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中科普瑞-限时推出(3500/样本)850k芯片服务

首页 » 产业 » 快讯 2018-08-08 转化医学网 赞(4)
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导读
 Illumina InfiniumMethylationEPICBeadChip(850K甲基化芯片)服务助力科研,畅“研”一夏 3500 RMB/样本 一个样本起! 中科普瑞850K芯片服务3500 RMB豪华套餐实验服务(含)芯片实验(*不含样本抽提)基础分析(含)数据质控1.



Illumina Infinium MethylationEPIC BeadChip850K甲基化芯片服务

助力科研,畅“研”一夏

3500 RMB/样本


一个样本起!



中科普瑞850K芯片服务 3500 RMB豪华套餐

实验服务(含)

芯片实验(*不含样本抽提

基础分析(含)

数据质控

1. 样本的β值密度曲线

2. 各样本的β值箱线图

3. 样本相关性图

4. PCA图

差异筛选

1. 标准化后的甲基化位点总表

2. 差异甲基化位点(DMP)列表

3. 差异甲基化区域(DMR)列表

4. 差异甲基化位点的染色体分布图

5. 差异甲基化位点热图/散点图/火山图

功能注释

1. DMP对应基因的GO和KEGG富集

2. DMR对应基因的GO和KEGG富集

高级分析(含)

1. Functional Epigenetic Modules分析

2. 拷贝数变异分析

3. 甲基化与表达谱的关联分析(有对应表达谱数据)

高级分析

(收费项目,不含)

1. 多组学关联分析

2.  WGCNA分析

3.  EWAS分析

4. 机器学习

5.  Meta分析

6. 其它可定制高级分析


部分高级分析展示


850k芯片技术特点


1. 全面的基因组覆盖范围:检测>853,000个CpG位点,全面覆盖CpG岛、启动子、编码区、开放染色质和增强子。此外还包括CpG岛外的CpG位点,已知DMR位点,脱氧核糖核酸酶超敏位点以及miRNA启动子区域;

2. 高质量的数据:同时采用Infinium I及II探针设计,使检测范围最大化;

3. 分辨率高:单碱基分辨率,可以直接检测到发生甲基化的确切位点;

4. 重复性高: 自身技术重复相关性R2 > 0.98 ;与450K交集探针间(850K vs 450K)相关性R2 > 0.98;

5. 起始模板量低:仅需 250 ng,大大节约了样品量;

6. 检测样本类型更广:不仅可以检测全血、细胞、新鲜/新鲜冷冻的组织、而且也可检测FFPE样本。


850K芯片与WGBS参数对比


技术参数

850K芯片

WGBS

检测物种

不受限

检测原理

重亚硫酸盐转化

重亚硫酸盐转化

起始量

250 ng

2 μg

分辨率

单碱基

单碱基

检测CpG位点

>85,000

>3,800,000

是否适用于FFPE

适用

不适用

技术重复

R2>0.98

实验周期

20个工作日

30个工作日

实验费用

3.5K

10K

检测范围

已知位点

不受限

数据分析

简单

困难


联系我们:



上海鲸舟基因科技有限公司(中科普瑞科研服务控股子公司)

址:上海康新公路3399弄19号楼A区200120

线:400-8819291

话:021-58086128

Email:market@sinomics.com



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