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专家访谈
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异质性批量肿瘤样本中的克隆和单倍型特异性拷贝数变异推断
通过全基因组纳米孔测序，表征异质性肿瘤中的单倍型特异性大规模拷贝数变异(CNV)和新型低/高甲基化。 癌症进程中基因组变异的累积 图1 癌细胞克隆进展和体细胞突变累积的图示 癌症疾病很复杂，可视为一种体细胞进化过程，伴随克隆细胞增殖和克隆清除（驱动因素是有益于生存/逃逸的基因组突变发生累积），同时选择性压力不断变化（图1a）。在癌症进...
元码基因启动肿瘤样本免费三代测序结构变异检测计划
肿瘤的临床诊疗方案中，靶向治疗、免疫治疗、联合治疗已经逐渐成为主流治疗方案。而通过基因测序为临床肿瘤提供更加精准的伴随诊断和个体化用药指导，已经成为必不可少的手段。 现行的主要的基因检测技术包括：PCR方法、一代测序、二代测序等，二代测序因其高通量、高性价比、技术成熟、一次性同时检测大量的肿瘤突变，而越来越被临床所接受，更多基于NGS的IVD产品也将逐步获批。元码基...
Genome Biology：23个癌症类型 10000+个肿瘤样本综合分析 指导肿瘤免疫疗法
Li Bo等开发了一种计算方法来研究肿瘤浸润免疫细胞以及它们与癌细胞之间的相互作用。他们关于免疫渗透水平，临床关联以及预测标志物等方面的数据可能预示产生有效的癌症疫苗和检查点抑制疗法。相关实验发表在Genome Biology。 图1. 预测肿瘤浸润淋巴细胞丰富性的计算方法 最近，癌症免疫治疗在晚期肿瘤方面取得了显著成功，但仍有很大一部分患者...
美国将启用癌症研究新模型：新肿瘤样本将由小鼠体内培养
美国国家癌症研究所（NCI）宣布，已被世界各地研究人员使用达25年之久的NCI-60细胞系即将于今年春末“退休”，取而代之的是来自癌症患者捐赠、经小鼠体内培养的新肿瘤样本。 据《自然》杂志网站报道，NCI-60细胞系是用于抗癌药物测试的癌细胞样本群。它帮助科学家刷新了对癌症的理解。但时至今日，NCI-60细胞系历经几千代的培...