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【直播】基因之钥:Twist全外显子组测序应用新篇章
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《柳叶刀》子刊:外显子测序发现儿童肾母细胞瘤新的Wilms肿瘤易感基因

2019-03-19

肾母细胞瘤是最常见的儿童肾癌,其具有遗传异质性。 虽然目前已经鉴定出了几种Wilms肿瘤易感基因,但有强有力的证据表明可能存在更多的易感基因。 来自伦敦肿瘤研究所的Nazneen Rahman教授及其研究团队通过对890位Wilms肿瘤患者进行了外显子测序,最终他们发现了3个全新的Wilms肿瘤的易感基因-TRIM28、FBXW7和NYNRIN。其中33个受试者中有21个患者存在TRIM28...

应用全外显子测序发现男子不育症新致病基因

2018-05-08

背景介绍 不孕不育症,是指成人男女双方同居一处并有正常性生活一年以上,无避孕措施仍无法怀孕,影响全球高达15%的夫妇,大约50%的不育症是男性因素,由各种生精异常引起。最严重的是非阻塞性无精症(NOA),尽管生殖器官没有阻塞,但完全没有精子。非阻塞性无精症占男性不育症的10%-15%,因此约有1%的成年男性都受该病影响...

外显子测序---产前诊断及儿科疾病诊断的新秀

2017-05-23

本周末,由美国贝勒医学院与香港中文大学联合举办的第一届贝勒医学院-香港中文大学临床遗传学大会如期在著名的威尔斯亲王医院召开。来自贝勒医学院,香港中文大学,香港大学,复旦大学,北京协和医院,马来西亚大学,墨尔本大学等数十个中美及周边国家学术与临床机构的专家学者齐聚一堂,进行了为期两天的学术报告与交流。 本次大会的主题主要围绕尖端测序技术与数据分析在产前诊断以及儿科疾...

伯豪客户外显子测序发现急性红细胞白血病新突变

2016-11-24

    急性红细胞白血病(AEL)是白血病(AML)亚型中的一种,在老年人白血病中的占比较高。相对于其他类型的AML,AEL病人有更加poor-risk的细胞遗传学异常和不良的预后。虽然针对AEL的外显子突变位点发现已有一些报道。但是,针对AEL的完整突变谱发现还没有相关报道。研究人员运用外显子组测序技术,发现了AML相关的高频突变基因GATA2和CEBPA等突变,为理解急性红...

全外显子测序发现胃腺癌腹膜转移的驱动基因

2016-11-03

研究背景 胃癌是全世界发病率第五、肿瘤死亡率高居第三的常见恶性肿瘤。其中,大约有40%胃癌发生于中国,多数人被诊断为胃癌时已是进展期,更容易转移或者复发。无论是早期胃癌还是晚期胃癌,腹膜转移都是最常见的转移或者复发方式。由于目前没有有效的治疗手段,胃癌一旦发生腹膜转移,患者的中位生存时间不足6个月,因此,阐明胃癌腹膜转移的分子机制改善其预后是亟待解决的问题。 二代测...

外显子测序发现急性红细胞白血病新突变

2016-11-03

急性红细胞白血病(AEL)是白血病(AML)亚型中的一种,在老年人白血病中的占比较高。相对于其他类型的AML,AEL病人有更加poor-risk的细胞遗传学异常和不良的预后。虽然针对AEL的外显子突变位点发现已有一些报道。但是,针对AEL的完整突变谱发现还没有相关报道。研究人员运用外显子组测序技术,发现了AML相关的高频突变基因GATA2和CEBPA等突变,为理解急性红细胞白血病的发生发展过...

Nature Gen:外显子测序发现肺癌新突变基因

2016-05-10

  最近,来自美国几所主要大学和俄罗斯ITMO大学的研究人员,在肺癌细胞中发现了一些新的驱动突变(driver mutations),可能用于基因靶向治疗和免疫治疗。相关研究结果发表在最新一期的《Nature Genetics》杂志。   在超过1000名肺癌或鳞状细胞癌患者中,研究者对他们的肿瘤外显子组序列进行研究发现,两...

GEN:挖掘全外显子测序数据优化癌症治疗

2016-03-31

  美国科罗拉多大学癌症中心的研究人员近期成功开发了一种新型生物信息学工具,该系统主要用于肿瘤全外显子测序初步数据的解释与分析。同时,科研人员与临床医师可将该系统分析结果中的致癌基因与FDA授批靶向治疗药物相匹配,用于个性化医疗的相关研究与癌症的临床治疗。("IMPACT: A Whole-Exome Sequencing Analysis Pipeline for Integrating Mol...

ctDNA外显子测序揭示了乳腺癌进化的过程

2015-11-23

  虽然这项工作仍然需要在更大规模的群体中进行验证,但是其鉴定了随机突变的特异群体,这些随机突变可能是理想的用于监测肿瘤负荷,指导治疗或者跟踪癌症患者治疗反应的ctDNA。然而,研究成果也表明,目前在临床中使用的ctDNA存在的一些潜在的缺陷。   转化基因组研究所的无创性诊断中心共同主任和副教授Muhammed Murtaza,在由RainDance Technol...

