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专家访谈
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贝瑞和康牵手阿里云，打造基因版“本草纲目”
云计算正在成为生物医学界的“宠儿”。——8月14日，北京贝瑞和康生物技术有限公司与阿里云共同向外界宣布双方达成合作，共同打造以海量的中国人群基因组数据为核心的数据云，实现对个人基因组数据的精准解读。 此次，双方共同合作的“神州基因组数据云项目”将首先聚焦于基因组大数据在云平台上的批量计算、分析、存储，进而在基因大数据领域共同进行前沿探索。 “打造基因组大数据，相...
印度打造世界最大生物识别数据系统
据印度时报载，印度身份证管理局（Unique Identification Authority of India，简称UIDAI）开展的身份识别项目（Unique Identification Project）（又称Aadhar计划），已完成对8.2亿人的生物识别数据采集工作，该项目已成为全世界最大的生物识别数据项目，覆盖了印度67%的人口。数据表明，美...
美国埃默里大学科学家因数据重复被撤一篇论文
据Retraction Watch网站消息，因论文数据重复，《国际癌症杂志》撤销了美国埃默里大学ShouWei Han一篇论文。 该论文主要研究人类肺癌细胞中的信号通路。《国际癌症杂志》发出通告称，经过调查，发现论文中数据出现重复，并认定这些错误是由第一作者兼通讯作者ShouWei Han造成的。共同作者Jesse Roman...
科学家开发出新型技术平台用于数据分析 或加速科学研究
发表在国际杂志Genome Biology上的一篇研究论文中，来自辛辛那提儿童医学研究中心的科学家们通过研究开发了一种人性化的一体化平台，该平台可以帮助分析转录组及表观遗传组的“大数据”；研究者表示这种名为BioWardrobe的新型平台可以帮助生物医学研究者回答基本生物学和疾病的相关基本问题。 基于新一代测序技术的方法可以帮助分析基因表达、染色质结构及蛋白-DNA的...
实验室库存管理从文件夹走向定制数据库
研究人员至少应对这样一件事有信心：他们不会再对实验室资源茫然无知了。 当Marilyn Goudreault收到申请使用被储存在其管理的加拿大多伦多Lunenfeld-Tanenbaum研究所实验室中的质粒的单据时，人们对于她能否兑现，从未有任何疑问。分享试剂是在同行评议期刊出版论文的先决条件，并且对于科学过程十分重要。但首...
阿尔茨海默病数据之争更加扑朔迷离
上个月，在6月USC诱惑Aisen离开UCSD之后，UCSD起诉USC和阿尔茨海默病的研究员Paul Aisen 阴谋霸占来自ADCS的数据，因为在预期中，他负责的UCSD项目将获得5500万美元的联邦资助。在7月31日，Aisen和USC提起交叉诉讼，对大学队Aisen的离职反应发表了申明，表示这是诽谤，且违反了加州宪法。 &em...
NIH发布新型基因组数据的共享网站
NIH上周宣布，他们已经建立了一个网络资源库，该资源库可以提供额外的信息用以实现基因组数据的共享政策，而且该数据库在今年早些时候已经开始启用了。 2014年中期，NIH就宣布了一项预期性的制定政策，该政策主要目的就是将来自资助机构研究所得的大规模的人类和非人类的基因组研究数据进行合理地共享。 NIH研...
医学实验领域囤积数据，导致没法检验研究
同行评审和重复检验是科学方法的关键，但在医学实验领域，制药公司的不肯放手加上科学家们害怕自己的人为错误遭受耻笑，意味着我们赖以做出生死攸关决定的原始数据被常规性地保留，意味着错误会成年累月潜伏不被发现――有时候就是永远。 以“干死制药厂”著称的Ben・Goldacre撰写文章，试图解开导致临床实验数据保密现象的错综复杂的网络，表达了对数据进行独立审核的...
响应“精准医疗”FDA要建立基因大数据共享平台！
随着奥巴马政府精准医学计划的提出，个性化诊断、基因测序等概念又一次变得炙手可热。然而，随着技术的日趋成熟，众多检测方法对FDA提出了尽快适应形势的要求。为了与精准医学计划相呼应，FDA计划建立一个名为“精准FDA”（precisionFDA）平台。最近，著名的生物信息学公司DNAnexus公司与FDA签订了第一份合作协议，可被看做是向前迈出了重要一步。尽...
诺禾致源携手顶级基因解读公司N-of-one，引领肿瘤精准医疗进入大数据时代
2015年7月，北京诺禾致源生物信息科技有限公司（NovogeneBioinformatics Technology Co.Ltd）医学事业部宣布与美国顶级基因信息解读公司N-of-One公司（N-of-One Therapeutics, Inc.）建立长期合作关系，N-of-One为诺禾致源旗下诺易康专业版肿瘤基因检测产品提供数据解读服务。这是国内医学...
