【Science】剑桥大学的研究人员发现了癌症新的突变特征！或可找到某些癌症的致命弱点

周五（4月22日），该研究团队在《Science》上发表了研究成果，题为“Substitution mutational signatures in whole-genome–sequenced cancers in the UK population”。研究人员根据英国国家医疗服务体系（NHS）基因组医学中心提供的样本，收集了15800多个能匹配100kGP肿瘤和正常样本的全基因组序列数据，并且重点关注了患有19种癌症类型的11585名英格兰基因组参与者中的12222个序列。

https://www.science.org/doi/10.1126/science.abl9283

他们还研究了国际癌症基因组联盟(ICGC)记录的另外3,001例病例的基因组序列数据，以及Hartwig医学基金会评估的3,417例转移性癌症病例的基因组序列数据。

在识别体细胞突变的生物信息学帮助下，该团队追踪并分析了肿瘤中每个受影响位点的数亿个DNA序列替换、小的插入或缺失，以及重排，在肿瘤中发现了82个单碱基替代突变特征和27个双碱基替代特征。

剑桥大学临床医学院及其早期癌症研究所的医学遗传学研究员，该研究的第一作者Andrea Degasperi在一份声明中说：“每一种癌症都有无数个突变，我们有前所未有的技术，可以从NHS的患者中寻找到共性和差异，在这一过程中，我们发现了58个新的突变特征，这拓宽了我们对癌症的认知。”

研究人员表示，这一新发现包括之前未报道过的40个由单碱基替代标记的突变特征，以及18个涉及双碱基替代的新突变特征。总之，这些突变特征能反映所有可能性，从过去认为的接触突变原，如吸烟、紫外线、铂化疗或马兜铃酸等，到DNA修复或其他细胞过程中的内源性错误。

突变特征也提供了一种更为罕见的，可以反映肿瘤组织起源的特征。虽然出现了一组共同的突变特征，但该团队注意到，不断增加的样本量提高了对相对罕见的突变特征的检测率。

此外，尽管有一些共同的突变因子，突变特征还是为肿瘤起源部位的特异性提供了视角。在100kGP、ICGC和Hartwig医学基金会样本群体的16种组织类型中，作者指出,“比起其他组织类型，不同群体同一个器官的特征要更加相近，这表明每个器官的突变特征是可高度复制的。而且，不同群体同一个器官的特征具有组织特异性，无论测序平台还是突变调用算法都能检测到。”

他们认为，检测突变特征有助于开发尚未发现的治疗靶点、治疗策略和疾病管理方案，这可以推动一种为有效揭示肿瘤突变特征的“特征匹配多步骤”(FitMS)新算法的开发，该算法在100个模拟基因组序列中进行了测试，这些序列包括在乳腺癌中发现的几种常见或罕见的单碱基替代特征。

该研究的资深作者、剑桥大学和剑桥大学医院的基因组医学和生物信息学研究员Serena Nik-Zainal指出，突变特征“可以突出特定药物靶向的异常，或者可以表明个别癌症潜在的致命弱点”。（转化医学网360zhyx.com）

参考资料：

https://www.genomeweb.com/sequencing/new-mutational-signatures-detected-cancers-profiled-uks-100k-genomes-project#.YmStlu1ByUk

注：本文旨在介绍医学研究进展，不能作为治疗方案参考。如需获得健康指导，请至正规医院就诊。