外显子测序发现早期胚胎致死基因突变

2015-11-11

  King Faisal Specialist医院和Fowzan Alkuraya研究中心的团队对辣子两个怀孕有苦难的家庭女性进行了同和性作图和外显子测序,这些女性即使进行体外受精,怀孕也十分困难。研究人员本周在《Genome Biology》上报道了他们的结果,他们发现,TLE6中的突变似乎在早期终止了胚胎发育。胚胎后发育中,其他基因的活性与胚胎杀伤...

辛辛那提儿童医院团队在临床上使用外显子测序技术

2015-09-05

  这项结果,他们近日发表在了《Frontiers in Pediatrics》上,而他们额度结果也将接受其他临床实验室提供的针对稀有疾病的外显子测序的检验,这将会为这种检测的有效性增添新的证据。   在文章中,研究人员描述了他们针对前四十例案例检测的经验。辛辛那提儿童医院医疗中心的分子遗传实验室主任Kejian Zhang表示,实验室现在已经评估了130名左右的患者,并且看到了大约30%的诊断...

外显子测序揭示复发突变的预后

2015-08-23

  研究人员对肿瘤做了外显子测序,并且将其与超过450名骨髓瘤患者获得的正常样品进行了匹配,这450名患者都是通过国家癌症研究所的骨髓瘤XI实验招募的,这是一个使用依靠临床结果、分子细胞遗传学和数据等等进行的精密或者不精密骨髓瘤治疗项目的临床3期实验。   在所有骨髓瘤样本中出现的基因突变频率,他们发现几个突变与好或者不好的预后...

Nature子刊:外显子测序确定两个与家族性肺纤维化相关的基因

2015-04-18

  这项结果他们近日发表在了《Nature Genetics》上,研究人员利用外显子测序技术,对接近100个具有年龄相关的家族性肺纤维化患者进行了测序,并通过基因负担病例分析,确定了PARN和RTEL1突变与该疾病的发生有关。西南中心的Christine Kim Garcia和她的同事们补充道,携带有这些突变,会导致端粒缩短,而这会导致这种偶尔发生的疾病的患者,具有极其糟糕的生存率。   “这两...

外显子测序表明:帕金森致病基因也会导致肺癌

2015-02-03

  来自威斯康星医学院等处的研究人员对一个遭受肺癌折磨的家庭的三名成员进行了外显子基因测序。在测序数据中,他们发现在PARK2存在突变,而这个基因编码了一种泛素连接酶,这种酶参与了代谢和应激等过程,与细胞生长调节有关。   他们指出,该基因的隐性突变已经证实与帕金森有关,虽然在过度生长中,该基因起着抑制作用,这表明其遗传可能与正常的功能相互...

Nature:外显子测序找到罕见基因突变

2014-12-12

  来自Broad研究所、麻省总医院等知名生物医学研究机构的研究人员发现了一种称为APOA5的基因发生罕见突变,会增加个体早期心脏病发作的风险。这些突变能令APOA5 基因失去作用,同时增加血液中的甘油三酯含量。   这一新发现与近期其它遗传方面的成果,尤其是APOC3 保护性基因突变(降低甘油三酯水平和心脏病发作的风险)的发现,...

【组学】加拿大:外显子测序发现146种罕见病致病基因

2014-06-09

罕见疾病基因发现中心(Findingof Rare Disease Genes ,FORGE)的研究人员通过对246名罕见病患者进行全基因组外显子测序,发现了引发疾病的146个突变位点和67个异常基因。他们将这一发现发表在《美国人类遗传学杂志 》 上。 四家科研机构——多伦多基因组学应用中心、温哥华基...

全基因组测序来了,外显子测序还能活多久?

2014-03-19

随着药明康德公司和诺禾致源两家公司采购Illumina HiSeq X Ten测序仪,在2014年第3季度,国内的“人全基因组测序+分析”(WGS,whole genome sequencing)的价格就会降到2万元人民币左右。 目前的“人外显子组测序+分析”(WES, whole exome sequencing)的市场价格约在1.5万元...

外显子测序:成诊断遗传病新希望

2013-10-08

      当一个婴儿迟迟不会爬或说话,或者出现其他症状表明其可能有遗传性疾病时,家长寻找答案的过程通常是漫长且令人沮丧的。医生可能会安排一系列的测试,但仍不能得出一个特定的诊断结果。   现在,价格便宜的DNA测序能有助于揭示这些神秘疾病的原因。该方法是对病人编码蛋白质的DNA中的1%(外显子组)进行...

外显子测序揭示罕见疾病致病基因

2013-06-13

来自魁北克的医生和研究员们发现引起多个肠闭锁疾病(MIA)的基因,多个肠闭锁是一种罕见,但危及新生儿生命的遗传异常性疾病。另外,研究员们也探究了新的治疗方法,他们发现基因TTC7A也可作为一种潜在的诊断测试和筛选测试的工具,针对携带有这种基因的父母。 MIA是一种先天性疾病,表现为全消化道的多处梗阻——从胃到小肠及结肠——与严...

Science:大型低成本,外显子测序成果

2012-12-09

来自华盛顿大学医学院,霍德华休斯医学院等处的研究人员利用一种新型技术,完成了多达2446个样品外显子测序分析,找到了自闭症谱系障碍(ASD,Autism Spectrum Disorder)的多个频发突变,不仅为治疗ASD疾病提供了新思路,而且也提出了一种低成本,多基因测序新方法。相关成果公布在Science杂志上。<!--more--> 领导这一研究的是华盛顿大学医学院Jay ...