《生物医学信息学培训》课程教学大纲

大数据时代怎么充分利用数据？

怎么结合自己的数据和已有数据比较分析、充分挖掘？

怎么设计科研课题，整合多组学数据，进而形成科研论文？

生物信息学将助您一臂之力。

一、课程性质与目的

生物信息学学习班为其两天，通过本课程的学习，要求了解和掌握现有的经过收集、加工、储存的生物信息学数据库及基于数据库进行数据分析的方法，为科研数据分析提供帮助。

本次培训会教你A)基本的Linux系统应用，B)常用的生物信息学数据库(NCBI,UCSC, ENSEMBL和UniProt)的使用和查询，C)肿瘤数据库(TCGA,COSMIC和Oncomine)的检索和使用，D)高通量测序课题的设计，E)外显子测序数据（Exome-seq）和全基因组测序(DNA-seq)数据的分析，F)转录组测序(RNA-seq)数据的分析。

二、授课嘉宾

特约专家，具有12年生物医学科研经历的海归博士，在Nature、Nature Genetics、Nature Communication、BMJ和Bioinformatics等国际知名杂志发表论文60余篇，总影响因子>500，总引用次数>3000。具有丰富的DNA-seq、RNA-seq和ChIP-seq数据分析经验，主持和参与多个遗传统计分析、全基因组关联分析(GWAS)和医学统计课题，担任多本知名SCI杂志审稿。

团队成员，多年从事肿瘤功能基因组学研究，熟练掌握各种生物信息学方法，具有丰富的生物医学背景。

三、课程面向对象

对生物、医学数据分析有需求的研究人员和学生。

四、课程基本要求

通过本课程的学习，要求学生掌握生物信息学主要数据库的组织方式和实际应用，掌握运用生物信息学基本的分析方法进行生物、医学数据的分析。

五、课程教学基本内容

Day1
9:00-12:00	文献及数据下载	1.生物信息学科研论文讲解
		2.常用公共数据下载及收集
		3.基于文献差异基因分析
午间休息
13:30-17:00	基于文献数据挖掘	4.基于文献差异基因功能分析（David）
		5.基于文献差异基因功能分析（GSEA）
		6.R语言包的安装及讲解
		7.基于文献差异基因热图解读和制作
Day2
9:00-12:00	二代测序课题设计及文献导读	1.二代测序文献导读
		2.肿瘤检测文献导读
		3.二代测序课题设计
午间休息
13:30-16:30	二代测序介绍	1. DNA-seq/Exome-seq测序介绍
		2. RNA-seq测序介绍
		3. Chip-seq测序介绍
		4.现场答疑

培养学生对常用分子生物学数据的检索和信息提取能力、传统生物信息学分析方法的数据分析能力，以及随着分子生物学的发展所产生的新的高通量数据及随之发展的生物信息学分析的理解及创新思维能力，通过个人和团队的数据分析工作培养个人工作能力和团队协作能力。

六、培训概况

【培训地点】

上海交通大学医学院（上海市重庆南路280号4号楼103）

【课程时间】

2018年06月30日 - 07月01日（报名中）

【课程人数】

精品小班，每期不超过30位学员！

温馨提示：请学员携带笔记本电脑参加。

七、报名方式

微信：13720303409 （注明：培训报名）

E-mail: yzxksd@163.com

联系电话：13720303409（姚老师）

QQ：87272485（注明：培训）

八、培训费用

培训费用：4000元（费用包括教材费、培训费、上机费、午餐费）。

优惠政策：3人及以上同时报名，减免200元/人。

培训费用请尽量提前转账，现场也可接受刷卡、现金以及支付宝方式支付。

付费方式：现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称：武汉众合鑫生物医药科技有限公司

开户行:招商银行股份有限公司武汉新华路支行

账 号：127909015810801

统一社会信用代码:91420100MA4KM56M4K

（备注：在汇款明细里加上“生物信息学培训班——您的姓名+单位”）

九、交通方式

1、浦东机场—上交大医学院：地铁2号线至世纪大道站，换乘9号线至打浦桥站，出站步行500米

2、虹桥机场—上交大医学院：地铁10号线至新天地站，出站步行1000米；

3、虹桥火车站—上交大医学院：地铁10号线至新天地站，出站步行1000米；

4、上海火车站—上交大医学院：建议打车，打车费用约18元。

5、上海火车南站—上交大医学院：地铁1号线至徐家汇站，换乘9号线至打浦桥路，出站步行500米；

十、推荐住宿宾馆（住宿宾馆均可由组委会帮助预定）

1、莫泰168连锁酒店（会务组协议酒店，可帮助预定）

地址：上海黄浦区思南路113号 （步行至上课地点10分钟）

联系电话：021-51703333

收费标准：标间：322元/天，单人房：297元/天，不含早餐

2、上海交通大学医学院尔谊宾馆（校内宾馆，全新装修因此价格较高）

地址：上海市重庆南路227号

电话：021-63851650

收费标准：标间：458元/天，单人房：458元/天，均含早餐；