Cell重磅研究!王广川/陈洛南&广州国家实验室景乃禾团队开发新型空间多组学技术平台,系统揭示肿瘤抑制基因缺失如何重塑肿瘤微环境
| 导读 | 未来,针对不同微环境亚型设计联合疗法将成为可能。
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近日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心王广川/陈洛南&广州国家实验室景乃禾团队在国际顶尖期刊《Cell》发表一项突破性研究,研究团队开发了名为CLIM-TIME的新型空间多组学技术平台。该平台首次实现了在空间分辨率下系统揭示肿瘤抑制基因缺失如何重塑肿瘤微环境,并调控免疫应答,成功鉴定出关键的微环境调控因子,为改善T细胞疗法在转移性肿瘤中的疗效提供了全新策略。

图形摘要
技术突破:CLIM-TIME平台实现微环境的高通量、空间解析式筛选
研究团队开发的CLIM-TIME平台,创新性地将CRISPR基因编辑筛选与激光捕获显微切割技术相结合,并对转移性肿瘤组织进行转录组、细胞解卷积及免疫荧光分析。这一技术克服了传统方法难以解析肿瘤微环境空间复杂性的局限,能够大规模、高精度地描绘不同基因扰动下肿瘤免疫微环境的动态演变图谱。
核心发现:七种转移性肿瘤微环境亚型与差异化免疫状态
利用CLIM-TIME,研究者绘制了肿瘤抑制基因缺失后的微环境空间图谱,并定义了七种截然不同的转移性肿瘤微环境亚型。研究发现,DNA修复及多梳抑制复合物相关肿瘤抑制基因的缺失,与免疫细胞浸润丰富的微环境相关,这类肿瘤对T细胞疗法更为敏感。反之,Hippo信号通路关键肿瘤抑制基因的缺失,则会驱动免疫逃逸和疗法抵抗,其塑造的微环境富含髓系细胞、排斥T细胞且细胞外基质异常沉积。
关键机制:靶向LOXL2可逆转免疫排斥型微环境
研究进一步阐明,Hippo通路失活(尤其是YAP信号激活)所导致的免疫排斥微环境,与细胞外基质交叉连接酶LOXL2的高表达密切相关。在肺癌等多种癌症的转移模型中进行验证后发现,抑制LOXL2能够有效重塑转移灶的微环境结构,显著增强T细胞的肿瘤浸润能力,从而大幅提升免疫治疗的疗效。
研究意义与未来展望
CLIM-TIME研究标志着肿瘤免疫微环境研究进入了空间化、系统化的新阶段。该研究不仅提供了一种强大的基础研究工具,更具有明确的转化医学价值。它所定义的微环境亚型为肿瘤患者的精准分型提供了新依据,而LOXL2作为逆转免疫抑制微环境的有效靶点,为临床上攻克T细胞疗法抵抗的难题开辟了新路径。未来,针对不同微环境亚型设计联合疗法将成为可能。(转化医学网360zhyx.com)
原文链接:
https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(25)01491-6
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