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Illumina与iHART合作,共同提供自闭症的基础数据

首页 » 产业 » 企业 2015-11-26 转化医学网 赞(2)
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导读
Illumina公司今天表示,其将与参加Hartwell Autism Research and Technology Initiative(iHART)的研究人员一起合作,建立一个关于自闭症谱系的开放的生物信息学基础数据库。

  具体地说,Illumina公司将从国立精神卫生研究所遗传资源数据库里面,为5000名自闭症患者和他们的家人进行基因组测序,并建立成数据库,而研究人员可以访问数据库并进行相关的分析。此外,研究人员还打算建立如Amazon RedShift的访问资源,通过大量的基础数据来探寻基因组中的数据,能够为数据分析提供相关工具和储存的方式。

  iHART是一个合作性研究,合作对象涉及斯坦福大学,纽约基因组中心,加州大学洛杉矶分校,该项目获得了900万美元的资助,这些资助来自Hartwell基金会,额外的资助则来自Simons基金会。项目的最终目标是对相关表型,蛋白质组学,代谢组学以及基因组学,大脑活动的测量和成像,肠道微生物组学,基于血液的生物标记物,医生笔记,诊断测试,潜在治疗方式等提供访问途径,这些数据是通过10000名自闭症患者和他们的家人来收集的。该平台还将进一步提供一个用户友好型的界面,为研究人员,家庭成员和其他感兴趣的个人提供访问途径。
  iHART是由Dennis Wall等人倡议的一个项目,其是斯坦福大学儿科部门的医学副教授,也是该项目的首席研究员;Dan Geschwind,加州大学洛杉矶分校的神经病学,精神病学和人类遗传学教授,也是加州大学自闭症研究治疗中心的主任。Wall和Geschwind都会直接分析相关数据;根据Illumina的说法,Wall还领导了数据整合,以及基于云技术的计算通讯平台的研发。
  “自闭症的复杂性需要像大数据科学这样的方法,其对于研究人员是一个可以公开访问,并且每个人都能进行研究的平台,”在一份申明中他们这样表示。“我们最终的希望,是通过我们的努力,帮助定义自闭症,并对其标记物的开发能够更多的帮助。”(转化医学网360zhyx.com)
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