Nature子刊:测序应该作为儿童遗传疾病的一线诊断工具

遗传疾病（单基因疾病、基因组结构缺陷和拷贝数变异）是导致10岁以下儿童死亡的主要原因。一项新的分析显示，对于遗传疾病儿童的检测，全基因组测序（WGS）和全外显子组测序（WES）比染色体微阵列（CMA）具有更大的诊断和临床价值。美国圣地亚哥Rady儿童医院基因组医疗研究所的研究人员建议，测序应该被视为遗传疾病的一线诊断工具。

新兴诊断工具

目前，染色体微阵列被推荐用于某些遗传疾病的儿童的一线基因组检测。然而，近年来，全基因组测序和全外显子组测序已经成为更常见的检测方法。在疑似遗传性疾病患儿中建立病因诊断，对于及时实施精准医疗和最佳诊疗结果至关重要，特别是在指导重大的临床决策方面。目前除了少数遗传性疾病（如染色体非整倍体）在出生时有病理发现外，病因诊断需要确定病因分子基础。

而在实践中，这是非常困难的。主要是以下几个原因，首先是遗传的异质性，有超过5200种遗传疾病已经建立了分子基础。其次，婴儿的临床异体遗传疾病的表现形式往往是对年长儿童的典型描述。第三，在患有遗传疾病的婴儿中，并发症是常见的，包括早产、出生创伤和脓毒症的临床表现。第四，大约4%的儿童有不止一个基因诊断。最后，疾病在儿童中的进展速度更快，诊断就是和时间进行赛跑。

目前CMA被推荐用于患有多种遗传性疾病的儿童一线诊断工具。在过去五年里，WGS和WES开始广泛应用于疑似遗传性疾病的婴幼儿的病因诊断。及时的分子诊断，或可为儿童的遗传疾病建立一个新的精准医学时代。

更大的临床价值

研究人员对PubMed网站进行了筛选，发现了2011年1月至2017年8月间发表的37项研究，其中包括20,068名儿童，并对WGS和WES与CMA相比的诊断效用进行了评估。

Clark和她的同事报告说，在这些研究中，WGS综合诊断效用为0.41，在质量上比WES(0.36)或CMA(0.10)要大。

当研究人员将WES和WGS放在一起，将它们与CMA进行比较时，他们发现，通过测序方法得到诊断的几率是CMA的8.3倍。这表明，WGS/WES应被认为是对疑似遗传病儿童的一线诊断工具。

当然，研究人员也指出，WGS的价格是WES的两倍，WES本身的价格是CMA的两倍。而且，这项研究受限于已发表的诊断率、无法控制异质性，以及一些进行测序的儿童以前曾接受过CMA分析。（转化医学网360zhyx.com）