2016晶能生物生物信息培训班报名啦！

日期

时间

主题

课程内容

6月16日

上午

linux基础

1．Linux简介

2．Linux发展史

3．主流发行版

4．文件系统

5．常用软件

6．常用命令

下午 

基因组研究基本思路、数据库

1.   基因组测序概念介绍

2.   基因组数据分析数据库介绍

3.   非肿瘤疾病基因组测序案例介绍

基因组测序基本分析方法

1．测序数据质控

2．基因组比对

3．变异检测及注释

4．常用数据库介绍

6月17日

上午

R语言基础与数据可视化

1. 基础介绍

2. 数据操作

3. 包的介绍和安装

4. 统计检验

5. 绘图基础

6. ggplot2使用方法

下午

GWAS应用介绍、数据库

1. GWAS 背景知识及常用数据库介绍

2. 文章解读

3. GWAS方案设计

GWAS分析方法1

1. 如何看懂GWAS文献中的图表 

2. GWAS质控方法介绍

3. GWAS分析基本操作

6月18日

上午

Python-1

1. Python概述、简史、现状以及Python哲学

2. 搭建Python应用开发环境

3. 上手交互式SHELL

4. 文本编辑器和IDE-选择合适的开发工具

Python-2

1. 函数定义及特点

2. 函数的调用及返回值

3. 实现简单的函数

4．网络爬虫原理和演示

下午 

专家分享：GWAS研究

1.利用GWAS找出与前列腺癌相关的易感性位点

2.基于GWAS找到的易感位点，对人群进行前列腺癌的风险评估

GWAS分析方法2

1. GWAS应用中其他分析方法介绍和操作演示（低深度基因型推断、基于基因的关联分析、CNV关联分析）

2. GWAS方案总结

6月19日

上午

肿瘤研究策略、数据库

1.肿瘤背景知识及常用数据库）介绍

2. 肿瘤驱动文章解读

3.肿瘤项目方案设计

专家分享：肿瘤研究

基于高通量组学的数据挖掘在肿瘤转化科研中的应用

下午 

肿瘤研究分析方法

1.   样本交叉污染评估

2.   识别体细胞突变

3.   识别体细胞结构变异

4.   驱动基因预测

专家分享：论文写作

利用GEO数据库写SCI论文

答疑