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北大肿瘤医院《Nature》子刊发文:ctDNA可预测胃癌治疗效果
导 读:胃癌具有高度的瘤内异质性,因此想要通过解剖学、分子生物学或者细胞培养等方法准确地评估胃癌患者的化疗效果,准确性都有待提高。 近日,北京大学肿瘤医院的研究人员采集和分析了晚期胃癌患者在接受药物治疗期间,个体内ctDNA(循环肿瘤DNA)的基因组变化指标,以探究ctDNA的基因组不稳定水平变化能否用于监测晚期胃癌的药物治疗进展。 染...
DNA甲基化 |“双面间谍”或将为癌症治疗带来新思路!
作者:Echo 在DNA“字母表”中,除了四个主要碱基A、T、C、G之外,还有“第五”碱基:5-甲基胞嘧啶(5-mC),其在决定基因和其他DNA元件打开或关闭上起着不同程度的作用。毫无疑问,胞嘧啶甲基化的缺陷与发育异常、遗传疾病以及癌症有关。 最新的一项研究中,La Jolla免疫研究所的研究人员揭示了DNA的甲基化和去甲基化之间的平衡是如...
聚焦ctDNA长度,提高“滴血验癌”灵敏度!
检测90至150bp之间长度的ctDNA或可提高检测灵敏度 目前改进循环肿瘤DNA(ctDNA)检测水平的方法主要集中于从基因组方向对检测水平进行提高,但很少考虑血浆无细胞DNA(cfDNA)的生物学特性。研究人员假设可以利用循环DNA片段长度的差异来增强检测ctDNA存在的灵敏度和提高癌症的非侵入性基因组分析的水平为了确定突变ctDNA的大小分布...
基于DNA甲基化的生物年龄是乳腺癌风险的重要预测因子!
作者:Paris 导 读 近日,来自美国国家卫生研究院的科学家在线发表了一篇文章指出:基于DNA甲基化的生物年龄测量可能是乳腺癌风险重要的预测因子。该研究以“Methylation-based biological age and breast cancer risk. ”为题发表在《J...
于文强教授团队开发了全基因组DNA甲基化检测新方法,揭示肿瘤发生和转移新机制
近日,复旦大学附属上海市公共卫生临床中心、生物医学研究院双聘教授于文强团队开发了具有自主知识产权的全基因组 DNA 甲基化检测技术——导向定位测序(Guide Positioning Sequencing,GPS)。相比于 WGBS,GPS 具有覆盖率高(高达96%)、可覆盖GC-rich区域和重复序列区域。利用 GPS对正常肝细胞和肝癌细胞进行全基因甲基化测序...
PNAS:线粒体DNA遗传自父亲!不仅是母亲!
mtDNA遗传之谜 科学家在患有运动不耐受的男性患者中发现来自于双亲的mtDNA。 出现的mtDNA异质性“失误”(即mtDNA突变并不完全来源于母体)是怎么回事呢? 提这项研究前,得先解释一个词:mtDNA异质性。当细胞中mtDNA发生突变时,就会出现野生型与突变型mtDNA共存的现象,这种情况被称为mtDNA异质性。mtDN...
DNA之父因种族歧视言论被剥夺荣誉?没这么简单!
上图中的这两位,我想大家在中学教科书上就已经见过了,他们就是DNA双螺旋结构的发现者,沃森和克里克。 1962年,两人一并因为他们的发现获得了诺贝尔奖,因此两人也被称为“DNA之父”。而这老两位其中的克里克(Francis Harry Compton Crick)在2004年不幸因肠癌而过世,另一位沃森(James Dewey W...
原来年纪大了,连血液中的游离DNA片段都会改变!
我们知道,随着年纪的增长,人类的面部会出现皱纹、身体功能下降。而来自布朗大学分子生物学研究所Nicola Neretti教授领导的研究小组发现,年纪大了,连血液中的DNA都会发生改变。这些漂浮在血液中的DNA片段称为Cell-free DNA,即cfDNA,他们与年龄和健康密切相关。研究人员表示,这些差异未来可被用于明确生物的“准确”年龄,如实反映机体的健康情况。这...
重磅!《Science》子刊:非编码DNA令新型肿瘤疫苗终于奏效!
肿瘤疫苗这一概念提出已经接近50年了,但是由于各种病理生理学机制的原因,这种新型概念的抗癌“神器”一直没有奏效。 一部分研究仅能在细胞层面起作用,一部分仅对小鼠模型起作用,至今没有一款适合人类多肿瘤类型的疫苗上市。但仍有科学家坚持不懈,随着基因测序的技术不断发展,从核酸层面解决这一免疫难题的实验思路逐渐明晰。 近日,来自Mon...
靶向治疗肺癌,参与DNA甲基化,从表观遗传学水平抑制肿瘤基因表达
非小细胞肺癌是世界范围内导致癌症致死的主要杀手,应用拓扑异构酶II抑制剂依托泊苷只对一小部分患有非小细胞肺癌的病人具有良好疗效,因此,改变药物作用靶点愈来愈成为药物治疗该疾病的重中之重。之前有研究表明,EZH2能与PRC2共同作用对H3K27进行三甲基化,从而起到基因沉默的作用,因此甲基转移酶EZH2成为一个非常具有应用前景的潜在作用靶点。[1] 昨日...
癌症从何而来?DNA侦探寻觅癌症的起源!
