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【PNAS】小鼠模型中使用新传感器,两小时准确区分病毒性和细菌性肺炎!

首页 » 《转》译 2022-06-14 转化医学网 赞(3)
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导读
许多不同类型的细菌和病毒都可以引起肺炎,但没有简单的方法来确定哪种微生物引起特定患者的疾病。这种不确定性使得医生更难选择有效的治疗方法,因为通常用于治疗细菌性肺炎的抗生素不会帮助病毒性肺炎患者。此外,限制抗生素的使用也是遏制抗生素耐药性的重要一步。近期,麻省理工学院的研究人员现在设计出一种传感器,可以区分病毒性和细菌性肺炎感染,他们希望这将帮助医生选择合适的治疗方法。

研究的资深作者Sangeeta Bhatia说:“挑战在于,有很多不同的病原体可以导致不同种类的肺炎,即使是最广泛、最先进的检测,也无法在大约一半的患者中鉴定出引起疾病的具体病原体。如果你用抗生素治疗病毒性肺炎,那么你可能会导致抗生素耐药性,这是一个大问题,患者不会好转。”

在一项对小鼠的研究中,研究人员表明,他们的传感器可以在两小时内准确区分细菌性和病毒性肺炎,只需利用简单的尿检读取结果。

研究“Host protease activity classifies pneumonia etiology”发表在本周的《Proceedings of the National Academy of Sciences》上。

https://www.pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.2121778119

感染体征

很难区分病毒性和细菌性肺炎的一个原因是,有非常多的微生物可以引起肺炎,包括细菌肺炎链球菌和流感嗜血杆菌,以及病毒如流感和呼吸道合胞病毒(RSV)。

在设计传感器时,研究团队决定专注于测量宿主对感染的反应,而不是试图检测病原体本身。病毒和细菌感染会引起不同类型的免疫反应,其中包括激活蛋白酶。麻省理工学院的研究小组发现,这些酶的活性模式可以作为细菌或病毒感染的标志。

人类基因组编码超过500种蛋白酶,其中许多被用于应对感染的细胞,包括T细胞、中性粒细胞和自然杀伤(NK)细胞。由斯坦福大学医学和生物医学数据科学副教授、论文作者之一Purvesh Khatri领导的研究小组收集了33个在呼吸道感染期间表达的公开基因数据集。通过分析这些数据,Khatri能够鉴定出39种蛋白酶,这些蛋白酶似乎对不同类型的感染反应不同。

Bhatia和她的学生们利用这些数据创建了20种不同的传感器,可以与那些蛋白酶相互作用。传感器由包被有肽的纳米颗粒组成,肽可以被特定的蛋白酶切割。每个肽都用一个报道分子标记,当肽被感染中上调的蛋白酶切割时,报道分子被释放,最终经尿液排出。然后可以用质谱分析尿液,确定哪些蛋白酶在肺部最活跃。

研究人员在五种不同的肺炎小鼠模型(肺炎链球菌、肺炎克雷伯菌、流感嗜血杆菌、流感病毒和肺炎病毒的感染引起)中测试了他们的传感器。

在读出尿液检测的结果后,研究人员利用机器学习来分析数据。使用这种方法,基于这20个传感器,他们能够训练可以区分肺炎与健康,也可以区分感染是病毒性还是细菌性的算法。

研究人员还发现,他们的传感器可以区分他们测试的5种病原体,但准确性低于其区分病毒和细菌的测试。可能研究人员追求的是开发的算法,不仅可以区分细菌和病毒感染,还可以识别引起细菌感染的微生物类别,这可以帮助医生选择对抗这类细菌的最佳抗生素。

反应模式

在他们的研究中,研究人员还确定了宿主对不同类型感染的一些反应模式。在细菌感染的小鼠中,中性粒细胞分泌的蛋白酶更突出,这是可以预期的,因为中性粒细胞往往对细菌感染比病毒感染反应更大。

而病毒感染则激发了T细胞和NK细胞的蛋白酶活性,通常对病毒感染的反应更大。其中一个产生最强信号的传感器与一种称为颗粒酶B的蛋白酶相关联,颗粒酶B触发程序性细胞死亡。研究人员发现,这种传感器在病毒感染的小鼠肺部被高度激活,并且NK细胞和T细胞都参与了反应。

为了在小鼠体内放入传感器,研究人员将它们直接注射到气管中,他们现在正在开发用于人类的版本,可以使用雾化器或类似于哮喘吸入器的吸入器给药。他们还在研究一种使用呼吸分析仪而不是尿检来检测结果的方法。(转化医学网360zhyx.com)

参考资料:

https://phys.org/news/2022-06-nanoparticle-sensor-distinguish-viral-bacterial.html

注:本文旨在介绍医学研究进展,不能作为治疗方案参考。如需获得健康指导,请至正规医院就诊。

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