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专家访谈
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非因四周年 | TCGA数据库“御用”靶向蛋白组学技术-RPPA 钜惠来袭
什么是RPPA靶向蛋白组学 中国第一家RPPA (Reverse Phase Protein Array) 反相蛋白微阵列靶向蛋白组学技术平台，具有高通量和高内涵双重优势，可平行分析上千个样本中几百种关键癌症蛋白的表达水平及翻译后修饰。 非因生物RPPA靶向蛋白组学技术服务特点与优势 ✔ 微量“看”全景：20-40μg蛋白同时检...
一国际数据库被检出超34万篇问题论文，新工具发现它们涉及论文工厂！
近年来，被期刊撤销的论文数量不断增加。这些撤稿数据背后，论文工厂扮演了重要角色。科学界面临着日渐规模化、工业化的学术作假手段的侵袭，打击论文工厂已成为了颇为急切的问题。 论文工厂指的是那些按订单制作科研手稿的公司或个人。根据买者需求，他们雇用相关专业写手，套用学术模板写作，最终发表在不同级别的刊物上，整套“一条龙”服务应运而生。 在2021年3月23日，Nature 杂志曾起底论文工厂...
《转》访新华医院余永国教授：挑战前所未有！构建我国儿童遗传疾病检测基因组数据库
罕见病，又名“孤儿病”，根据世界卫生组织（WHO）将其定义为患病人数占总人口的0.65‰～1‰的疾病。其中约有80%的罕见病由于遗传缺陷引起，而约有50%的罕见病在出生时或者儿童期即可发病。但目前临床的应用检测手段只能解释30%~40%的病例。为了推动全基因组测序以及罕见病的发展，国内首个《全基因组测序在出生缺陷及儿童未确诊罕见遗传疾病检测的临床应用共识》会议于2018年3月10日在上海正式...
癌症变异临床解读数据库扩容，推动基因组学在精准肿瘤学中的应用
“对于Illumina的巨大贡献我们感到非常高兴并表示由衷的感谢。我们有意选择了CIViC这样的开放模型，以便允许捐赠提交信息的整合。”圣路易斯华盛顿大学医学院医学助理教授Obi L. Griffith说道。“这些遗传信息构成的数据库颇有价值，如今全世界的研究人员都可以访问。CIViC希望打破学术界与产业界研究人员之间的信息孤岛。此次捐赠说明我们的愿...
肿瘤基因组学研究进展 及公共数据库数据挖掘利用研讨会（第一轮通知）
人类癌症细胞中通常藏匿着多种引起恶性病变的染色体变异，核酸替换和表观遗传修饰，并由此而产生基因表达水平的改变。基于获取、刻画并分析人类癌症中大规模、多种变异的分子特征，并且为癌症研究者迅速地提供数据的癌症基因组图谱（The cancer genome atlas, TCGA）计划，到目前为止已经收集到39种癌症的组织样本，并得到了各种癌症在不同分子...
为了预测下一场大规模流行病在哪里爆发，研究人员建了个数据库
这个病毒数据库由美国生态健康联盟创始人 Peter Daszak 及他的团队创建。 Daszak 的研究团队认为，目前人类社会中出现的新型传染病大部分是人畜共患的病毒。因此他们着重关注野生哺乳动物身上携带的病毒，尤其是能跨物种传染的病毒及它的传播模式。 感染埃博拉的病毒细胞图 图源： NIAID 他们创建的这个病毒数据库中包含了近 600 种病...
覆盖300多种肿瘤 上万名晚期癌症患者测序突变数据库发表的启示
5月8日，Nature Medicine杂志发表一篇重量级文章，纪念斯隆-凯特琳癌症研究中心(MSKCC) 的科学家采用MSK-IMPACT方法，开展了一个大规模、前瞻性的临床测序研究。他们对上万名晚期癌症患者，接近300多种肿瘤进行了基因测序，同时收集了这些肿瘤病人的临床注释、病理等方面的信息，并且科学家将这些数据集合放在一个网站上，全世界的研究者都可以访问，进行数据检索。这个网址是htt...
手把手教你如何快速掌握TCGA数据库
TCGA数据库数据挖掘与探索学习班 玮瑜主办 2017年5月19日-21日（周五六日） 上海 课程简介 随着大数据时代的到来，各种生物类公共数据库井喷，其中就包括癌症领域熟为人知的癌症基因图谱The Cancer Genome Atlas (TCGA)数据库。TCGA由NCI牵头，作为美国攻克癌计划的一个大项目，投入了巨大的人力和物力，系统提供了癌症...
挖出科研界的“扫地僧”！上海建成10万人顶尖专家数据库！
10万名全球顶尖科技人才，来自300多个细分领域。记者15日从上海研发公共服务平台获悉，一张全面了解全球顶尖人才的大数据网络———全球高层次科技人才数据库和信息服务平台已完成第一阶段建设。这份数据库目前整合了3.9万名全球顶尖专家、1.4万名华人顶尖专家和5万名本市科技专家，入选专家在各自领域中的排名均为前千分之一。 上海科创中心建设关键在人才，要引进什么样的人、怎么吸引人，以及...
国内各类医药数据库的发展现状
前言 互联网兴起二十余载，同时伴随着人们健康意识的提升，医药信息在互联网时代的作用显得越来越突出。但我们不可能记住太多的信息，其实也没必要去记住那么多信息，很重要的一个原因是医药信息的更新速度非常快，这种现象使得高质量的医药数据库的出现成为必然。有些问题能用谷歌/百度/必应/雅虎等搜索引擎解决就不必刻意去用医药数据库，但是，医药信息范围广阔而且专业，一般的搜索引擎难以给出正确答案...
