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专家访谈
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单细胞测序,解密小RNA分子的未知功能
随着科研人员对各种遗传疾病和癌症的深入挖掘,单细胞基因组方法捕获的信息变得越来越重要。卡罗林斯卡学院( Karolinska Institute)的研究人员近日公布了一种新方法,这种方法可以读取个体胚胎干细胞中短的、非编码RNA序列,有助于人们更好地理解基因如何调控不同细胞类型的发展。相关结果以《Single-Cell Sequencing of the Small-RNA ...
Cell:单细胞分析重大突破!利用世界上最小的纳米注射器提取单个活细胞的内含物
生物学家对单个细胞的行为而不是对整个细胞群体的行为越来越感兴趣。在一项新的研究中,来自瑞士联邦理工学院(ETH)的研究人员开发出一种新方法可能引发单细胞分析变革。这一技术利用世界上最小的注射器来对单个细胞的内含物进行取样以便进行分子分析。相关研究结果发表在2016年7月14日那期Cell期刊上,论文标题为“Tunable Single-Cell Extraction for M...
Science:最大规模的人脑单细胞测序计划首获成功,大力推动脑部疾病个体化诊疗
2016年6月24日,一项发表在在线出版的Science杂志上的研究开发了首个大规模高效方法用于人类大脑神经性元不同亚型的鉴定,奠定了“绘制”人脑神经元细胞基因活性方法的基础;同时,可以帮助我们更好的理解人脑正常功能及疾病异常,包括阿尔茨海默氏症、帕金森症、精神分裂症和抑郁症等。此篇论文的通讯作者是来自美国加州大学圣地亚哥分校(UCSD)的张鹍教授。 该研究通...
重磅消息: 国内学者首次在单细胞水平上追踪造血干细胞(HSC)的形成
造血干细胞(HSC)移植(常见的有骨髓移植)是治疗血液系统恶性疾病,包括白血病和一些血液遗传病最有效的途径之一,但骨髓移植对配型的要求以及供体的不足使其在临床应用中受到很大的限制。科学家们一直试图绕过这些限制,比如在体外培养HSC使其增殖,或者将其他类型的细胞(如皮肤细胞)转化成HSC,但都没能获得成功,其中最重要的原因是由于目前人们对HSC发育过程中的调控机制了解得还很不...
单细胞研究指南:测序方法大比拼
多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过,近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们,每一个细胞都是独一无二的。不同类型的细胞激活特定组合的机制,即使是同类型细胞,基因表达也会出现差异。 那么,细胞之间的哪些差异有生物学意义,哪些差异来自于技术偏好呢?要获得可靠的结果又需要研究多少细胞呢?这些问题曾经是单细胞研究(尤其是单细胞...
Cell Stem Cell发表单细胞RNA测序新成果
寨卡病毒是一种新出现的蚊媒病毒。2015年5月,巴西开始出现寨卡病毒感染疫情,这种病毒随后在美洲快速蔓延。世界卫生组织称,越来越多的证据表明寨卡病毒与小头畸形之间存有关联。针对这种疾病,目前尚无特异性治疗办法或者疫苗。最佳预防方式是采取保护措施,避免蚊子叮咬。 三月四日,Johns Hopkins大学的宋红军(Hongjun S...
单细胞研究领域发展趋势
单细胞组学研究正在经历一场突飞猛进的发展,全世界的科学家们几乎每周都会有各种研究上的重大突破,发表的高质量相关论文数量也在大幅上升。全面而科学的统计数据可以使您更轻松地了解当前单细胞基因组学和蛋白质组学的最新研究进展和发展趋势。 C1单细胞自动制备系统 世界上第一个单细胞基因组研究的自动化解决方案,C1™单细胞自动制备系统采用创新的微流体技术快速、准确地实现从捕获到制备单细...
单细胞组学在肿瘤与免疫研究中的重要性
细胞生物学是一门非常复杂的学科,特别是针对如肿瘤、免疫等复杂的生物网络或是多变的微环境,难度更是大幅增加。但即便如此,仍然有大批的科学工作者在全力以赴,希望能找到更好的治疗方法,其中肿瘤免疫治疗因有望实现个体化自身治疗,而受到越来越多的关注。 无论是抗体、DC-CIK以及新兴的CAR-T方法,寻找新的特异性表面抗原都...
单细胞组学在肿瘤与免疫研究中的应用
17世纪,在普鲁士的王宫里,大哲学家莱布尼茨在向众人宣传他的宇宙观时,曾经大胆的提出:“宇宙间没有两个东西是完全相同的”。此语一出,众皆哗然,有人立即去王宫的花园中试图找到两片完全相同的叶子,结果却令在场的所有人大失所望。事实上,不仅仅是叶子,即便微小如构成生物体的每个细胞,其形态和功能都不尽相同。 一花一世界,一叶一菩提 &emsp...
