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新方法:将基因组学推向个体化的肿瘤治疗

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导读
基础医学公司(Foundation Medicine)和纪念斯隆-凯特琳癌症中心(Memorial Sloan-Kettering Cancer Center)在本月宣布结成伙伴关系,共同努力将基因组学推向临床,将分子信息转化到个体化肿瘤治疗中。 基础医学公司是一家将全面的癌症基因组分析带到常规临床治疗的分子信息公司,在2012年6月,该公司...


基础医学公司(Foundation Medicine)和纪念斯隆-凯特琳癌症中心(Memorial Sloan-Kettering Cancer Center)在本月宣布结成伙伴关系,共同努力将基因组学推向临床,将分子信息转化到个体化肿瘤治疗中。

基础医学公司是一家将全面的癌症基因组分析带到常规临床治疗的分子信息公司,在2012年6月,该公司推出了第一款面向临床医生的产品——FoundationOne™分析。该产品利用下一代测序技术对来自常规肿瘤样本的癌症相关基因进行分析。所提交的分析结果报告将检测到的突变与潜在的相关治疗方案及临床试验进行了关联。

据基础医学公司表示,这项检测定价5800美元,提供全面详实的实体瘤基因组分析,并出具一份简要报告帮助医生根据患者的癌症特征选择针对性的药物,或者最适于患者的临床试验。目前已经有超过1000名医生以及15家癌症药物研发公司正在使用这项检测。

这家公司激起了投资者的极大热情。在今年1月份的B轮融资中,基础医学公司获得了1350万美元的投资,投资者包括比尔·盖茨,投资Facebook的俄罗斯富豪Yuri Milner等人。

这1350万美元的融资加上在2012年9月融到的4250万美元,B轮融资共计达到5600万美元。自2009年公司成立以来获得的总投资金额达到了1亿美元。目前,投资过基础医学公司的财团有三石风险投资公司(Third Rock Ventures)、谷歌风投(google ventures)、KPCB风险投资公司(Kleiner Perkins Caufield &Byers)、罗氏创业基金(Roche Venture Fund)、美国实验室公司(LabCorp)等。

这些投资者所看中的,可能是基础医学公司在癌症基因组学上的巨大进步,这种方法在基因组信息与临床应用之间搭建了一座桥梁。

基础医学公司表示,由于对不同肿瘤类型的的分子亚型了解的越来越多,对于医生来说要利用最新的诊断工具来指导治疗癌症患者变得越来越具挑战。随着越来越多的针对不同分子亚型的靶向疗法获得批准,用于确定患者亚型的测试的数量也在增加,也因此对常规临床取样得到的少量肿瘤组织的消耗也非常快。

尽管肿瘤学家可以通过网络(例如访问My Cancer Genome网站)来寻找与患者突变匹配的药物疗法,但是海量的信息以及对这些信息进行解读依然是令人生畏。My Cancer Genome网站(www.mycancergenome.org)成立于2年前,该网站列出了各种不同的癌症类型,以及针对不同的癌症哪些药物疗法有效,哪些无效。其中大多数的药物还处于临床试验阶段,少数已经获得美国FDA的批准。

肿瘤学家们对于这种挑战也表示认同。美国田纳西州范德堡大学(Vanderbilt University)的William Pao教授在一次接受纽约时报的采访时表示,“基因和突变的数量那么多,人脑没法记住全部的变换”。

现在有一些检测可对肿瘤的单个或多个基因异常进行分析。雅培实验室与辉瑞合作开发的一项检测可以检测出与间变性淋巴瘤激酶(ALK)基因相关的肺癌患者。

辉瑞公司的抗癌药物XALKORI(crizotinib)作为一种ALK及ROS1抑制剂,能够在短短4年内获得FDA的批准用于治疗某些非小细胞肺癌,很大部分原因是因为辉瑞可以利用所开发的检测方法筛选出最适合使用该药的患者。

越来越多的遗传学与癌症信息表明,相同药物在不同患者身上的效果并不相同。但是,一次性对每个患者的每一个遗传异常进行检测将是一件费时费力且代价昂贵的事情。像基础医学公司的平台的一个好处就是它可以同时完成这项工作。

与其他的遗传序列分析提供商所提供的检测不同之处在于,基础医学公司的检测并非去寻找特定的癌症标记,而是对经常在癌症中发生的236个相关基因的重排或改变进行分析。根据现有的科学与临床文献,这些基因在人类癌细胞中发生了改变。通过分析整个基因组,并向医生提交一份报告,告知其在患者的肿瘤中哪些是正常的哪些是异常的,基础医学公司的这种检测有望为个体化用药提供新的见解。


来源:生物探索
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