形成稳定的三维空间结构、形成怎样的三维空间...
非小细胞肺癌NCCN指南更新：新增血清学蛋白质测试
美国NCCN（National Comprehensive Cancer Network）在近期更新的非小细胞肺癌指南中，推荐EGFR野生型和EGFR状态未知的非小细胞肺癌患者在接受二线治疗之前使用Biodesix公司的VeriStrat测试从而判断是否应该使用厄洛替尼。 VeriStr...
破坏一种蛋白质可降低血糖值
冈山大学和九州大学的一个研究小组10月21日宣布，他们在动物实验中发现，如果破坏体内与物质输送有关的一种特定蛋白质，就能提高胰岛素效果，降低血糖值。这一发现有助开发治糖尿病新药。 研究小组利用实验鼠进行实验时注意到，实验鼠体内有一种被称为“VNUT”的蛋白质，它能将三磷酸腺苷搬运和储存到细胞的囊泡内。三磷酸腺苷是一...
J Proteome Res：新型蛋白质组学技术或彻底改变乳腺癌的疗法
基质细胞由结缔组织衍生而成，其会影响肿瘤的生长，然而，近日来自维也纳医科大学等处的研究人员开发了一种新型技术，研究人员利用现代质谱法，通过对针吸活组织样品进行检测就可以探知来自乳腺成纤维细胞中的肿瘤促进活性，相关研究发表于国际杂志Journal of Proteome Research上。 长期以来科学家们熟知基质细胞会促进肿瘤生长，但是研究者们却很难理解是否是疾病间...
诺华公司以股权模式拓展与Somalogic公司的研究合作
Somalogic公司近日宣布诺华公司已拓展与该公司多年的研究协定，参与到公司的蛋白质药物研究平台中来。 在扩展协定中，两个公司会继续其最初在2011年达成的协定，构建一个Somalogic专有的SomaScan蛋白质组学分析方法并且将Somamer结合试剂应用在诺华的临床前和临床产品组合中去。 &emsp...
基因组学与蛋白质组学两大巨头建立合作
AB Sciex和Illumina公司近日联手推出OneOmicsTM; 计划，其目的是在云计算环境中结合新一代蛋白质组学（NGP）和新一代测序（NGS）的工具。作为此计划的一部分，Illumina的应用商店BaseSpace将托管AB Sciex的SWATHTM; 蛋白质组学云工具，这使得BaseSpace成为基因组学和蛋白质组学“大数据”的一站式中...
人类蛋白质组计划：长风破浪在此时
先扯点儿废话。话说很多人对咱生物信息学领域有俩疑问：1) 你们跟华大有啥区别？2) 华大搞测序，但测序仪是国外买的，这有啥技术含量啊？这事儿甭说各位有疑问，我也是一直搞的晕晕乎乎，所以后来专门请教了北大那位来自天顶星的教授。要不怎么说外星人就是有水平呢，听完明白了。第一，咱跟华大那就像是华山派的气宗和剑宗，无非是武学理念不同，还是同气连枝。不过咱跟华山派不一样的地方是，学...
美研究发现保持干细胞本性有关键作用的蛋白质因子
干细胞是细胞界“永远的少女”。人们认为它会一直保持静止状态，直到有某种信号迫使它分裂，产生差异而形成高度特化的细胞。理论上它们能发育成任何类型的成熟细胞，因而在组织与器官再生领域有着光明前景，但人们还需要更充分地掌握干细胞生理学。 据物理学家组织网9月25日报道，纽约大学朗格尼医学中心一项最新研究表明，一种与许多癌症有...
Nat Commun：新型蛋白质图谱或可帮助寻找潜在的抗癌药物
近日，一项发表在国际杂志Nature Communications上的研究报告中，来自伦敦帝国理工学院的研究人员通过研究揭示了致病性酶类如何对蛋白质进行修饰及其如何被阻断的分子机制；这种酶类名为N-肉豆蔻酰基转移酶(NMT)，研究人员希望该研究可以帮助他们设计新型药物来靶向作用该酶类，为癌症及炎性疾病开发新型靶向性疗法。 文章中，研究者鉴别出了一种可以阻断NMT活...
Nat Commun：特殊蛋白间相互作用对于大脑神经网络的形成至关重要
大脑中特殊的神经元之间的互相交联会形成大脑的神经网络，而涉及产生这些连接的分子机制至今却未被阐明，近日，来自日本RIKEN脑科学综合研究中心（RIKEN Brain Science Institute）的研究人员鉴别出了对特殊类型神经元之间连接非常重要的两种蛋白质间的相互作用，这对于后期开发治疗神经性障碍的疗法将非常关键，相关研究刊登于国家杂志Nature Communic...
Nature :抑制癌细胞扩散可用蛋白质疗法
癌细胞的扩散正是导致大多数癌症患者死亡的罪魁祸首。目前，医务工作者们通常通过化疗抑制癌细胞的转移，但化疗本身的效果有限，且会带来强烈的副作用。而近日公布的一项研究成果或许在未来能够帮助癌症患者们减免化疗之苦。 美国斯坦福大学的研究团队开发出一种蛋白质疗法，该疗法能够破坏癌细胞从肿瘤中分离的过程，防止癌细胞通过血液循环等途径在体内...