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从心脏病到癌症—长非编码RNA到底发挥了什么作用?
直到近几年才发现人类基因的70%是非编码RNA,非编码RNA不能翻译为蛋白质,但仍在人体中发挥重要作用。Stefanie Dimmeler是首批发现一个microRNA亚群在血管再生中发挥重要作用的研究人员之一,她最近获得了欧洲研究委员会(ERC)的ERC高级研究员资助,这使她能够对另一群非编码RNA进行相关研究。Stefanie Dimmeler相信这一群非编码RN...
改造型Cas9:RNA病毒的新杀器?
Cas9是一种特殊的核酸内切酶,已经迅速成为了基因组编辑时代的革命性的新工具。通过小的RNA作为引导序列,Cas9能够特异性结合到DNA上我们感兴趣的区域,然后切割DNA双链。 《美国科学院院刊》近期发表了一篇关于改造Cas9系统的文章。来自一种革兰氏阴性细菌(Francisella novicida)的FnCas9能够通过重编程后(即改变引导RNA的序列),能够结...
非编码RNAs的新角色
我们机体中大约70%的基因都可以为生物活性分子提供一定的蓝图,而如今研究人员通过解析一种名为非编码的RNAs就可以帮助阐明生物活性分子的功能了,非编码的RNAs并不会翻译成为蛋白质,其似乎在机体中行使着控制的作用。 研究者Stefanie Dimmeler是第一批证明micro-RNAs亚群在血管再生过程中扮演重...
食物miRNAs跨胎盘操控胎儿基因表达
在发表于《Protein & Cell》杂志上的一项新研究中,南京大学张辰宇(Chen-Yu Zhang)教授的课题组报告称,发现孕妇食物中的小分子非编码RNAs可通过胎盘转移来控制胎儿的基因表达。 MicroRNAs (miRNA)是一类长度约为22个核苷酸的非编码RNAs,其可以结合靶标信使RNAs(mRNAs)来抑制蛋白质翻译...
世界首张人类全面分泌miRNA组图谱
在一项精心设计的研究中,卢森堡大学的生物学家发现与人们的希望相违,称作为microRNAs的小分子不适合在血液样本中用于早期诊断皮肤癌,并且可能也不适用于其他的癌症类型。他们第一次分析了健康人群血清中所有的microRNAs,提供了第一张全面的人类血液样本“miRNA组”( miRNome)图谱。 为了早期发现癌症,世界各地的研究人员都在寻...
Cell惊人发现:抑癌的tRNA片段
多年来,科学家们一直对漂浮在从细菌到哺乳动物,包括人类在内各种细胞中的一些遗传物质短片段感到困惑。它们是细胞利用来生成蛋白质的一些遗传指令的片段,但由于长度太短而无法实现它们通常的用途。在本周的《细胞》(Cell)杂志上,来自洛克菲勒大学的研究人员发现了有关这些片段在人体中所起作用的一个重大线索,有可能为对抗乳腺癌开辟全新的领域。 具体说来...
多篇文章告诉我们miRNA与癌症的相爱相杀
本世纪初,科学家们第一次发现一种微小的非编码RNAs:microRNAs与癌症有关,当时来自耶鲁大学的发育生物学家Frank Slack与他的同事发现let-7 米RNA基因突变会导致细胞分裂增加。其后在2002年,另外一组研究人员又在他们的实验中发现慢性淋巴细胞性白血病样品中常见的基因缺失位于两个miRNA基因座:miR15 和 miR16上。 时隔十多年,...
Genes&Devel:科学家鉴别出可抑制致死性脑瘤癌基因表达的小RNA分子
近日,刊登在国际杂志Genes & Development上的一篇研究论文中,来自美国西北大学的研究人员通过研究发现,一种名为miR-182的小RNA分子可以抑制多形性胶质母细胞瘤(GBM)小鼠机体中的促癌基因的表达,而GBM是一类致死性难以治愈的脑瘤。 目前标准疗法药物主要是通过损伤DNA来阻断癌细胞再生,而新型方法则会阻断产生癌细胞的来源,即过表达特定蛋白的基...
科学家发现人类细胞中靶向丙型肝炎病毒的Cas9酶
来自埃默里大学的研究人员在美国国家科学院院刊发表了一篇文章,文中详细分析了来自革兰氏阴性的能抑制丙型肝炎病毒(HCV)RNA生成病毒蛋白的细菌Francisella novicida 的Cas9变异的使用。 作者认为:“这项研究强调了一种便携式,能够抑制病毒的域间方法,它可能只是Cas9介导的RNA靶向无数潜在的生物技术和医疗应用中的一个。 研究人员...
Science:科学家阐明III型CRISPR/Cas系统靶向作用RNA分子的特殊机制
近年来CRISPR技术已经迅速转变成了一种RNA编辑工具,同时其也是一种基因组编辑工具,近日,来自加利福尼亚大学的研究人员在刊登在Science上的一篇研究报告中揭示了一种特殊的蛋白质结构,其可以使得CRISPR/Cas靶向作用的RNA突变分裂单链的RNA分子。 目前已知有三种RNA引导的CRISPR/Cas系统:I型和II型...
