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两篇Cell文章:廉价的单细胞基因表达分析新技术
想象一下有人递给你一杯奶昔,要你鉴别出里面所有的东西。或许你能够辨别出有一点点的草莓或是酸奶的味道。但总体上它的味道就像是无法分辨的成分构成的混成品。 现在再想象一下,这杯奶昔是由来自大脑的2万个碾碎了的细胞所组成。你可以通过测试来确定样本中有什么分子,这就是科学家们现在所做的事情。这当然会提供给你有用的信息,但它无法告诉你这些分子最初来自...
Cell:揭秘激活神经干细胞的信号
来自同济大学医学院、加州大学洛杉矶分校、南昌大学等处的研究人员报告称,他们利用单细胞RNA测序技术,同时运用加权基因共表达网络分析(WGCNA),揭示出了激活休眠神经干细胞的信号。这一重要的研究结果发布在5月21日的《细胞》(Cell)杂志上。 同济大学医学院的李思光(Siguang Li)教授以及孙毅(Yi Eve Sun)教授是这篇论文的共同工作。李思光教...
单细胞分析在循环肿瘤细胞研究中的应用
循环肿瘤细胞(CTCs)是近些年来癌症研究的热点之一。这些在实体肿瘤患者血液中发现的微量细胞可能在肿瘤的转移过程中发挥关键作用。过去,由于数量稀少以及白细胞污染等原因,CTC转录谱研究受到了很大的限制。单细胞分析的出现使这些问题迎刃而解,把CTC的研究推到了一个新的深度。 如果要对CTC进...
当宏基因组遇上单细胞测序
日前,科学家们通过宏基因组测序和单细胞测序鉴定了一类新细菌。 16S rRNA基因序列的保守性和普遍性,使其成为了微生物检测和分类鉴定的强有力工具。这种方法为科学家们揭示了微生物群体的高度复杂性,但它还是有所遗漏。美国能源部联合基因组研究所上周的一次会议上,研究者人员向人们展示了在四个温泉样本(北美和亚洲)中发现的一类新细菌Candidatus Kryptonia。这项研究共测序了22个...
单细胞分析技术在转化医学领域的应用
细胞具有天然的异质性 异质性是细胞的天然特性之一,看似相同的一群细胞,其内部有可能存在本质的差别。这种异质性是由很多因素造成的,除了各细胞所处微环境的差异以外,更多的是细胞内在活动的一种表现;通常,细胞的异质性主要体现在以下几个方面: 在基因水平,基因组本身就存在多态性,各种突...
新型单细胞外显子组测序法
最近,美国MD安德森癌症研究中心和德克萨斯大学休斯敦健康科学中心的研究人员,开发出一种新型单细胞外显子组测序方法称为SNES。与目前大多数单细胞测序方法形成对比,SNES利用细胞核而不是细胞进行分析,从而将会在生物学许多不同领域具有广泛的应用。相关研究结果发表在2015年3月25日的国际著名学术期刊《Genome Biology》。 单细胞测序方法可让我们深入阐述罕见细胞亚群和复...
Polaris:在单细胞水平上实现细胞生物学和分子生物学的有机整合
美国旧金山,2月19日电 第十六届基因组生物学进展年会(AGBT)将于2月25日(当地时间)在位于Florida南部的Marco小岛上举行。除了享受冬日里难得的阳光与沙滩,参会者还将有机会一瞥Fluidigm公司(富鲁达)的新产品--Polaris的真容。该产品主要用于单细胞研究,其最令人兴奋之处在于,它是世界上第一个全面集成了单细胞分选、捕获、培养、给药以及核酸样品制备...
单细胞分析在循环肿瘤细胞研究中的应用
循环肿瘤细胞(CTCs)是近些年来癌症研究的热点之一。这些在实体肿瘤患者血液中发现的微量细胞可能在肿瘤的转移过程中发挥关键作用。过去,由于数量稀少以及白细胞污染等原因,CTC转录谱研究受到了很大的限制。单细胞分析的出现使这些问题迎刃而解,把CTC的研究推到了一个新的深度。 如果要对CTC进行单细胞分析,首先要做的就...
Nat Bio:新单细胞mRNA测序揭示大脑皮层细胞发育的独特性
加州大学旧金山分校的研究人员利用新的单细胞分析方法研究大脑皮层细胞的独特性,识别不同细胞类型的数百个新型生物标志物,这一项成果将提高科学家们对于出现特化神经元亚型的理解。这种集中于单细胞基因活性的新方法,最终与其他单细胞技术(包括显微成像)相结合,可能会揭示脑部发育障碍的起源。相关文章发表于2014年8月3日的《Nature Biotechnology...
透视单细胞DNA分析——专访Fluidigm公司CEO
人物简介: Gajus Worthington,美国Fluidigm公司创始人、CEO。 近年来, 他领导之下的Fluidigm公司将其独特的微流控芯片技术应用于单细胞分析,开发了其包括C1、Biomark、Polaris等在内的单细胞分析产品线,在单细胞分析领域占有重要的一席之地。 Fluidigm公司很早就开始...