152位专家“组团”搭建遗传性肿瘤数据库
近日，中国抗癌协会（CACA）家族遗传性肿瘤协作组工作启动。该协作组的152名专家来自全国48家三甲级医院，由临床肿瘤学、遗传学、分子诊断学、心理学、流行病学等专业专家共同组建，协作组将在全国推进“肿瘤遗传咨询门诊”发展，搭建中国人群遗传性肿瘤数据库。 遗传性肿瘤发病率占5%-10% 据统计，家族性肿瘤和遗传性肿瘤的发病约占全部肿瘤发病的5%-10%。2015年，我国...
中国科学院：生物组学数据库获国际认可
中新社记者20日从中国科学院北京基因组研究所获悉，该所生命与健康大数据中心(BIGD)建成的生物组学数据库首次获得国际认可。 BIGD团队近日在国际学术期刊《核酸研究》上发表研究论文《北京基因组研究所生命与健康大数据中心：从存储到整合、再到转化》，这是中国首次以数据中心的模式，整体发布中国生物组学数据资源的建设情况。 论文作者之一、中科院...
我国建成全球第四个综合基因组权威数据库
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为“The BIG Data Center: from deposition to integration to translation”（北京基因组研究所生命与健康大数据中心：从存储到整合、再到转化）的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表。这是我国首次以数据中...
“精准”防治心血管病 我国有望初步形成百万人群大型健康数据库
聚焦心血管病这一对民众健康影响较大的领域，我国已启动心血管高危人群早期筛查与综合干预项目，将初步形成百万人群大型健康数据库，为推动心血管病的精准医疗奠定基础。 这是记者从11日闭幕的中国精准心血管病学峰会上了解到的。“选择好人群和病人队列，组建有临床背景的生物信息‘双栖’科学家团队，是我国精准医学发展有的放矢、有所作为的关键。”中国工程院院士、国家心血管病中心主任胡...
真实体验五家基因测试公司，DNA数据库错误信息可能给精准医疗带来噩梦！
当你参与基因测试后，如何获取有价值的数据，遗传基因分析与某些特定的功能到底有何联系？美国知名记者 REBECCA ROBBINS体验了DNAFit, Genomic Express, Kinetic Diagnostics, Orig3n, 以及Simplified Genetics五家公司的基因测试服务，价格从154美元到400美元，帮助我们对于这个行业有一个初步的了解。 我...
液体活检开放数据库：癌症精准诊断蓬勃沃土
近日，20家美国著名学术机构、药物诊断开发商的联合项目--液体活检数据库?Blood Profiling Atlas正式启动。作为癌症登月计划的一部分，该项目旨在推进血液分析与诊断技术的进一步发展。 作为该项目成员之一的Seven Bridges市场总监Andrew Gruen告诉记者，“我们的目标是在未来的45-60天内实现大量临床数据的分...
重金创建基因组数据库 贝瑞和康卡位基因解读
目前我国婴儿的出生缺陷率达到5.6%，全民患肿瘤风险达到1/1000，如果能用基因测序的方式排除这些巨大的隐患，就具有重大的社会意义。 “科研领域，任何一个项目都不可能有100%成功的把握，但是我会尽力而为。尤其是最有挑战性的技术项目，花再多的钱也值得尝试!”接受健康界采访时，北京贝瑞和康生物技术股份有限公司（以下简称贝瑞和康）CEO周代星如此评价公司正在重金建设的“神州基因组数据云”项目。...
Nucleic Acid Research发布第一个人类自身抗原数据库
自身抗体是一类由B细胞免疫系统分泌，可识别自身蛋白（自身抗原）的抗体分子。它对于维持生物体自身平衡、区分正常与异常增殖细胞以及免疫系统紊乱中均扮演着关键的角色。鉴于其重要的生理功能，发现这些自身抗体的靶标抗原并阐明它们在临床肿瘤和自身免疫病诊断和治疗中的价值则显示出重要的科学意义。例如，2012年美国FDA批准了一组由七个肿瘤自身抗原（p53、NY-ESO-1、 CAGE、...
贝瑞和康大数据项目初战告捷 建成全球最大妇科肿瘤基因组数据库
基因组大数据的重大意义开始凸显，贝瑞和康与阿里云合作开展的“神州基因组数据云”项目取得的阶段性成果，便已经收效显著。 9月23日，在第十九届全国临床肿瘤学大会暨CSCO学术年会上，北京贝瑞和康生物技术股份有限公司（以下简称“贝瑞和康”）公布了在生物信息分析领域和大数据建设方面做出的重要成果。 贝瑞...
温医大定理学院教授完成国际上首个遗传性骨骼疾病基因数据库
骨骼系统在肌肉附着、人体运动、保护重要器官和保持血管系统稳态方面起到至关重要的作用。任何扰乱骨骼、软骨和关节的发育的基因发生变异都是导致骨骼发育不良，其是出生缺陷患儿中较常见的类型，人群总发病率大约1/1500。遗传性骨骼疾病占骨骼系统疾病的大部分，主要是指具有遗传倾向且有基因确诊的类型。对于严重的骨骼疾病患者来说，存活率不超过一年，大部分均会严重影响患者的生活质量。2010版骨骼疾病分类系...