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Molecular Health市场总监谈基因测序亲身体会

首页 » 研究 » 组学 2014-09-12 测序中国 赞(2)
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导读
进行肿瘤基因组评估对癌症治疗的前后期都有很大的帮助。但我相信很多患者,甚至是医生,都没有完全理解肿瘤测序对癌症治疗的重要性。

进行肿瘤基因组评估对癌症治疗的前后期都有很大的帮助。但我相信很多患者,甚至是医生,都没有完全理解肿瘤测序对癌症治疗的重要性。

这种情况也不足为奇。除了一些乳腺癌实验,5年前我们也没有相应的测序工具。临床实践的第一个突破性发展是在一种罕见的临床病例——转移性黑色素瘤方面的,每年大约发生1000例。20118月,我在自己的实验室里安装一台仪器,主要检测肿瘤组织是小鼠杂交瘤细胞(BRAF)阳性还是阴性它一天所产生的检测结果可以对病人的治疗产生巨大影响。

从那时起,通过检测遗传生物标记来指导靶向医疗的实体瘤数目开始增加,例如FDA(美国食品及药物管理局)通过非小细胞肺癌的EGFR标记和结肠直肠癌的KRAS标记。

目前FDA通过的正在申请的单基因检测已经不能满足靶向医疗的需求了。假设肺癌不是由EGFR基因突变引起的,你会立马想知道是不是ALK基因突变引起的,还是ROS, MET, PIK3CA等基因突变引起的。在诊断检测中我们开始考虑多个基因标记,而不是几个特定的分子标记。

 

进行肿瘤组织测序可以指导我们选择正确的治疗过程。但是很多医生只有在迫不得已时才选择肿瘤组织测序,比如肿瘤在常规医疗没有反应或者发展成恶性肿瘤时。基因检测还是一个有争议的话题。

争议性的问题:

1临床争端。临床医生通常不需要提前知道太多的信息,因为太多的信息会使治疗方案复杂化。作为一个医生,你必须对你知道的所有信息负责。通过综合性检测获取肿瘤的所有遗传信息是很好,但是临床医生要分析筛选出有用的治疗信息。一次性知道太多没用的信息,对临床治疗并没有好处。即将有在线的分析工具辅助解读庞大的测序信息,还可以给临床医生提供个性化的通俗易懂的治疗流程图。

 

2医疗支付问题。保险公司开始慢慢明白支付检测费用的好处。基因检测通常被认为是昂贵的,但是它确实比常规治疗过程中连续进行CATMRI检测更便宜。我想支付方会很快明白综合性的基因检测是省钱的,生物标记法可以避免常规医疗中不必要的甚至对病人有害的消费项目。

对于基因检测还有一些形而上学的争论。有些人问,我们是不是对病人的基因组和遗传缺陷知道的太多了?

避免这种问题的一个方法就是设计一个靶向基因芯片,包含肿瘤形成,肿瘤治疗或者药物代谢中所有起作用的基因。如果生物标记在癌症医疗过程中不是潜在可控的,这个标记是不包含在芯片中的。

同时,临床医生需要知道肿瘤并非都是遗传的。比如药物代谢基因,是生殖细胞标记,只有在病人发生病变的生殖细胞中才能检测到。最近的一个例子是,病人结果对G6PD基因检测显示阳性。这个信息对病人主治医生都很有帮助,因为这个生物标记被预测对氧化剂有不良反应,一些药物含有高氧化性的物质。临床医生治疗能通过计算分析提供一些靶向分子治疗,还可以告诉病人这个G6PD基因是遗传得来的

有时候一个靶向基因芯片并不够。一个临床医生提过这样一个案例,他的病人问他,为什么她对现在用的药物没有反应,以及一些她的癌症相关的问题。她的基因信息的计算分析显示,她有一个V Leiden 基因突变,这使得目前药物治疗没有作用。很全面的基因信息对临床诊断非常有用,但是多的靶向基因芯片不能鉴定这些问题,因为基因芯片不包含与癌症无直接关系的基因。

我们对癌症基因检测的认识在快速增长,所以我设想这些争论的问题会很快被解答。癌症基因检测有利于分析指导癌症医疗,所以我建议癌症患者在做癌症诊断时都应该做个肿瘤基因组测序。

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