CyTOF:以单细胞的视角重新审视生命
图一、Sean Bendall博士 很容易想象Sean Bendall博士被列入全美“40 Under 40”名录(每年评选40个在各领域有突出表现的的年轻人);他曾经在斯坦福Nolan实验室任助理教授,这个实验室位于美国Palo Alto小镇,隶属于加州蛋白质组研究中心的国家心肺和血液研究所(NHLBI)。Bendall不愧是一个年轻人的...
Nature Cell Biology:高通量单细胞技术获得新突破
人类肠道是一件了不起的事情。每周,肠道都会再生一层新的内皮细胞,脱落的表面面积相当于一个小型公寓,并用新的细胞进行修复。几十年来,研究人员已经知道,负责这一改头换面行为的是肠道干细胞,但是直到今年,美国北卡大学教堂山分校(UNC)医学、细胞生物学和生理学、生物医学工程副教授Scott Magness博士,才找到一种方法,在实验室内同时分离和培养成千上万个这样难以捉摸的...
Science:新型单细胞基因表达检测技术
发表在最新一期《科学》(Science)杂志上的一篇研究论文,证实了一种新型的大规模平行测序技术可借助于新一代测序(NGS)在单细胞水平上检测基因表达。 论文作者、来自Cellular Research, Inc公司的Christina Fan博士、Glenn Fu博士以及Stephen Fodor博士,描述了这一技术并报告了几项针对人类造血系统细胞的基因表达研究结果。 ...
Fluidigm携欧洲机构开展单细胞基因组学研究
流体芯片商Fluidigm今天宣布了与威康信托基金会桑格研究所及欧洲生物信息学研究所的一项合作协议,共同开发单细胞基因组数据的新型分析方法。 Fluidigm高级研究人员将在英国斯顿的桑格研究所单细胞基因组学中心实地工作,为该机构提供最新的设备、工作流、基因组学和蛋白质组学的方法研究。 桑格研究所和欧洲分子生物学室验室的资...
NIH:1800万美元奖励疟原虫单细胞基因组学研究
NIH奖励德克萨斯生物医学研究院的科学家Ian Cheeseman 1800万美元,以鼓励其继续进行疟原虫单细胞基因组的研究。 Ian Cheeseman及其研究团队开创了一种新的检测方法,可对单个疟原虫的基因组进行测序,该方法发表在今年五月份的Genome Research杂志上。方法结合了细胞分选、全基因组扩增基因分型以及...
Fluidigm推出高通量单细胞mRNA测序流程
Fluidigm公司近日在美国神经科学学会的会议上宣布推出一个新流程,能实现高通量的单细胞mRNA测序。这个流程综合了集成流体通路(IFC)设计的显著进步,可大规模提高通量和易用性,同时降低单细胞制备的成本。据介绍,商业化的产品有望在2015年上半年推出。 Fluidigm的CEO Gajus Worthington...
华大:单细胞测序,最值得您关注的测序技术
华大科技隆重推荐【单细胞测序】精品专题,内有 抢单送豪礼、 最新技术资料、在线免费Webinar、有奖闯关、细胞拼图等一系列丰富内容: ● 抢单送豪礼: 回馈新老客户,隆重推出单细胞基因组/转录组测序 抢单送礼回馈活动,价值3000元的优惠等你来领! ● 最新技术资料下载: 单细胞技术介绍,单细胞基因组/转录测序,案例展示... 无限制免费下载! ● ...
Cell惊人发现:一种单细胞生物基因组以约25万碎片形式存在
新研究发现一种单细胞生物Oxytricha trifallax能够将自己的DNA分解成近25万份碎片,而当它们进行交配时又能够快速重装这些碎片,整个过程需要约60个小时。Oxytricha trifallax有望成为用于研究在癌症发生期间染色体是如何分解和重组的模型生物。 近日,《Cell》杂志上的一项研究发现,一种生活在池塘中的单细胞原生动物Oxytricha ...
彩色细胞编码技术:可分析肿瘤单细胞
想要获得更好的癌症诊断和治疗,有可能取决于分子水平上更好地认识单细胞的能力。一项新的研究提供了一种更全面的方法分析单细胞的独特行为,利用一系列颜色来显示模式,揭示出一个细胞是否会发生癌变及其原因。 来自华盛顿大学的一个研究小组开发了一种彩色编码细胞新方法,以此阐明了100种生物标志物,在当前研究标准之上提高了10倍,帮助分析了来自培养物或组织...
谢晓亮:单细胞测序技术有望大幅增加试管婴儿成功率
今年2月底在美国佛罗里达召开的生物技术领域最有影响力的“全球基因组生物学与技术进展”(AGBT)大会上,美国科学院院士、北京大学长江讲座及千人计划教授、北京大学生物动态光学成像中心(BIOPIC)主任谢晓亮代表北大BIOPIC-北医三院生殖医学研究团队报告了一项最新的单细胞基因组扩增技术成果,首次实现了人类胚胎在植入女性子宫前的遗传诊断,该技术有望...
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