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贝瑞和康:用基因测序技术开启液体活检新纪元

首页 » 产业 » 行业 2015-09-23 转化医学网 赞(15)
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导读
二代测序技术的迅猛发展给临床医学不断带来革命式的发展,最为人们所熟知的无创DNA产前检测让临床医生用前所未有的方式实现了胎儿遗传病的精准检测。而在刚刚结束的CSCO学术年会上,将无创DNA产前检测引入中国的第一人--贝瑞和康周代星博士,又一次给临床医学带来惊喜,这次是全新的肿瘤分子诊断技术--液体活检。

  二代测序技术的迅猛发展给临床医学不断带来革命式的发展,最为人们所熟知的无创DNA产前检测让临床医生用前所未有的方式实现了胎儿遗传病的精准检测。而在刚刚结束的CSCO学术年会上,将无创DNA产前检测引入中国的第一人--贝瑞和康周代星博士,又一次给临床医学带来惊喜,这次是全新的肿瘤分子诊断技术--液体活检。

  cSMART--环化单分子扩增与重测序技术,是贝瑞和康独立研发、拥有国际知识产权的核心技术之一。cSMART技术通过对肿瘤患者外周血中游离DNA片段进行标记、环化、反向PCR扩增和高通量测序,以独特的方式进行计数,能够实现对血浆中ctDNA的绝对定量检测,灵敏度达1/10000,可以满足片段化、低含量、低比例ctDNA检测的要求,在扩增过程中通过使用多组引物进行多重反向PCR扩增,又可同时检测多基因、多位点突变。以cSMART技术为核心的昂科益肿瘤分子检测,可以实现无创式肿瘤分子诊断,克服传统方法中存在的取样困难、无法进行动态实时检测及肿瘤异质性问题等弊端。

  在本次CSCO卫星会上公布的数据中,北京医院的王征教授展示了cSMART技术在肺腺癌ctDNA检测中的最新数据:103例同一时间获取的配对血液及组织细胞学标本,分别经cSMART技术进行ctDNA检测和经ARMS-qPCR进行分子诊断,检测范围包括EGFR、KRAS、BRAF、ALK、TP53、HER2等基因所有热点区域,将检测结果进行一致性对比后的数据结果显示,以cSMART技术进行血液样本ctDNA检测的结果与组织细胞学样本分子诊断结果具有非常高的一致率,以EGFR基因L858R突变为例,cSMART技术的灵敏度可达96%,而特异性和总符合率分别高达100%和99%。
  对比试验还发现,在检测中加大血浆样本量能够有效提高检测的灵敏度,这对将cSMART技术应用于肿瘤的早期诊断具有重要的指导意义。在对血液样本进行ctDNA检测中,cSMART技术可以准确检测到血浆中比例低至1/10000水平的突变,为在肿瘤靶向药物治疗过程中提早发现耐药性突变提供可靠的基础,使患者能够在影像学提示耐药前就调整治疗方案。譬如,EGFR基因的T790M突变是引起第一代EGFR TKI药物耐药的重要突变,通常认为该突变是继发性耐药突变,但在本研究公布的数据显示,T790M突变也以极低含量的形式存在于未经治疗的患者外周血中,配对组织细胞学样本常难以检测到,这说明T790M也可能以原发性突变的形式存在,并且受肿瘤异质性影响,传统技术检测存在困难,而cSMART技术则能克服以上困难,为选择最佳药物治疗方案提供依据。

  此外,在对患者进行随访的过程中发现,血液中ctDNA突变比例高于10%的患者,靶向治疗疗效评价均为PR(Partial Response,部分缓解);而突变比例低于5%的患者仅有11.1%疗效评价为PR,其余为SD(Stable Disease,病情稳定)或PD(Progressive Disease,疾病进展),这表明血液中ctDNA丰度可能与靶向治疗的疗效密切相关,对于这一发现,王征教授表示,虽然目前这只是一个初步的结果,但随着研究的深入,其临床意义将更加明确。

  杭州市第一人民医院张仕蓉博士分享的cSMART技术在组织检测中的结果,同样展现了超乎预期的高符合率,184例FFPE样本分别经cSMART技术和ARMS-qPCR技术检测,并对比二者结果的一致性,以EGFR基因L858R突变为例为例,cSMART进行FFPE样本检测的灵敏度、特异性和总符合率分别高达100%、99.4%和99.5%,而其他基因位点检测符合率也均达到令人满意的结果,且其中不一致的样本多为超出ARMS-qPCR技术检测范围或灵敏度极限所致,cSMART技术则完美解决这一技术瓶颈。因此,以NGS和cSMART技术为基础的昂科益肿瘤分子检测甚至能够覆盖传统技术以外的突变位点,并且能够检测组织样本中极低比例的突变,为肿瘤分子诊断打开更宽阔的视野。
  靶向药物治疗是目前国际公认的最为有效的肿瘤治疗手段,精准的肿瘤分子诊断则是实现有效靶向药物治疗的前提。应用贝瑞和康独创的cSMART技术进行ctDNA检测,可以在无创取样的条件下实现多基因、多位点精准的绝对定量实时检测,为靶向药物选择提供依据,同时在治疗过程中对肿瘤负荷进行监测,判断疗效,并及时发现基因耐药性突变,及时调整治疗方案。目前,该技术已经成功应用于非小细胞肺癌的检测,预计未来将有更多的癌种借助该技术平台进行ctDNA检测,而cSMART技术将率先开启液体活检新纪元。
(转化医学网360zhyx.com)


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