肯尼亚西部大裂谷的半山腰上有两座坟墓。其中一个已经长满了浓密的灌木丛,向着无云的天空伸展着鲜绿的叶子。另一个是在红色泥土上放置着的白色木制十字架。它们是艾米丽的母亲和父亲的最后安息之所,他们在四年前长眠于此。 我们来此追踪一个默默蛰伏的神秘杀手。 这种杀手是鳞状细胞食管癌,这种病在60多年前开始在南...
12亿美元!DNA测序巨头Illumina将收购Pacific Biosciences - 独家首席执行官访谈
据悉,Illumina是DNA测序机的主要制造商,日前已同意以每股8美元(12亿美元)的价格收购较小的竞争对手Pacific Biosciences,以巩固其对尖端基因研究的所有权。 该交易比昨日Pacific Biosciences股票的收盘价溢价71%。这笔交易将是Illumina最大的交易,该交易在2017年的销售额为27.5亿美元,实现了价值460亿美元的市...
干货满满 | DNA甲基化最新技术进展和临床应用!
各位业界同仁: 第二届分子诊断大会DNA甲基化分论坛将于10月27日在上海市枫林路179号中山医院报告厅举行,本次论坛的目的是希望通过交流,更好的促进DNA甲基化检测在临床的应用。本次演讲嘉宾都是甲基化检测各个方面的专家,有大量的经验和教训和大家分享。 演讲内容是实实在在的干货,不是文献,不是书本理论,通过交流切实推进DNA甲基化在临床...
新型抗肿瘤DNA疫苗问世,同时靶向7个位点!
目前世界各国研究人员均在进行肿瘤特异性抗原的筛选工作,这令免疫疗法成为众多肿瘤患者的救命药物。但随着各类研究的逐渐深入,研究者发现由于较低的CD8+T细胞免疫原性、载体毒性及有限的特异性靶抗原等因素使得 抗肿瘤疫苗的研发工作进展缓慢。 来自Wistar研究所的研究人员开发了一种全新设计的DNA抗肿瘤疫苗,其研究的最新进展发表...
《自然医学》双重磅:科学家首次利用基因编辑技术在动物体内修复线粒体DNA突变,线粒体遗传病终于迎来治疗希望 | 科学大发现
今天,基因编辑技术再次迎来里程碑事件。 来自剑桥大学的研究团队和迈阿密大学米勒医学院的研究团队,背靠背在著名期刊《自然医学》上发表了两篇重要的研究论文。 他们分别使用老牌的基因编辑技术ZFN[1]和TALENs[2]成功在活体内消除了线粒体中导致疾病的突变DNA(CRISPR因为多种原因,没能拔得头筹)。 这是科学家首次...
Science | CRISPR超级大牛Doudna首次发现Cas12a的抑制蛋白
iNature Cas12a(Cpf1)是一种CRISPR相关核酸酶,对合成基因组工程,农业基因组学和生物医学应用具有广泛的应用。 虽然携带CRISPR-Cas9或CRISPR-Cas3适应性免疫系统的细菌有时获得编码抑制Cas9,Cas3或DNA结合级联复合物的抗CRISPR蛋白的移动遗传元件,但是没有发现CRISPR-Cas12a的这种抑制剂。2018年9月7日,加州大学伯克...
高光坪教授《Nature》子刊提出CRISPR无疤基因编辑:再次证明可以纠正遗传病中的DNA突变!
这一研究成果公布在8月13日Nature Biotechnology杂志上,领导这一研究的是麻省大学医学院的高光坪教授。高教授是当今全球基因治疗领域的领导者之一,他早年毕业于四川大学华西药学院,从事基因治疗研究20余年,特别是在腺相关病毒(AAV)基因治疗研究领域取得了杰出成就。文章的第一作者为王丹(Dan Wang,音译)博士。 高光坪教授 ...
肝癌早筛新宠ctDNA甲基化,筑起抗癌防线!
我国是肝癌大国,肝癌可谓我国的“国病“。但是目前肝癌的诊疗仍然面临着重大问题:早期诊断困难、复发转移率高、放化疗耐受和缺少有效治疗靶点等。 我们也都知道,对于任何癌种,早筛始终是抗击癌症的关键性一步。 肝癌早期诊断的常规监测筛查指标主要包括甲胎蛋白(AFP)和肝脏超声检查(US)。综合国内外的报道和...
利用血浆游离DNA的全基因组测序对胎儿染色体异常的产前筛查
利用孕妇血浆游离DNA检测胎儿常见染色体非整倍体(21三体、18三体、13三体)的无创产前筛查具有较高的灵敏度和特异性,已经在临床检测中普遍应用。然而,在产前诊断发现的胎儿染色体异常中,21三体、18三体、13三体等常见的染色体非整倍体只是一部分,另外还存在一些相对罕见的胎儿染色体异常。例如,研究发现,在排除常见的染色体非整倍体后,仍有5.6%至7.4%的孕妇经过...
Nature子刊:重磅!再也不怕DNA断裂了!新途径彻底解决CRISPR效率问题!
CRISPR/Cas9技术问世以来,迅速成为生物科学领域的游戏规则改变者,7月31日,第一个成功将CRISPR/Cas9搜索功能用于实践的生物技术初创公司-Mammoth Biosciences赢得了2300万美元融资,更是让CRISPR/Cas9技术进入烈火油烹的境界。然而,该技术导致双链DNA的断裂,一度成为阻碍CRISPR/Cas9技术发展的绊脚石。近日...