法国国家科研中心科学家因数据异常撤销一篇论文
据Retraction Watch网站消息，因论文数据异常，《PLOS生物学》撤销了法国国家科学研究中心Domenico Libri研究员一篇论文。 该论文主要研究细胞中的信号通路。《PLOS生物学》发出通告称，调查发现论文中的免疫数据出现重复。论文第一作者 Laura Cerchia及共同作者Vittorio de Franc...
食品药品监管总局召开药物临床试验数据自查核查工作电视电话会议
食品药品监管总局于2015年7月27日召开电视电话会议，部署药物临床试验数据自查核查工作。总局相关司局和直属机构、各省分管局领导和相关处室等参加了会议。总局副局长孙咸泽同志主持会议并就《国家食品药品监督管理总局关于开展药物临床试验数据自查核查工作的公告》的内容和精神进行了解读；江苏、山东和浙江省局的负责同志分别就贯彻落实本次临床试验数据自查核查工作作了交流发言。总局副局长吴...
阿里巴巴60亿增资阿里云 用于云计算大数据领域研发
29日，阿里巴巴集团宣布对旗下阿里云增资60亿元，用于国际业务拓展，云计算、大数据领域研发等。同日，阿里与用友网络达成战略合作，用友股票涨停，报41.28元。 阿里巴巴集团CEO张勇表示：“60亿投入只是开始，我们希望阿里云能不断赋予所有商家、合作伙伴新的能力，帮助所有企业升级基础设施，直接连接消费者，将数据转化为生产力，最终...
科学家呼吁便捷获取分析云端大型生物数据集
通过正确的途径进行云计算，人类基因组学界将为在许多领域中与大数据战斗的研究者铺平道路。 谷歌云服务是分析大型基因数据集的研究人员使用的工具之一。 图片来源：KeystoneUSA-ZUM 以前，人类基因组学研究人员总被获取巨大数据集的挑战阻碍；今年年初，当研究人员看到原来的主要路障消失后，该研究领域为此集体欢呼。今年3月，美国国立卫生研究院（...
致科学家们：你们是要用保密的临床数据召唤神龙吗？
同行评审和重复检验是科学方法的关键，但在医学实验领域，制药公司的不肯放手加上科学家们害怕自己的人为错误遭受耻笑，意味着我们赖以做出生死攸关决定的原始数据被常规性地保留，意味着错误会成年累月潜伏不被发现――有时候就是永远。 以“干死制药厂”著称的Ben・Goldacre撰写文章，试图解开导致临床实验数据保密现象的错综复杂的网络，表达了对数据进行独立审核的急迫。 ...
生化学家启动众包网站抵制错误数据
根据7月21日一个国际专家小组发布的报告，寻找设计和测试新药的生化学家经常被海量不合格数据困扰。这个由非营利机构、大学以及生物技术和制药公司等46家机构组成的专家组说，他们正在筹建一个类似旅行顾问网站的众包窗口，以解决他们认为处于问题核心的最新化学探针信息。 近年来，错误化学探针发展势头迅猛。这些类似药物的小分子主要用于阻止生物化学中决定特定...
食药总局整肃药物临床造假：5000元能买到申报资料，涉及103家上市公司
在整顿完中药饮片、银杏提取物、生化药等之后，国家食品药品监督管理总局(下称“CFDA”)又盯上了排队审批的药品和药物临床试验数据。 7月22日，一则监管部门要求各药企进行药物临床试验数据自查的消息，引起行业巨大震动。此次自查涉及到国内103家医药上市公司，占医药股上市公司总数将近一半。 业界人士认为，这次药物临床试验数据自查，不只是让一些企业自动退出，减轻...
国家食品药品监督管理总局关于开展药物临床试验数据自查核查工作的公告
为落实党中央、国务院用“最严谨的标准、最严格的监管、最严厉的处罚、最严肃的问责，确保广大人民群众饮食用药安全”的要求，从源头上保障药品安全、有效，国家食品药品监督管理总局决定对附件所列已申报生产或进口的待审药品注册申请开展药物临床试验数据核查。有关事宜公告如下： 一、自本公告发布之日起，所有已申报并在总局待审的药品注册申请人，均...
汤森路透是如何玩转转化医学大数据的
汤森路透（Thomson Reuters，图1）于2008年4月17日成立，是由加拿大汤姆森公司(Thomson Corporation)与英国路透集团(Reuters Group)合并组成，总部设在美国纽约。 提起汤森路透，很多人第一反应是这是一家信息和媒体公司， 大多是由于其旗下大名鼎鼎的的路透社所致。汤森路透的业务主要集中在金融、法律、税...
一博士后被发现在HIV研究论文中篡改数据
据Retraction Watch网站消息，美国洛克斐勒大学艾滋病研究中心博士后Julia Bitzegeio承认在已发表的《病毒学杂志》中篡改数据。 该论文主要研究干扰素对人类和类人猿免疫缺陷病毒的作用。美国科研诚信办公室发布声明称，经调查研究，Julia Bitzegeio在《病毒学杂志》论文中篡改数据，同时发现在另外一份未发表的手稿中也...