盘点RNA序列捕获最新出炉文献(下)
上周我们一起回顾了3篇关于RNA序列捕获的研究文章,这周我们再来看3篇近期发表的文献: 1.Nat Biotechnol. 2014 Sep;32(9):903-14. doi: 10.1038/nbt.2957. Epub 2014 Aug 24. A comprehensive assessment of RNA-seq accuracy, r...
检测循环肿瘤细胞中miRNA的新技术
越来越多的证据表明,循环肿瘤细胞(CTC)中的micrornA具有诊断和预后的潜力。然而,检测却并非易事。近日,西班牙的研究人员在《Science Reports》上介绍了一种方法,能利用原位杂交检测这种小的非编码RNA。 CTC是从原发性肿瘤脱落,然后进入循环系统的一种细胞。它们到达其他的组织或器官,导致肿瘤转移。鉴于近年来CTC检测技术的进步,研究人员能够利用这些上皮细胞来监测癌症进...
Nat Bio:新单细胞mRNA测序揭示大脑皮层细胞发育的独特性
加州大学旧金山分校的研究人员利用新的单细胞分析方法研究大脑皮层细胞的独特性,识别不同细胞类型的数百个新型生物标志物,这一项成果将提高科学家们对于出现特化神经元亚型的理解。这种集中于单细胞基因活性的新方法,最终与其他单细胞技术(包括显微成像)相结合,可能会揭示脑部发育障碍的起源。相关文章发表于2014年8月3日的《Nature Biotechnology...
科学家利用微RNA修复小鼠受损心肌 有望应用到人身上
心肌修复,请找微RNA(核糖核酸)。中美科学家的一项新研究发现,给心脏病发作的小鼠注射一种微RNA分子,可以刺激小鼠心脏长出新的细胞。这种受损心脏修复法有望应用到人身上。 与其他器官不同,哺乳动物的成年心肌细胞不具备增殖能力,因而其心脏受损后不能再生。但美国天普大学、宾夕法尼亚大学和中国第四军医大学的研究人员在美国《科学-转化医学》杂志上报告说,他们发现一种名为miR302-367的微R...
盘点RNA序列捕获最新出炉文献(上)
上周末,一篇利用对lncRNA的捕获测序进行癌症研究的文章吸引了大家的眼球。其实这种针对lncRNA的捕获测序,正是利用罗氏NimbleGen最新上市的产品SeqCap RNA序列捕获探针库实现的。SeqCap RNA与传统外显子捕获测序方法几乎完全相同,然而当被捕获的文库从基因组变成了转录组,则可发现许多转录本可变剪切信息以及一些低丰度的转录本。 ...
HCV会螯合肝脏中的microRNA
洛克菲勒大学的研究人员近期报道称:最新的数据显示乙型肝炎病毒(HCV)在肝脏中扮演着螯合肿瘤抑制microRNA的角色,这为解释HCV与肝癌的关系提供了更进一步的线索。 MiR-122是一种特异性存在于肝脏中的miRNA,它与脂肪与肝脏的新陈代谢相关,但是它也被证明是HCV复制所需要的宿主因子。具体来说,病毒会富集R...
PNAS:新研究扩大了人类microRNA的数量
在公共数据库中,人类基因组产生microRNA的位置大约有1900处,而Thomas Jefferson大学的最新研究表明,这个数字将会是更加庞大的。 结果还表明,这些新的位点中,很多都是具有人类和组织特异性的,这将对疾病中miRNA的作用研究产生巨大的影响。 自从二十年前第一次发现miRNA...
不明觉厉新型生命暗物质与疾病有关 神秘暗物质的由来分析
【新型生命暗物质】非编码RNA(核糖核酸),被称为生命体中“暗物质”。日前,中国科学技术大学单革教授实验室发现一类新型环状非编码RNA,并揭示了此类非编码RNA的功能和功能机理。成果发表在国际知名杂志《自然·结构和分子生物学》上。非编码RNA是一大类不编码蛋白质,但在细胞中起着调控作用的RNA分子。 不明觉厉新型生...
Journal of Clinical Microbiology:研究人员开发出基于Simoa,用于检测登革热宿主免疫反应的实验
在这项研究中,其结果本周已经在线发表在《Journal of Clinical Microbiology》上,Tufts小组描述了基于Simoa发展的实验,其能够检测2型抗登革热IgG和IgM,并且比较了其与另外两种抗体的市售ELISA试剂盒的灵敏度。 该比较表明,Simoa方法比一种试剂盒灵敏度高1000被,其另一种高10000倍。 根据该组的说明,目前使用的ELISA抗登革热抗...
Nature子刊:新数据表明,miRNA的基因编辑与黑色素瘤的生长转移有关
尽管研究结果仅仅限于黑色素瘤,但是参与该研究的人就人员认为,这种机制也有可能在其他类型的癌症中发现。这些出现在《Nature Cell Biology》上的数据,也可能成为治疗癌症的新的靶点。 A-I编辑是RNA编辑中最常见的一种形式,其是由作用于RNA(ADAR)的腺苷脱氨酸酶的活性介导的。此类RNA编辑发生在例如miRNAs等调节RNAs中,在2013年Wistar研究所的一个团队报...
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