单细胞分析技术在转化医学领域的应用
细胞具有天然的异质性 异质性是细胞的天然特性之一,看似相同的一群细胞,其内部有可能存在本质的差别。这种异质性是由很多因素造成的,除了各细胞所处微环境的差异以外,更多的是细胞内在活动的一种表现;通常,细胞的异质性主要体现在以下几个方面: 在基因水平,基因组本身就存在多态性,各种突变、重组会引起不同细胞间基因组序列上的差异;此...
单细胞ATAC-seq——肿瘤表观遗传学研究的利器
人类细胞的DNA约有6英尺长,如何将这些DNA装入直径仅为5微米大小的细胞核中是细胞面临的一个巨大的拓扑学挑战。细胞的解决方案是将DNA进行不同层次的折叠形成可以调控的结构,这其中最重要和最基本的结构就是核小体,进一步再由核小体包装形成染色质[1]。 在每个细胞中组成基因组的60亿个碱基中只有小部分具有生物学活性,能与转录元件结合开始合成RNA,而剩下不活跃的DNA则被包装成高度凝聚的染...
单细胞技术新突破:在单细胞水平实现蛋白与RNA的同时检测
单细胞分析技术有很广的范畴,包括进行核酸水平检测的各种单细胞测序及PCR技术,还有进行蛋白水平检测的质谱流式等等。迥异的检测技术手段使我们很难同时对单细胞的核酸和蛋白进行高通量的检测。2015年底,随着《Nature methods》一篇文章的发表,这种情况成为了历史。 引发这一技术突破的是美国斯坦福大学的Garry Nolan实验室,他们成功的将...
透视单细胞DNA分析
人物简介: Gajus Worthington,美国Fluidigm公司创始人、CEO。 近年来, 他领导之下的Fluidigm公司将其独特的微流控芯片技术,开发了其包括C1、Biomark、Polaris等在内的单细胞分析产品线,在单细胞分析领域占有重要的一席之地。 Fluidigm公司很早就开始专注单细胞分析这...
CyTOF:以单细胞的视角重新审视生命
(原题 《Passion, Imagination & CyTOF》,斯坦福大学医学院Sean Bendall博士访谈纪要) 很容易想象Sean Bendall博士被列入全美“40 Under 40”名录(每年评选40个在各领域有突出表现的的年轻人);他曾经在斯坦福Nolan实验室任助理教授,这个实验室位于美国Palo Alto小镇,...
单细胞测序为研究免疫反应提供新方法
欧洲分子生物学实验室等机构的研究人员近日开发出一种计算方法,能够从单个T细胞的RNA测序数据中重建配对的T细胞受体(TCR)序列,将T细胞特异性与功能反应相关联。这项成果于本周发表在《Nature Methods》期刊上。 T细胞受体是T细胞表面的特异性受体,负责识别MHC所呈递的抗原。它是异源二聚体,由T细胞发育过程中的V...
干货|单细胞基因测序领域分析(包括市场分析、投资并购、案例分享)
什么叫做单细胞基因测序(Single-Cell Sequencing)? 一句话说,就是单个细胞水平上对基因组进行测序。2013年,自然杂志把年度技术授予了单细胞基因测序(Single Cell Sequencing),认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。 我们为什么要进行单细胞基因测序? ...
北大团队发展最新单细胞多重组学测序技术
单细胞三重组学测序技术(scTrio-seq) 单细胞中三种组学之间的对应关系 癌症中两个细胞亚群的DNA拷贝数差异 2016年2月23日,《细胞研究》(Cell Research)杂志在线发表了北京大学生...
国内首例“单细胞高通量基因测序+核型定位技术”试管婴儿在沪诞生
国内首位运用单细胞高通量测序联合核型定位技术对遗传性甲状腺癌致病基因RET进行筛检而生出的健康婴儿昨日诞生。 早报记者昨日从上海交通大学附属国际和平妇幼保健院(以下简称国妇婴)获悉,国内首例采用单细胞高通量测序技术的第三代试管婴儿甜甜(化名)顺利诞生。据介绍,“甜甜”的父亲患有甲状腺癌,此前接受过基因检测,将有50%的机会将...
著名学者Nature综述:单细胞测序之现状
每个细胞都是独一无二的,但我们的研究对象往往是细胞群体,忽略了这些细胞之间的异质性。正因如此,单细胞基因组学研究受到了越来越多的关注。 单细胞基因组学领域近年来发展得非常迅速,为人们揭示了复杂生物学体系的许多重要线索,包括微生物群落的生态多样性和人类癌症的基因组。一月二十五日Nature Reviews Genetics杂志...
浙大80后教授发表单细胞RNA测序研究
基因表达变异是小鼠胚胎干细胞(ESC)的一个重要特征,但人们还不清楚这背后的具体原因。 浙江大学和哈佛大学的研究人员对小鼠胚胎干细胞进行了单细胞mRNA-seq分析。他们发现,这些细胞表现出的异质性是血清培养造成的。这项研究发表在一月二十一日的Cell Reports杂志上,文章的通讯作者是浙江大学80后教授郭国骥、哈佛大学的S...
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